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World File Search SystemEubacterium
性别，年龄和体重指数对肠道的影响...
方法论/主要发现：我们根据粪便样品的全元素shot弹枪测序对185名中国成年人的肠道菌群进行了分析。我们的研究重点是评估三个级别的性别，年龄和BMI对肠道微生物群的影响：多样性，基因/系统发育组成和功能组成。我们的发现表明，与肠型相比，这些表型对构成肠道微生物组的影响很小，它们在样本内或样本之间的多样性内或样本间多样性内无显着相关性。我们确定了大量与表型相关的基因和宏基因组链接组（MLG），表明肠道微环形组成的变化。特别是，在老年人和BMI较高的人群中，我们观察到有益的公司微生物，例如Eubacterium，Roseburia，Roseburia，Faecalibacterium和Ruminococcus spp。随着年龄的增长而增加。此外，Blautia和Dorea spp。随着BMI的增加而增加，与先前的研究保持一致。令人惊讶的是，年龄较大或超重的个体表现出缺乏细菌植物，这是人类肠道菌群中的主要门，包括机会性病原体，而某些众所周知的益生菌的某些物种则富集在这些组中，暗示了这些细菌的复杂相互作用。关于性别，雌性中的几种来自细菌，副细胞杆菌，梭状芽胞杆菌和阿克米西的MLG富含雌性。功能分析显示了许多与表型相关的KEGG直系同源物（KOS）。
研究论文探索酰化生长素释放肽和肠道微生物组在老年人认知健康中的作用
简介：随着预期寿命的增加，老龄人口和痴呆症患病率也在增加。生长素释放肽是空间记忆和认知的关键调节剂。肠道微生物群可能会影响未酰化生长素释放肽 (UAG) 和酰化生长素释放肽 (AG) 的循环水平。因此，我们探索了老年痴呆症患者的肠道微生物群、AG 和认知健康之间的潜在关联。方法：招募了 40 名痴呆症患者和 40 名对照者。对 18 个样本进行使用 16S rRNA 测序的粪便微生物组分析。采用混合方法进行可靠的解释。结果：痴呆症患者的血清 AG 和 AG/UAG 比率增加。随着痴呆症患者中 AG 的增加，物种丰富度显著下降。长双歧杆菌、双形真杆菌、普拉梭菌、瘤胃乳杆菌和普氏菌导致了β多样性的显著差异。Blautia obeum 与简易精神状态检查 (MMSE) 相关，普拉梭菌与蒙特利尔认知评估 (MoCA) 量表相关。讨论：这项初步研究表明 AG、肠道微生物组和认知评分之间存在复杂的相互作用。AG 升高与痴呆和肠道菌群失调相对应，与肠脑轴错综复杂地相互联系。循环 AG 和相关的肠道微生物组可能是痴呆症的假定生物标志物。
Long W，Li M，Gao Y，Zhang Y，Yuan X，Ye H，Huang H，Liang W，Zhang R，Du G.微生物群落，致病细菌和高风险的抗生物生物分离
抽象目标。该研究的目的是探索微生物群落，致病细菌和高风险抗生素抗生素基因的特征，沿海海滩与多功能宿主之间的相关性，以确定中国热带海岸海滩上的粪便源污染物的潜在物种生物标志物。“一项健康”方法用于海滩和温血宿主的微生物研究。微生物使用16S rRNA基因扩增子和shot弹枪元基因组学上分析了社区。非盐海滩的混乱，辛普森，香农和王牌索引大于属属和OTU级别的盐海滩（P <0.001）。bacteroidota，halanaerobiaeota，蓝细菌和富公司在盐海滩上很丰富（p <0.01）。人类采购的微生物在盐海滩上更丰富，占0.57％。粪便核酸杆菌和hallii菌群被认为是人类粪便污染的可靠指标。在盐海滩上观察到了耐高风险的碳苯甲酸克雷伯氏菌肺炎和基因型KPC-14和KPC-24。TET（X3）/TET（X4）基因和四种类型的MCR基因在海滩和人类上共发生； MCR9.1占多数。TET（X4）在蓝细菌中发现。在中国海滩上很少报道，但观察到病原体，例如藤本植物，肺炎军团菌和幽门螺杆菌。低微生物社区的多样性并未表明风险降低。高危ARM向极端沿海环境的转移应受到足够的关注。
在上流厌氧反应器中的降解细菌群落的变化1,3-丙二醇生产
摘要研究了带有硅胶支持的上流厌氧反应器中细菌群落的演变，该反应堆不断地用纯甘油（第0-293天）和粗甘油（第294-362天）喂食。来自以前甘油降解反应堆的生物量用作接种物。用粗甘油获得了1,3-丙二醇（PDO）（PDO）（PDO）（PDO）（0.62 mol.mol-gly-Gly-1和14.7 G.l -1 .d -1）。接种物的多样性较低，乳酸杆菌（70.6％）和克雷伯氏菌/劳尔特拉（23.3％）的优势占主导地位。在用纯甘油喂养293天后，在附着的生物膜或生物量中生长的悬浮液中，两个分类单元的丰度均下降到小于10％。梭子座属和雷诺罗卡科家族的成员随后成为多数。在用粗甘油进食后的时期，梭状芽胞杆菌仍然是生物膜中的多数属。然而，它在悬浮液中部分替换为非甘油降解细菌的Eubacterium。这一事实以及生物膜中其他甘油降解属的流行率，例如磷酸胶产物和乳酸杆菌，表明附着在硅酮支撑上的细菌负责将甘油转化为1,3-PDO。因此，为了提高1,3-PDO的生产率，一种良好的方法是最大化反应堆支撑量。其他不降解甘油的属，例如厌氧菌和乙美环，以牺牲细胞衰减材料为代价。规范对应分析表明，甘油的起源是生物反应器操作期间要考虑的重要变量，用于产生1,3-PDO，而甘油加载速率却不是。
B细胞恶性肿瘤的正向和反向遗传学
背景：绿叶蔬菜（GLV）含有无机硝酸盐，该阴离子对口服微生物组具有潜在的益生元作用。然而，尚不清楚GLV和药理学补充[硝酸钾（PN）是否具有硝酸盐盐会引起对口腔微生物组的类似作用。目标：本研究旨在将GLV与PN补充对高血压个体中口腔微生物组组成和唾液生物标志物的影响进行比较。方法：将70个人随机分配给3个不同的组，以进行5周的饮食干预。第1组以GLV的形式消耗300 mg/d的硝酸盐。第2组食用的药丸，含300 mg/d的PN和低硝酸盐蔬菜。第3组用氯化钾（安慰剂：PLAC）和低硝酸盐蔬菜食用的药丸。在饮食干预之前和之后分析了口腔微生物组组成和口腔健康的唾液生物标志物。结果：GLV和PN组显示出类似的微生物变化，可能依赖硝酸盐，包括奈瑟氏菌，cap虫，弯曲杆菌，弯曲杆菌的丰富度增加，以及治疗后Veillonella，Megasphaera，segasphaera，megasphaera，sectinoryces和eubacterium种类的降低。在GLV组中观察到了Rothia物种的丰度，链球菌，Prevotella，放线菌和摩菌细菌的丰度降低，这可能是硝酸盐独立的。GLV和PN处理增加了唾液pH值，但只有GLV治疗显示唾液缓冲能力和乳酸降低的增加。结论：与PN相比，GLV组中硝酸盐依赖性和独立的微生物变化的结合对改善口服健康生物标志物具有更强的作用。
重新定义肠心轴
心力衰竭 (HF) 增加了全球心血管健康的负担。最近有研究表明，心力衰竭患者的肠道微生物群具有独特的变化，这些变化会影响免疫稳态和代谢。在本次文献系统综述中，我们旨在确定肠道菌群失调对心力衰竭的影响。我们使用了系统评价和荟萃分析的首选报告项目 (PRISMA) 2020 指南进行系统评价。我们在 PubMed、PubMed Central (PMC)、Medline 和 ScienceDirect 等数据库上搜索了文献。纳入了十篇文章进行审查。心力衰竭患者的肠道微生物组组成存在显著差异。瘤胃球菌、大肠杆菌、志贺氏菌、链球菌属、韦荣球菌属和放线菌相对丰度较高，真细菌、普氏菌、粪杆菌、SMB53 和巨单胞菌相对减少。这种组成因年龄、心力衰竭分期和失代偿水平而异。但射血分数不变，其组成保持不变。负责氨基酸、碳水化合物、胆碱三甲胺裂解酶 (TMA-裂解酶)、脂多糖 (LPS) 生物合成、色氨酸和脂质代谢的基因表达增加。由此产生的变化影响了代谢物（如三甲胺 N-氧化物 (TMAO)、吲哚硫酸盐 (IS) 和 LPS）以及粪便和血浆中的炎症标志物的水平，从而导致心力衰竭。这些心力衰竭生物标志物可以作为预防和治疗心力衰竭的目标。心力衰竭患者拥有独特的肠道微生物群，这些微生物群会影响心力衰竭的发病机制。需要进一步研究来了解菌群失调与心力衰竭之间的因果关系。
硝酸盐对高血压患者口服微生物组和唾液生物标志物的影响
背景：绿叶蔬菜（GLV）含有无机硝酸盐，该阴离子对口服微生物组具有潜在的益生元作用。然而，尚不清楚GLV和药理学补充[硝酸钾（PN）是否具有硝酸盐盐会引起对口腔微生物组的类似作用。目标：本研究旨在将GLV与PN补充对高血压个体中口腔微生物组组成和唾液生物标志物的影响进行比较。方法：将70个人随机分配给3个不同的组，以进行5周的饮食干预。第1组以GLV的形式消耗300 mg/d的硝酸盐。第2组食用的药丸，含300 mg/d的PN和低硝酸盐蔬菜。第3组用氯化钾（安慰剂：PLAC）和低硝酸盐蔬菜食用的药丸。在饮食干预之前和之后分析了口腔微生物组组成和口腔健康的唾液生物标志物。结果：GLV和PN组显示出类似的微生物变化，可能依赖硝酸盐，包括奈瑟氏菌，cap虫，弯曲杆菌，弯曲杆菌的丰富度增加，以及治疗后Veillonella，Megasphaera，segasphaera，megasphaera，sectinoryces和eubacterium种类的降低。在GLV组中观察到了Rothia物种的丰度，链球菌，Prevotella，放线菌和摩菌细菌的丰度降低，这可能是硝酸盐独立的。GLV和PN处理增加了唾液pH值，但只有GLV治疗显示唾液缓冲能力和乳酸降低的增加。结论：与PN相比，GLV组中硝酸盐依赖性和独立的微生物变化的结合对改善口服健康生物标志物具有更强的作用。
优化 ErCas12a 以实现拟南芥中的高效基因编辑
摘要 Er Cas12a 核酸酶，也称为 MAD7，是来自直肠真杆菌的 CRISPR/Cas 系统的一部分，与 Cas12a 核酸酶有远亲关系。由于它与常用的 As Cas12a 仅有 31% 的序列同源性，其知识产权可能不受 Cas12a 核酸酶授予的专利权的保护。因此，Er Cas12a 成为实际应用的一个有吸引力的替代品。然而，Er Cas12a 的编辑效率强烈依赖于靶序列和温度。因此，通过蛋白质工程优化酶活性对于其在植物中的应用尤其有吸引力，因为它们是在较低温度下培养的。基于从 Cas12a 核酸酶优化中获得的知识，我们选择通过引入类似的氨基酸交换来提高 Er Cas12a 的基因编辑效率。有趣的是，这些与 As Cas12a 增强版或 Ultra 版类似的突变均未导致拟南芥中 Er Cas12a 的编辑显著增强。然而，酶假定的 α 螺旋结构中的两个不同突变 V156R 和 K172R 显示出可检测到的编辑改善。通过结合这两个突变，我们获得了改进的 Er Cas12a (im Er Cas12a) 变体，与拟南芥中的野生型酶相比，其活性增加了几倍。该变体在 22°C 时具有很强的编辑效率，通过将培养温度升高到 28°C 可以进一步提高，甚至可以编辑以前无法接近的目标。此外，没有检测到增强的场外活动。因此，im Er Cas12a 是一种经济上有吸引力且有效的植物基因组工程其他 CRISPR/Cas 系统的替代方案。
肠道菌群组成反映了COVID-19
抽象目的尽管Covid-19主要是一种呼吸道疾病，但有越来越多的证据表明该疾病涉及该疾病。我们调查了肠道微生物组是否与COVID-19患者的疾病严重程度有关，以及微生物组组成（如果有的话）的扰动是否会随着SARS-COV-2病毒的清除而解决。在这项两次医院队列研究中，我们从100例实验室确认的SARS-COV-2感染的患者那里获得了血液，粪便和患者记录。 串行粪便样品是从清除SARS-COV-2后30天的100名患者中的27例收集的。 肠道微生物组组成的特征是从粪便中提取的shot弹枪测序。 从血浆中测量炎性细胞因子和血液标记的浓度。 结果与非旋转-19个个体相比，COVID-19患者的肠道微生物组组成有显着改变，无论患者是否接受过药物治疗， 几种具有已知免疫调节潜力的肠道分子，例如粪便核酸杆菌，肠道菌肠杆菌和双歧杆菌的患者占患者的含量不足，并且在疾病分辨率后至30天收集的样本中仍保持较低。 此外，这种扰动的组合物与疾病严重程度一致的分层与浓度升高的炎性细胞因子和血液标记物（例如C反应性蛋白质，乳酸脱氢酶，天冬氨酸氨基转移酶和γ-卢丁而生扬酰基转移酶）。在这项两次医院队列研究中，我们从100例实验室确认的SARS-COV-2感染的患者那里获得了血液，粪便和患者记录。串行粪便样品是从清除SARS-COV-2后30天的100名患者中的27例收集的。肠道微生物组组成的特征是从粪便中提取的shot弹枪测序。从血浆中测量炎性细胞因子和血液标记的浓度。结果与非旋转-19个个体相比，COVID-19患者的肠道微生物组组成有显着改变，无论患者是否接受过药物治疗，几种具有已知免疫调节潜力的肠道分子，例如粪便核酸杆菌，肠道菌肠杆菌和双歧杆菌的患者占患者的含量不足，并且在疾病分辨率后至30天收集的样本中仍保持较低。此外，这种扰动的组合物与疾病严重程度一致的分层与浓度升高的炎性细胞因子和血液标记物（例如C反应性蛋白质，乳酸脱氢酶，天冬氨酸氨基转移酶和γ-卢丁而生扬酰基转移酶）。COVID-19患者的肠道菌群组成，细胞因子水平和炎症标志物之间的结论相关性表明，肠道微生物组可能通过调节宿主免疫反应而参与COVID-19的严重程度。此外，疾病分辨率后的肠道微生物群营养不良可能导致持续的症状，强调需要了解肠道微生物如何参与炎症和covid-19。
DigitalCommons@USU-犹他州立大学
摘要：龋齿是一种生物膜介导的，糖驱动的，多因素，动态疾病，导致牙科硬组织的质量脱矿化和回忆。尽管科学方面的科学进步，龋齿仍然是一个严重的全球关注点。The aim of this study was to determine the optimization of microbial and molecular techniques for the detection of cariogenic pathogens in dental caries patients, the prevalence of cariogenic bacteria on the basis of socioeco- nomic, climatological, and hygienic factors, and in vitro evaluation of the antimicrobial activity of selected synthetic antibiotics and herbal extracts.在这项研究中，从900例患者中收集口服样本，以生化和分子为基础进行细菌应变筛查。植物提取物，例如生姜，大蒜，印em，tulsi，amla和芦荟，用于检查针对分离菌株的抗菌活性。合成抗菌剂，例如青霉素，阿莫西林，红霉素，克林霉素，甲硝唑，多西环素，头孢济霉菌，levo氟axacin和levo bipro oxacin和cipro flofquin，也用于获取抗微生物活性。在900例患者中，男性为63％，男性为37％，年龄在36至58岁（45.7％）年的患者容易患疾病，最常见的症状是牙痛（61％）。对于口腔疾病，21％使用草药，36％使用的抗生素和48％的人是自我药物的，这是由于糖果消耗（60.66％）和纤维饮料和快餐食品（51.56％）。葡萄球菌突变（29.11％）和Sobrinus链球菌（28.11％）被发现是最丰富的菌株。成功筛选了七个细菌菌株，并预测与S. sobrinus，S。utans，静脉炎，静脉炎，乳酸杆菌，核酸乳杆菌，鼻to杆菌，丙片杆菌，丙丙杆菌酸酸酯和Treponema Pallidum。在植物提取物中，姜（22.36 mm）和Amla（20.01 mm）记录了最大抑制区，而合成抗生素，cipro loffoxacin和levo flofflofloffo蛋白在所有微生物中最有效。这项研究得出的结论是，生姜和Amla的植物提取物被认为是合成抗生素治疗牙齿疾病的合适替代品。