EEGLAB 信号处理环境是目前处理脑电图 (EEG) 数据的领先开源软件。神经科学网关 (NSG,nsgportal.org) 是一个基于 Web 和 API 的门户,允许用户在美国 XSEDE 网络中的高性能计算 (HPC) 资源上轻松运行各种与神经科学相关的软件。我们最近报道了 (Delorme 等人,2019) Open EEGLAB Portal 扩展了免费 NSG 服务,以允许神经科学界使用 EEGLAB 工具环境构建和运行 MATLAB 管道。我们现在发布了一个 EEGLAB 插件 nsgportal,它可以在任何个人实验室计算机上的 MATLAB 上运行的 EEGLAB 中直接将 EEGLAB 与 NSG 连接起来。该插件具有灵活的 MATLAB 图形用户界面 (GUI),允许用户轻松提交、交互和管理 NSG 作业,以及检索和检查其结果。支持这些 GUI 功能的命令行 nsgportal 工具允许 EEGLAB 用户和插件工具开发人员构建高度自动化的功能和工作流程,包括可选的 NSG 作业提交和处理。这里我们详细介绍了 nsgportal 的实施和文档,提供了示例应用程序的用户教程,并展示了使用 HPC 与笔记本电脑处理的计算时间的比较示例测试结果。
EEGLAB 信号处理环境是目前处理脑电图 (EEG) 数据的领先开源软件。神经科学网关 (NSG,nsgportal.org) 是一个基于 Web 和 API 的门户,允许用户在美国 XSEDE 网络中的高性能计算 (HPC) 资源上轻松运行各种与神经科学相关的软件。我们最近报道了 (Delorme 等人,2019) Open EEGLAB Portal 扩展了免费 NSG 服务,以允许神经科学界使用 EEGLAB 工具环境构建和运行 MATLAB 管道。我们现在发布了一个 EEGLAB 插件 nsgportal,它可以在任何个人实验室计算机上的 MATLAB 上运行的 EEGLAB 中直接将 EEGLAB 与 NSG 连接起来。该插件具有灵活的 MATLAB 图形用户界面 (GUI),允许用户轻松提交、交互和管理 NSG 作业,以及检索和检查他们的结果。支持这些 GUI 功能的命令行 nsgportal 工具允许 EEGLAB 用户和插件工具开发人员构建高度自动化的功能和工作流程,其中包括可选的 NSG 作业提交和处理。这里我们详细介绍了 nsgportal
EEGLAB 信号处理环境是目前处理脑电图 (EEG) 数据的领先开源软件。神经科学网关 (NSG,nsgportal.org) 是一个基于 Web 和 API 的门户,允许用户在美国 XSEDE 网络中的高性能计算 (HPC) 资源上轻松运行各种与神经科学相关的软件。我们最近报道了 (Delorme 等人,2019) Open EEGLAB Portal 扩展了免费 NSG 服务,以允许神经科学界使用 EEGLAB 工具环境构建和运行 MATLAB 管道。我们现在发布了一个 EEGLAB 插件 nsgportal,它可以在任何个人实验室计算机上的 MATLAB 上运行的 EEGLAB 中直接将 EEGLAB 与 NSG 连接起来。该插件具有灵活的 MATLAB 图形用户界面 (GUI),允许用户轻松提交、交互和管理 NSG 作业,以及检索和检查其结果。支持这些 GUI 功能的命令行 nsgportal 工具允许 EEGLAB 用户和插件工具开发人员构建高度自动化的功能和工作流程,包括可选的 NSG 作业提交和处理。这里我们详细介绍了 nsgportal 的实施和文档,提供了示例应用程序的用户教程,并展示了使用 HPC 与笔记本电脑处理的计算时间的比较示例测试结果。
CédricCannard 1,2,HelanéWahbeh2,Arnaud Delorme 1,2,3 1 Cent de Recherche Cerveau et Cognition(CERCO),CNRS,Toulouse III大学,法国2号大学2 Noetic Sciences(Ions)3 Swartz计算神经科学中心(SCCN),INC,UCSD,LA JOLLA,美国关键字:开源,EEGLAB,EEGLAB,EEG,ECG,ECG,PPG,PPG,HRV,特征分析,心跳 - 事实/振荡电位/振荡(HEP/HEO),心脏组成部分,心脏成分供电。摘要:Brainbeats工具箱是一个开源EEGLAB插件,旨在共同分析脑血管和心血管(ECG/PPG)信号。它提供了三个主要方案:心跳诱发潜力评估,基于特征的分析和心脏伪像从脑电图中提取。这将有助于研究人员和临床医生研究脑力相互作用,并具有增强的可重复性和可及性。摘要:皮质和心血管系统之间的联系正在引起人们的关注,因为它有可能对大脑和心脏功能耦合提供宝贵的见解。当前的联合分析方法在很大程度上涉及侵入性或高成本神经影像学方法。EEG和ECG/PPG提供了非侵入性,具有成本效益和便携式替代方案,可在实验室和临床环境中进行更广泛的数据收集。然而,由于其复杂性,对这些生物信号的分析对于可扩展应用是具有挑战性的。现有的研究和工具通常在处理和统计方法,易于使用的用户界面或大型数据集的批处理处理能力方面缺乏共识,从而阻碍了可重复性。在脑电图和心脏变异性(HRV)特征提取的标准化方法中,还存在进一步的空隙,破坏了临床诊断或机器学习模型的鲁棒性。我们介绍了针对这些挑战的Brainbeats工具箱,开源EEGLAB插件提供了一套信号处理和特征 - 萃取功能的套件,这些功能符合当前的指南和建议。工具箱集成了三个主要协议:1)心跳诱发电位(HEP)和振荡(HEO); 2)EEG和HRV特征提取; 3)自动删除脑电图信号的心脏伪像。伴随着样本数据和指导,Brainbeats旨在促进大脑心脏的相互作用研究和可重复性。这个开源工具箱为研究大脑心脏相互作用的临床医生和研究人员提供了宝贵的资源,可以根据独特的研究需求量身定制。
CédricCannard 1,2,HelanéWahbeh2,Arnaud Delorme 1,2,3 1 Cent de Recherche Cerveau et Cognition(CERCO),CNRS,Toulouse III大学,法国2号大学2 Noetic Sciences(Ions)3 Swartz计算神经科学中心(SCCN),INC,UCSD,LA JOLLA,美国关键字:开放源代码,EEGLAB,EEG,EEG,ECG,ECG,PPG,PPG,HRV,QEEG,QEEG,特征分析,Hep/Hep/hep/hep/heo,hep/heo,brain heart Interplay,Heart Artifact,Heart Artifact,Heart Artifact,Heart Artifact。摘要:BrainBeats工具箱是一个开源EEGLAB插件,旨在共同分析EEG和心血管(ECG/PPG)信号。它提供了三个主要协议:心跳诱发的潜力评估,基于特征的分析和心脏伪像从EEG信号中提取。它应该帮助研究人员和临床医生研究脑力相互作用,并具有增强的可重复性和可及性。摘要:皮质和心血管系统之间的联系正在引起人们的关注,因为它们有可能对大脑和心脏功能耦合提供宝贵的见解。EEG和ECG/PPG提供了无创,具有成本效益和便携式解决方案,用于捕获实验室,临床或现实世界中的大脑心脏相互作用。但是,由于技术挑战和缺乏准则,该域中的可扩展应用程序受到限制。现有工具通常缺乏统计方法,易于使用的用户界面或大型数据集的自动功能,对于可重复性至关重要。在标准化定量脑电图(QEEG)和心率变异性(HRV)特征提取方法中进一步存在,破坏了临床诊断或机器学习的鲁棒性(ML)模型。应对这些挑战,我们介绍了Brainbeats工具箱,该工具箱是作为开源EEGLAB插件实现的,提供了一套信号处理和功能突出功能。工具箱集成了三个主要协议:1)心跳诱发电位(HEP)和振荡(HEO),用于以毫秒精度评估时锁的脑心脏相互作用; 2)QEEG和HRV功能提取,用于检查各种大脑和心脏指标之间的关联或构建基于功能的ML模型; 3)从EEG信号中自动提取心脏伪像,以消除进行EEG分析的任何潜在的心血管污染。我们提供了一个分步教程,用于在包含同时64通道EEG,ECG和PPG的开源数据集上执行这三种方法。可以通过图形用户界面(GUI)或命令行调整一系列参数以量身定制独特的研究需求。Brainbeats应该使大脑心脏的相互作用研究更容易访问和重现。
。cc-by-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2023年12月5日。 https://doi.org/10.1101/2023.09.25.559321 doi:Biorxiv Preprint
图 1. (a) ISAE-SUPAERO 的三轴运动飞行模拟器。(b) 双耳 cEEGrid 电极的定位,标有记录参考(蓝色)和 DRL(绿色)电极。右侧网格上的电极 R4a 和 R4b 未在我们的设置中记录。布局改编自 EEGLAB (v.2019.1)(Delorme and Makeig,2004)中的 cEEGrid 插件(Martin G. Bleichner,2019)。(c) 清洁和准备参与者的皮肤后,将左耳网格贴在参与者耳朵周围时的定位。(d) 带有来自 Enobio 设备的针脚的干电极(左)的图示,以及用具有硅胶稠度的固体凝胶封装的相同电极(右),以避免不适甚至疼痛。
患有特定健康状况的人,例如感觉整合障碍(SID)和自闭症谱系障碍(ASD)通常会面临巨大的挑战经验,例如对新情况的压倒性经验,如果触发的话,可以表现为超垂体和焦虑。深压已被用作减少问题的治疗方法。本研究寻求深压疗法的潜在优势,目的是采用一种新型方法来评估使用EEG使用EEG来测量大脑活动的可充气深度背心治疗的镇静作用。这项初步研究包括5个来自小学的男孩。充气和加权背心用于获得平静的效果,并且使用脑电图(EEG)测量以三个不同的阶段获得的脑活动:在(预测试前),(测试期间)3分钟,实验后(测试后1分钟)在5名受试者中获得了1分钟。使用Muse头带记录EEG信号,并使用EEGLAB进行分析。考虑了三个脑波,例如theta,alpha,beta相对带能量。与其他治疗相比,这些值对确定每种治疗的压力或焦虑水平是否显着降低至关重要。所示的统计结果,与预测试相比,相对子带能量α的后测试增加,而相对子频段能量β和theta降低。这项研究表明学生的平静作用增加。总的来说,我们的发现表明了充气背心和加权背心的潜力,作为深压疗法的宝贵工具。