3.1 M ATERIAL R ESTRICTION R EQUIREMENTS ....................................................................................................................... 9 3.2 M ATERIAL D ECLARATION R EQUIREMENTS .................................................................................................................... 17 3.3 BFR/CFR/PVC-F REE “H ALOGEN F REE ” R EQUIREMENTS ............................................................................................... 26 3.4 EPEAT SUBSTANCE REQUIREMENTS ........................................................................................................................... 26 3.5 TCO SUBSTANCE REQUIREMENTS ............................................................................................................................... 27 3.6 T AIWAN G REEN M ARK SUBSTANCE REQUIREMENTS ……...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
T ECHNIQUES I N M OLECULAR B IOLOGY – R ESTRICTION D IGEST AND A GAROSE G EL E LECTROPHORESIS This lab will introduce you to DNA modification by restriction enzymes using the purified plasmids you prepared from your transformation.我们还将使用水平凝胶电泳对纯化的质粒和消化进行分析。您将对限制酶进行切割之前和之后对纯化的质粒进行凝胶分析。您将执行质粒的模拟(控制)摘要,一种具有两种不同限制酶和双重摘要的单个摘要。从中,您应该能够确定Qiagen微型制备质粒DNA的纯度,以及在PQE60载体中的WGMDH插入物。一定要阅读有关限制摘要(教科书读数)和琼脂糖凝胶(教科书和讲义)的信息,以了解每个概念的理论,并了解执行成功实验所需的细节。必需的视频 - 新英格兰Biolabs准备的网页上的限制酶链接。观看所需的最小视频是(具有限制性酶的消化,限制酶消化的标准协议和NEB限制酶Double Digigest协议视频)。在进行实验之前,您还应该查看其他几个。https://www.neb.com/applications/cloning-‐and-‐synthetic-‐ biology/dna-‐preparation/restriction-‐enzyme-‐digestion Practical notes on Restriction Endonucleases (RE) and Their Use Enzymatic Unit definition: 1 Unit = amount of enzyme necessary to digest 1 µg DNA in 1 hr (37°C, with适当的缓冲区)。glycerol Re Digests。确保您使用的是正确的缓冲液,酶与底物的正确比率(DNA和正确消化的条件)。Rextion缓冲每个限制酶具有一个缓冲液,其中最高活性(通常为10倍浓缩物)。某些酶具有共同的缓冲液,而其他酶则需要与独特的缓冲液一起使用以进行最佳活动。几家公司(以新英格兰的Biolabs为例)具有与多种酶合作的共同缓冲液。您的网站上有一个链接 - 探索几家公司以了解缓冲液和酶。存储条件RE通过反复暴露于较高的温度来对活动丧失敏感;使用库存以长期存储保持在-20°C,在使用时在〜0°C(在冰上)处于〜0°C(在冰上)。进行消化时,温育几个小时后,某些酶的活性就会损失。由于RE昂贵,因此必须谨慎处理库存。酶应在-20°C时不断存储在非冻结冰箱中。(无霜的冰柜定期在冰点上加热以限制冰的积累。)也最好将酶放在冰箱中的绝缘容器中,该酶在打开冰柜时会限制温度变化(如果存储在霜冻的冰柜中,这一点尤其重要)。为防止在-20°C下冻结,RE库存在含有50%甘油的溶液中。由于在存在> 5%甘油的情况下可以抑制或改变RE活性,因此应库存不超过10%的最终RE消化反应混合物。[A 1:10 RE的稀释度将50%的甘油含量为5%。]在不正确的缓冲液条件下或在存在> 5%甘油的情况下,RE的恒星(*)活性可以显示出改变的DNA裂解特异性,称为“恒星活性”。在这种情况下,酶可以识别出其正常6 bp识别位点的4个基对子集,因此将在比预期的更多位点上切割DNA。例如,熟悉的酶EcoRI因其在低离子强度溶液中的恒星活性而臭名昭著。