EEGLAB 信号处理环境是目前处理脑电图 (EEG) 数据的领先开源软件。神经科学网关 (NSG,nsgportal.org) 是一个基于 Web 和 API 的门户,允许用户在美国 XSEDE 网络中的高性能计算 (HPC) 资源上轻松运行各种与神经科学相关的软件。我们最近报道了 (Delorme 等人,2019) Open EEGLAB Portal 扩展了免费 NSG 服务,以允许神经科学界使用 EEGLAB 工具环境构建和运行 MATLAB 管道。我们现在发布了一个 EEGLAB 插件 nsgportal,它可以在任何个人实验室计算机上的 MATLAB 上运行的 EEGLAB 中直接将 EEGLAB 与 NSG 连接起来。该插件具有灵活的 MATLAB 图形用户界面 (GUI),允许用户轻松提交、交互和管理 NSG 作业,以及检索和检查其结果。支持这些 GUI 功能的命令行 nsgportal 工具允许 EEGLAB 用户和插件工具开发人员构建高度自动化的功能和工作流程,包括可选的 NSG 作业提交和处理。这里我们详细介绍了 nsgportal 的实施和文档,提供了示例应用程序的用户教程,并展示了使用 HPC 与笔记本电脑处理的计算时间的比较示例测试结果。
CédricCannard 1,2,HelanéWahbeh2,Arnaud Delorme 1,2,3 1 Cent de Recherche Cerveau et Cognition(CERCO),CNRS,Toulouse III大学,法国2号大学2 Noetic Sciences(Ions)3 Swartz计算神经科学中心(SCCN),INC,UCSD,LA JOLLA,美国关键字:开放源代码,EEGLAB,EEG,EEG,ECG,ECG,PPG,PPG,HRV,QEEG,QEEG,特征分析,Hep/Hep/hep/hep/heo,hep/heo,brain heart Interplay,Heart Artifact,Heart Artifact,Heart Artifact,Heart Artifact。摘要:BrainBeats工具箱是一个开源EEGLAB插件,旨在共同分析EEG和心血管(ECG/PPG)信号。它提供了三个主要协议:心跳诱发的潜力评估,基于特征的分析和心脏伪像从EEG信号中提取。它应该帮助研究人员和临床医生研究脑力相互作用,并具有增强的可重复性和可及性。摘要:皮质和心血管系统之间的联系正在引起人们的关注,因为它们有可能对大脑和心脏功能耦合提供宝贵的见解。EEG和ECG/PPG提供了无创,具有成本效益和便携式解决方案,用于捕获实验室,临床或现实世界中的大脑心脏相互作用。但是,由于技术挑战和缺乏准则,该域中的可扩展应用程序受到限制。现有工具通常缺乏统计方法,易于使用的用户界面或大型数据集的自动功能,对于可重复性至关重要。在标准化定量脑电图(QEEG)和心率变异性(HRV)特征提取方法中进一步存在,破坏了临床诊断或机器学习的鲁棒性(ML)模型。应对这些挑战,我们介绍了Brainbeats工具箱,该工具箱是作为开源EEGLAB插件实现的,提供了一套信号处理和功能突出功能。工具箱集成了三个主要协议:1)心跳诱发电位(HEP)和振荡(HEO),用于以毫秒精度评估时锁的脑心脏相互作用; 2)QEEG和HRV功能提取,用于检查各种大脑和心脏指标之间的关联或构建基于功能的ML模型; 3)从EEG信号中自动提取心脏伪像,以消除进行EEG分析的任何潜在的心血管污染。我们提供了一个分步教程,用于在包含同时64通道EEG,ECG和PPG的开源数据集上执行这三种方法。可以通过图形用户界面(GUI)或命令行调整一系列参数以量身定制独特的研究需求。Brainbeats应该使大脑心脏的相互作用研究更容易访问和重现。
CédricCannard 1,2,HelanéWahbeh2,Arnaud Delorme 1,2,3 1 Cent de Recherche Cerveau et Cognition(CERCO),CNRS,Toulouse III大学,法国2号大学2 Noetic Sciences(Ions)3 Swartz计算神经科学中心(SCCN),INC,UCSD,LA JOLLA,美国关键字:开源,EEGLAB,EEGLAB,EEG,ECG,ECG,PPG,PPG,HRV,特征分析,心跳 - 事实/振荡电位/振荡(HEP/HEO),心脏组成部分,心脏成分供电。摘要:Brainbeats工具箱是一个开源EEGLAB插件,旨在共同分析脑血管和心血管(ECG/PPG)信号。它提供了三个主要方案:心跳诱发潜力评估,基于特征的分析和心脏伪像从脑电图中提取。这将有助于研究人员和临床医生研究脑力相互作用,并具有增强的可重复性和可及性。摘要:皮质和心血管系统之间的联系正在引起人们的关注,因为它有可能对大脑和心脏功能耦合提供宝贵的见解。当前的联合分析方法在很大程度上涉及侵入性或高成本神经影像学方法。EEG和ECG/PPG提供了非侵入性,具有成本效益和便携式替代方案,可在实验室和临床环境中进行更广泛的数据收集。然而,由于其复杂性,对这些生物信号的分析对于可扩展应用是具有挑战性的。现有的研究和工具通常在处理和统计方法,易于使用的用户界面或大型数据集的批处理处理能力方面缺乏共识,从而阻碍了可重复性。在脑电图和心脏变异性(HRV)特征提取的标准化方法中,还存在进一步的空隙,破坏了临床诊断或机器学习模型的鲁棒性。我们介绍了针对这些挑战的Brainbeats工具箱,开源EEGLAB插件提供了一套信号处理和特征 - 萃取功能的套件,这些功能符合当前的指南和建议。工具箱集成了三个主要协议:1)心跳诱发电位(HEP)和振荡(HEO); 2)EEG和HRV特征提取; 3)自动删除脑电图信号的心脏伪像。伴随着样本数据和指导,Brainbeats旨在促进大脑心脏的相互作用研究和可重复性。这个开源工具箱为研究大脑心脏相互作用的临床医生和研究人员提供了宝贵的资源,可以根据独特的研究需求量身定制。
EEGLAB 信号处理环境是目前处理脑电图 (EEG) 数据的领先开源软件。神经科学网关 (NSG,nsgportal.org) 是一个基于 Web 和 API 的门户,允许用户在美国 XSEDE 网络中的高性能计算 (HPC) 资源上轻松运行各种与神经科学相关的软件。我们最近报道了 (Delorme 等人,2019) Open EEGLAB Portal 扩展了免费 NSG 服务,以允许神经科学界使用 EEGLAB 工具环境构建和运行 MATLAB 管道。我们现在发布了一个 EEGLAB 插件 nsgportal,它可以在任何个人实验室计算机上的 MATLAB 上运行的 EEGLAB 中直接将 EEGLAB 与 NSG 连接起来。该插件具有灵活的 MATLAB 图形用户界面 (GUI),允许用户轻松提交、交互和管理 NSG 作业,以及检索和检查他们的结果。支持这些 GUI 功能的命令行 nsgportal 工具允许 EEGLAB 用户和插件工具开发人员构建高度自动化的功能和工作流程,其中包括可选的 NSG 作业提交和处理。这里我们详细介绍了 nsgportal
EEGLAB 信号处理环境是目前处理脑电图 (EEG) 数据的领先开源软件。神经科学网关 (NSG,nsgportal.org) 是一个基于 Web 和 API 的门户,允许用户在美国 XSEDE 网络中的高性能计算 (HPC) 资源上轻松运行各种与神经科学相关的软件。我们最近报道了 (Delorme 等人,2019) Open EEGLAB Portal 扩展了免费 NSG 服务,以允许神经科学界使用 EEGLAB 工具环境构建和运行 MATLAB 管道。我们现在发布了一个 EEGLAB 插件 nsgportal,它可以在任何个人实验室计算机上的 MATLAB 上运行的 EEGLAB 中直接将 EEGLAB 与 NSG 连接起来。该插件具有灵活的 MATLAB 图形用户界面 (GUI),允许用户轻松提交、交互和管理 NSG 作业,以及检索和检查其结果。支持这些 GUI 功能的命令行 nsgportal 工具允许 EEGLAB 用户和插件工具开发人员构建高度自动化的功能和工作流程,包括可选的 NSG 作业提交和处理。这里我们详细介绍了 nsgportal 的实施和文档,提供了示例应用程序的用户教程,并展示了使用 HPC 与笔记本电脑处理的计算时间的比较示例测试结果。
