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易转化普通小麦品种‘Fielder’的染色体规模基因组组装
我们已为六倍体普通小麦品种“Fielder”建立了高质量的染色体水平基因组组装，Fielder 是美国软质白色糕点型小麦，于 1974 年推出，以易受农杆菌介导的转化和基因组编辑而闻名。使用 HiFi 方法的 PacBio 环状共识测序获得了准确的长读序列。使用 hifiasm 组装器组装的 16 个 SMRT 细胞的序列读数产生了 N50 大于 20 Mb 的组装体。我们使用 Omni-C 染色体构象捕获技术将重叠群排序为染色体水平组装体，得到 21 个伪分子，累计大小为 14.7，未锚定重叠群为 0.3 Gb。对含有已编辑的种子休眠基因 TaQsd1 的转基因小麦植物的已发表短读段进行定位，确定了转基因插入小麦染色体的四个位置。在伪分子中检测向导 RNA 序列为脱靶突变诱导提供了候选。这些结果证明了使用 PacBio HiFi 读段进行染色体规模组装的效率及其在小麦基因组编辑研究中的应用。
Shakeya Fielder女士，电子邮件：sfielder@tuskegee.edu;博士：+1（334）727-8802学位：材料科学和Engi 的哲学博士（博士学位） 春季2021年开始练习
高级材料科学与工程。cr。3。本课程介绍了来自各个学科的学生到材料科学和工程学。将讨论不同类型的高级材料，现代材料需求，处理技术，属性和应用。材料暴露于各种环境时，将教授材料和设计考虑，经济和回收问题的材料问题。先决条件：Meng 0318：材料工程MSEG 0611聚合物和纳米复合材料的分子建模。cr。3。向学生介绍分子建模的基本原理，并将这些知识用于集体项目。小型项目和家庭作业将根据需要分配。迷你项目需要计算机计算。功课集将从文本和文献来源中汲取。MSEG 0612