摘要 功能性宏基因组文库是一种物理细菌文库,可以高通量捕获和表达微生物组基因,在无需测序和不依赖培养的宏基因组探索中发挥了重要作用。然而,这些文库的制备往往受到其高 DNA 输入要求和低克隆效率的限制。在这里,我们描述了一种新方法,即镶嵌末端标记 (METa) 组装,用于高效的功能性宏基因组文库制备。我们将标记技术应用于来自土壤和肠道微生物组的宏基因组 DNA,以制备 DNA 插入物,从而高通量克隆到功能性宏基因组文库中。所得 DNA 片段中镶嵌末端序列的存在与基于同源性的组装克隆协同作用,使克隆效率与传统的基于平头克隆的协议相比提高了 300 倍。我们表明,与使用最新协议制备的已发表文库相比,METa 组装的效率平均高出约 20 到 200 倍,只需 200 ng 输入 DNA 即可制备千兆碱基大小的文库。我们首先通过使用标准 5 mg 质量的土壤宏基因组 DNA 制备出一个 700 Gb 的文库来展示 METa 组装的实用性,这使得我们发现了新的诺尔丝菌素抗性基因和一种潜在的新抗性模式;其次通过使用仅 300 ng 的鹅粪便宏基因组 DNA 制备出一个 27 Gb 的文库,该文库捕获了大量四环素和粘菌素抗性基因。METa 组装为制备功能性宏基因组文库提供了一种简化、灵活且有效的方法,为低生物量或稀缺微生物组的遗传和生化研究开辟了新途径。
1.事实信息 ......................。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。....1 1.1 飞行历史 .................。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。..............1 1.2 人身伤害。.........。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。......................11 1.3 对飞机的损害 ...。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。11 1.4 其他损坏。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。11 1.5 人员信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。11 1.5.1 船长。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。13 1.5.2 副驾驶。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。15 1.5.3 飞行工程师。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。17 1.6 飞机信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。18 1.7 气象信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。18 1.8 导航辅助设备。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。20 1.9 通讯。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。20 1.10 机场信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。20 1.10.1 机场/进场图。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。22 1.10.2 9 号跑道照明。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。22 1.11 飞行记录仪。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。26 1.11.1 驾驶舱录音机。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。26 1.11.2 飞行数据记录器。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。27 1.12 残骸打捞和文件信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。27 1.13 医学和病理信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。30 1.13.1 毒理学信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。........30 1.13.2 副驾驶色觉缺陷。...............................30 1.13.3 副驾驶事故后住院信息 ...。。。。。。。。。。。。。。。。。38 1.14 火灾/爆炸。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。..39 1.15 生存方面 ....................。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。..........39 1.16 测试和研究 ..。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。39 1.17 运营和管理信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。39 1.17.1 联邦快递飞行机组人员培训 — 一般。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。40 1.17.2 邮政事故联邦快递的行动。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。47 1.18 附加信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。48 1.18.1 缺氧相关信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。48 1.18.2 DOT 操作员疲劳管理计划。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。48 1.18.3 船员熟悉/注意/监控信息。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。49 1.18.4 先前发布的安全建议。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。51