CSIR-中央机械工程研究所CSIR中心机械工程研究所(CSIR-CMEI)是唯一致力于机械工程的国家实验室。作为科学与工业研究理事会的组成成员,中央机械工程研究所(CMERI)的范围(CMERI)是一个专门用于研究和发展的主要机构 - 扩展了机械和相关工程领域。在印度,机械工程技术已占进口总数的一半。在产品方面,总进口价值的近三分之一是机械工程设备。为了为行业开发本地机械工程技术,以便研发可以在自力更生中发挥关键作用,西孟加拉邦杜尔加普尔的中央机械工程研究所成立于1958年2月,其特定的机械工程技术开发了特定的任务。除了在与机械工程有关的各个领域进行一线研究外,该研究所还致力于进行不同的任务模式计划,以传播适当的技术解决方案,以减轻贫困和社会改善。csir -Cmeri在年轻人和高素质专业人士的经验方面拥有一支敬业的团队,并在机械工程下为跨越各个学科的员工提供了支持。
目前,人们普遍认为,核分类学中95-96%的平均核苷酸身份(ANI)值等于70%的数字DNA -DNA杂交(DDDH)值。然而,在本研究中,对29对杏仁核类型菌株的比较基因组分析表明,基于木乃伊超快速校准工具(动画)的70%DDDH值与95-96%的ANI相对应,但大约对应于96.6%的动画价值。基于这种相应的关系,表型和化学特征,以及系统发育分析,从Cynara scolymus的根际土壤中分离出的活化细菌菌株HUAS 11-8 t受到多位分类特征的影响。基于ezbiocloud的对准,发现Huas11-8 t菌株的16S rRNA基因相似性为99.78%,而R. Rhizosphaerae JCM 32589 t,97.8%,dongchuanensis yim 75904 t和<97.8%sequence sequencesis sequence sequence and amycolaties和其他AmycoL和其他AmycOl和其他Amycol,对16S rRNA基因序列和全基因组序列的系统发育分析表明,HUAS 11-8 T菌株密切相关
从国际空间站(ISS)的不同位置分离出属于甲基杆菌科家族的四种菌株。中,三个被鉴定为革兰氏阴性,杆状,过氧化氢酶阳性,氧化酶阳性,旋转细菌,被指定为IF7SW-B2 T,IIF1SW-B5和IIF4SW-B5,而第四次则被鉴定为甲基果脂型rhododesianum。这三种ISS菌株的序列相似性(指定为IF7SW-B2 T,IIF1SW-B5和IIF4SW-B5)的序列相似性在16S rRNA基因中<99.4%,在GyRB基因中为<97.3%,近距离的甲基杆菌属甲基杆菌是Inmanylobacterium indimum se2.11 t。此外,多级别序列分析将这三个ISS菌株置于M. Infimum的同一进化枝中。这三个ISS菌株的平均核苷酸身份(ANI)值<93%,数字DNA-DNA杂交(DDDH)值<46.4%,任何描述的甲基杆菌物种。基于ANI和DDDH分析,这三个ISS菌株被认为是属于甲基杆菌属的新物种。三个ISS菌株彼此显示100%的ANI相似性和DDDH值,表明这三个ISS菌株在各个流动期间分离出来,与不同位置分离出来,属于同一物种。这三个ISS菌株在25至30°C,pH 6.0至8.0和NaCl 0至1%的温度下最佳地生长。表型上,这三种ISS菌株与水生菌和M. terrae相似,因为与其他甲基杆菌相比,它们吸收了与唯一碳底物相似的糖。nov。提出了。类型应变为IF7SW-B2 T(NRRL B-65601 T和LMG 32165 T)。脂肪酸分析表明,ISS菌株产生的主要脂肪酸为C 18:1 -ω7c和c 18:1 -ω6c。主要的喹酮为泛素酮10,主要的极性脂质为二磷脂酰甘油,磷脂酰胆碱,磷脂酰甲醇,磷脂酰乙醇胺,磷脂酰甘油醇和未识别的脂质。因此,基于基因组,系统发育,生化和脂肪酸分析,IF7SW-B2 T,IIF1SW-B5和IIF4SW-B5的菌株被分配给甲基杆菌中的一种新物种,以及Ajmalii sp的甲基甲基甲虫。
作者隶属关系:1 韩国京畿道安城市中央大学生物技术与自然资源学院食品与营养系,邮编 17546;2 孟加拉国贾肖尔科技大学遗传工程与生物技术系,邮编 7408;3 孟加拉国库什蒂亚-7003 伊斯兰大学生物科学学院生物技术与遗传工程系。 *通讯作者:Md. Amdadul Huq,amdadbge100@cau.ac.kr;amdadbge@gmail.com 关键词:Aquincola agrisoli;数字 DNA-DNA 杂交;基因组序列;计算机基因组挖掘;次级代谢产物。缩写:ANI,平均核苷酸同一性;BGC,生物合成基因簇;dDDH,数字 DNA-DNA 杂交;GBDP,基因组爆炸距离系统发育; ML,最大似然法;MLSA,多位点序列分析;MP,最大简约法;NJ,邻接法;RAST,使用子系统技术进行快速注释。菌株 MAHUQ-54 T 的 16S rRNA 基因和草图基因组序列的 NCBI GenBank 登录号分别为 MT514502 和 JAZIBG000000000。本文的在线版本提供了六个补充图和四个补充表。006355 © 2024 作者
摘要:从中央蒙古和俄罗斯(Southereasia)的低少量苏打水湖(Soda)(Siberia)中分离出革兰氏阴性,厌氧的光养分,动型,摩托车,棒状杆菌,被指定为B14B,A-7R和A-7Y。他们将层状堆栈作为光合结构,而细菌氯酚a作为主要的光合色素。发现菌株在25–35°C,pH 7.5–10.2(最佳,pH 9.0)和0–8%(w / v)NaCl(最佳,0%)下生长。在存在硫酸盐和碳酸氢盐,醋酸酯,丁酸酯,酵母提取物,乳酸,苹果酸,丙酮酸,琥珀酸和富马酸酯的情况下,促进了生长。DNA G + C含量为62.9–63.0 mol%。While the 16S rRNA gene sequences confirmed that the new strains belonged to the genus Ectothiorhodospira of the Ectothiorhodospiraceae, comparison of the genome nucleotide sequences of strains B14B, A-7R, and A-7Y revealed that the new isolates were remote from all described Ectothiorhodospira species both in dDDH (19.7–38.8%)和ANI(75.0–89.4%)。新菌株还通过缺乏所有其他外硫代刺皮缺乏的一氧化氮还原途径而在遗传上区分。我们建议将分离株分配给新物种,即牙孔lacustris sp。nov。,带有类型菌株B14b t(= DSM 116064 t = KCTC 25542 T = UQM 41491 T)。
摘要 具有木质素解聚、分解代谢或两者兼有能力的新型细菌分离物可能与木质纤维素生物燃料应用有关。在本研究中,我们旨在识别能够解决微生物介导的生物技术所面临的经济挑战(例如需要曝气和混合)的厌氧细菌。利用从温带森林土壤中接种并在缺氧条件下以有机溶剂木质素作为唯一碳源进行富集的菌体,我们成功分离出一种新型细菌,命名为 159R。根据 16S rRNA 基因,该分离物属于 Bruguierivoracaceae 科的 Sodalis 属。全基因组测序显示基因组大小为 6.38 Mbp,GC 含量为 55 mol%。为了确定 159R 的系统发育位置,使用 (i) 其最亲属的 16S rRNA 基因、(ii) 100 个基因的多位点序列分析 (MLSA)、(iii) 49 个直系同源群 (COG) 结构域簇和 (iv) 400 个保守蛋白质重建了它的系统发育。分离株 159R 与枯木相关的 Sodalis 行会密切相关,而与采采蝇和其他昆虫内共生体行会关系较弱。估计的基于基因组序列的数字 DNA-DNA 杂交 (dDDH)、基因组保守蛋白质百分比 (POCP) 以及 159R 与 Sodalis 进化枝物种之间的比对分析进一步支持分离株 159R 属于 Sodalis 属的一部分和 Sodalis ligni 的一个菌株。我们建议将之命名为 Sodalis ligni str。 159R (=DSM 110549 = ATCC TSD-177)。