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ExpressPlex™ 2.0 文库制备试剂盒 – 384 孔
正在申请专利的 ExpressPlex 2.0 文库制备试剂盒采用方便的 384 孔 PCR 板配置，可用于高通量多重文库制备。此升级版 ExpressPlex 使用 seqWell 的高性能 TnX ™ 转座酶，该转座酶专为 NGS 文库制备而设计。扩增子 (>350 bp) 和质粒 DNA 是适合该试剂盒的标准输入。附录 E 重点介绍了可以针对小型微生物全基因组测序进行的修改。ExpressPlex 文库与 Illumina MiSeq ™ 、NextSeq ™ 、iSeq ™ 和 NovaSeq ™ 测序平台兼容。每个 ExpressPlex 2.0 - 384 孔试剂盒都包含足够的试剂，可从 384 或 1,536 个单独的 DNA 样本制备与 Illumina 兼容的文库。每个库的标准制备量为 384 个样本，每个试剂盒最多 1,536 个样本。有四种不同的试剂盒可用于从 1,536 个样本中制备文库，在一次测序运行中可加载总共 6,144 种条形码组合。这种多重文库制备程序针对每 8 µl 反应 0.5 - 20 ng 质粒或扩增子 DNA 的输入进行了优化，通常可生成 400 – 1,200 bp 的文库片段长度。文库片段长度取决于 DNA 的质量和所用的磁珠清理率。使用 ExpressPlex 文库制备试剂盒的主要优势和好处是简化的一步式多重文库制备工作流程，可在 40 倍的 DNA 输入浓度范围内自动标准化每个样本的读取输出，同时最大限度地减少人工和耗材成本。使用 ExpressPlex 2.0 – 384 孔试剂盒，可在 120 分钟内制备 384 重文库以进行文库 QC 和测序，手动操作时间不到 30 分钟。
一步库准备方法支持Skim-Seq ...
2.0自定义高强度公式，一种单步库制备方法，用于脱离人类样品基因型插补的方法。ExpressPlex 2.0自定义高强度公式用于在四个不同的总质量输入处处理两个单独的人基因组DNA，从而产生一个归一化的8个PLEX库池。在NextSeq 2000 P3上运行2 x 150 bp，将Expressplex库测序为≥2000万个配对末端读数。对每个样品的配对末端读取均与GRCH38人参考基因组对齐，确定了SNP调用的精度和准确性22。使用默认设置执行的插补的开源瞥见管道。我们的结果表明，AxpressPlex 2.0定制高强度公式的常规低通WGS应用程序的实用性，在其中我们表征了参考样品集合中的多重均匀性和基因型插定精度。
回声声学液体处理和下一代TNX ...
2.0是最快的图书馆准备化学。使用Seqwell的高性能TNX转座酶（专门针对NGS库制备设计），它对样品输入的自动归一化，片段输入DNA成适合Illumina测序仪的尺寸，并在单步中使用Sembers Input dna进行适用于Illumina序列的尺寸，并用组合型二异形指示剂将DNA标记。测序导致数百至数千个样本的统一读数统计数据。ExpressPlex 2.0通过为测序项目提供强大的多重功能来补充Beckman Coulter Echo 525。它旨在最大化吞吐量和数据产量，并允许研究人员同时处理数千个样本。这种可伸缩性对于合成生物学的大规模努力至关重要，在合成生物学方面，对并行多个样品进行测序的能力可以显着加速发现。