这些是从古吉拉特邦(Gujarat)开始,在泰米尔纳德邦(Tamil Nadu)结束的印度西部海岸平行的山脉。古吉拉特邦,马哈拉施特拉邦,果阿,卡纳塔克邦,泰米尔纳德邦和喀拉拉邦是西高止山脉覆盖的六个印度国家。山脉也是生物多样性的“最热的热点”。高止山脉通常被称为印度的巨大悬崖,也是联合国教科文组织世界遗产。高的生物多样性和特有主义是西高止山脉的特殊特征,以及常绿森林的存在。意义:
在纽约州罗切斯特大学微生物学和免疫学系的雅克·罗伯特博士的实验室(https://wwwwwwwww.urmc.rochester.edu/labs/labs/robert.aspx)中,可以在博士学和免疫学系实验室中获得使用两栖动物作为实验生物,对病原体(例如病毒和分枝杆菌)的耐产生免疫反应。 该项目涉及基因组学,转录组学,重组蛋白设计和表达,以及反向遗传方法(CRISPR/CAS9基因组编辑和转化的RNA干扰)以及插入式成像。 候选人将有机会参与学生的监督和Xenopus laevis研究资源的管理(https://www.urmc.rochester.edu/mbi/mbi/resources/xenopus-laeevis/)。使用两栖动物作为实验生物,对病原体(例如病毒和分枝杆菌)的耐产生免疫反应。该项目涉及基因组学,转录组学,重组蛋白设计和表达,以及反向遗传方法(CRISPR/CAS9基因组编辑和转化的RNA干扰)以及插入式成像。候选人将有机会参与学生的监督和Xenopus laevis研究资源的管理(https://www.urmc.rochester.edu/mbi/mbi/resources/xenopus-laeevis/)。
在巴西大西洋森林中的物种灭绝风险评估中应考虑观察到的气候变化,这是气候不稳定的领域(主要文本,图。3e)。大西洋森林生物群落被严重碎裂和孤立(Ribeiro等,2009; Rosa等,2021),严格的青蛙的种群也是如此(Dixo等,2009),甚至是栖息地的人群(Telles等,2007年)。这部分是由于农业活动的土地覆盖率变化以及随之而来的农药在农业景观中的使用增加(Ferrante等,2019),这导致了巴西两栖动物的局部突变和灭绝(Ferrante&Fearnse,2020c,2020c)。森林碎片周围的农业矩阵对许多物种变得无法通行和荒凉(Ferrante等,2017)。我们的结果表明气候应力(图4E)和这些区域中的气候异常(主要文本,图。5)可能是导致阿罗拉人种群分裂的因素之一,因为开放区域和农作物的湿度较低,温度较高,这使得它们对许多两栖动物都造。
两栖动物在生态系统中非常重要,因为它可以在水和土地上生存。它们是高度进化的,并且在不同动物门中具有显着的再生能力。不同的两栖动物属在能量流中从小动物到大动物群的能量和营养物质的转移中起着重要作用。青蛙认为是自然的害虫控制器,而不会伤害生态系统中的任何人,维持生态平衡。有大量的青蛙物种在过去二十年(10 - 20年)中消失,而国际自然保护联盟(IUCN)则记录了许多威胁类别的物种。研究人员在过去几十年中确定的一个明显的原因是,由chytridiycomisosis感染性疾病是由chytrid真菌(batrachochochytrium dendrobatidis)引起的,负责全球两栖动物的人口下降。当不利的状况(冬季,干旱等)来了,两栖动物将它们自我视为在进化过程中在基因中编码的保护机制。在休眠期间,chytrid真菌在青蛙皮肤上生长并形成一件外套,并影响皮肤呼吸过程,因此供水切断并使其难以呼吸。一段时间后,青蛙面临脱水问题,然后死亡。在真菌感染之外,还有许多其他因素会导致青蛙种群下降,包括细菌和病毒疾病,栖息地破坏,污染和农药使用等。
“超顺磁效应”是指承载数据的粒子非常小,室温下所有材料中存在的随机原子级振动会导致数据位自发翻转其磁性方向,从而有效地擦除记录的数据。“
时空生物电态调节胚胎发生的多个方面。一个关键的开放问题涉及特定的多细胞电势模式如何差异激活器官发生所需的不同下游基因。要理解空间生物启示模式,遗传学和形态之间关系的信息处理机制,我们专注于Xenopus ectoderm中的特定时空生物启用模式,以调节胚胎脑构图。我们使用机器学习设计了胚胎脑形态发生的最小但可扩展的生物电遗传学动力学网络模型,该模型定性地概括了先前的实验观察结果。该模型的因果整合分析揭示了与空间生物电和基因活性模式相关的简单高阶时空信息整合机制,其中后者表示是细胞组伏特的因果影响的函数。该机制的具体方面包括因果分配(某些细胞位置对于集体决策更重要),信息不对称性(降压细胞比超极化细胞更具影响力),长距离影响(细胞中的基因对远方细胞的伏特效应非常敏感),并且劳动力敏感(不同的基因对不同的基因均具有敏感的基因)。该机制的不对称信息处理特征使该模型预测了调节正常胚胎脑发育的生物电预制预图中意外的可塑性和鲁棒性程度。我们的体内实验通过Xenopus胚胎中的分子操作验证了这些预测。这项工作表明了使用最小的硅方法中的力量大幅度降低体内参数空间,从而使硬生物学问题可进行。这些结果提供了对指导大规模形态发生的生物电力刺激的整体决策过程的见解,这表明了生物医学干预措施的新应用以及用于合成生物工程的新工具。
样本日期池塘位置区域代码样本类型2022 Jun 4* lillehammer 1幼虫2022 Jun 16 Lillehammer 1幼虫2022 Jun 4 Skytta1 2A幼虫2022 JUN 26 SKYTTA1 SKEYTTA1 2A幼虫2022 Jul 10 Jul 10 Skytta1 Skyta1 Skyta1 2a rarva2 6月202日202年6月202日。 2B幼虫2022年7月10日Skytta2 2b幼虫2022 6月4日par a幼虫3a幼虫2022 6月26日26年6月26日prying大坝3a幼虫2022年7月10日prying大坝3a幼虫2022 2022年6月4日froskedammed 3B幼虫2022 Jun 26 Jun 26 Jun 26 Froskedammen 3b Larkemen 3b Larkemen 3b larkemen 3bb larvaemen 3bb larveamemen 3bb larvaemen 3bb larvaemen 3bb larvaemen 3bb larvae tarvaemen 3bb larvaemen 3bb larvae *t和t的样品批处理的日期和位置为ranid疱疹病毒3。
时空生物电态调节胚胎发生的多个方面。一个关键的开放问题涉及特定的多细胞电势模式如何差异激活器官发生所需的不同下游基因。要理解空间生物启示模式,遗传学和形态之间关系的信息处理机制,我们专注于Xenopus ectoderm中的特定时空生物启用模式,以调节胚胎脑构图。我们使用机器学习设计了胚胎脑形态发生的最小但可扩展的生物电遗传学动力学网络模型,该模型定性地概括了先前的实验观察结果。该模型的因果整合分析揭示了与空间生物电和基因表达模式相关的简单高阶时空信息整合机制。该机制的具体方面包括因果分配(某些细胞位置对于集体决策更重要),信息不对称性(降压细胞比超极化细胞更具影响力),长距离影响(细胞中的基因对远方细胞的伏特效应非常敏感),并且劳动力敏感(不同的基因对不同的基因均具有敏感的基因)。该机制的不对称信息处理特征使该模型预测了调节正常胚胎脑发育的生物电预制预图中意外的可塑性和鲁棒性程度。我们的体内实验通过Xenopus胚胎中的分子操作验证了这些预测。这项工作表明了使用最小的硅方法中的力量大幅度降低体内参数空间,从而使硬生物学问题可进行。这些结果提供了对指导大规模形态发生的生物电力刺激的整体决策过程的见解,这表明了生物医学干预措施的新应用以及用于合成生物工程的新工具。
1 德克萨斯大学奥斯汀分校综合生物学系,美国德克萨斯州奥斯汀 2 康奈尔大学生态与进化生物学系,美国纽约州伊萨卡 3 加利福尼亚州鱼类和野生动物部,美国加利福尼亚州西萨克拉门托 4 地球研究所和 5 加利福尼亚大学生态、进化和海洋生物学系,美国加利福尼亚州圣巴巴拉 6 加利福尼亚大学基因组中心,美国加利福尼亚州戴维斯 7 美国地质调查局,森林和牧场生态系统科学中心,美国俄勒冈州科瓦利斯 8 六河国家森林,下三一护林区,美国农业部森林服务局,邮政信箱 68,美国加利福尼亚州威洛溪 9 Spring Rivers 生态科学有限责任公司,美国加利福尼亚州卡塞尔 10 佛罗里达国际大学生物科学系,美国佛罗里达州迈阿密 11 普卢默斯国家森林,美国农业部森林服务局,美国加利福尼亚州昆西 12 美国地质调查局,国家野生动物健康中心,美国威斯康星州麦迪逊 13 Point雷耶斯野外站,美国地质调查局,西部生态研究中心,美国加利福尼亚州雷斯角站 14 尖峰国家公园,美国国家公园管理局,美国加利福尼亚州派辛斯 15 加州大学脊椎动物学博物馆,美国加利福尼亚州伯克利市 16 加州大学综合生物学系,美国加利福尼亚州伯克利市 17 塞拉利昂溪流研究所,美国加利福尼亚州内华达城 18 HELIX 环境规划公司,美国加利福尼亚州罗斯维尔 19 华盛顿州立大学生物科学学院,美国华盛顿州温哥华 20 美国农业部林务局太平洋西南研究站,美国加利福尼亚州阿克塔 21 旧金山州立大学生物系,美国加利福尼亚州旧金山 22 美国土地管理局中央海岸实地办事处,美国加利福尼亚州马里纳市 23 加州科学院爬虫学系,美国加利福尼亚州旧金山市
肠道菌群与宿主生理学保持着深厚的共生关系,与内部(内源性)和外部(外源性)因素都复杂地接合。Anurans尤其是温带地区的Anurans面临着重大外部影响的双重挑战,例如冬眠和与不同的生活历史相关的复杂内部差异。在我们的研究中,我们试图确定日本皱纹青蛙(Glandirana Rugosa)的不同生命阶段(少年与成人)是否导致冬季(Hibernation)(Hibernation)的肠道细菌群落的明显转变以及随后向春季过渡。假设,我们观察到与成年同龄人相比,少年青蛙的肠道细菌多样性和丰度更为明显。这表明肠道环境在冬眠期间可能在成年青蛙中更具弹性或稳定。但是,这种明显的差异仅限于冬季。到春季,少年和成年青蛙的肠道细菌的多样性和丰度紧密排列。具体而言,冬季和春季之间肠道多样性和组成的差异似乎反映了青蛙的生态适应性。在冬眠期,蛋白质细菌的主导地位表明,强调支持细胞内的运输和维持稳态,而不是青蛙的主动代谢。相反,春季,细菌多样性的上升,加上富公司和细菌的占主导地位,表明新陈代谢后的新陈代谢活性兴起,有利于增强的养分同化和能量代谢。我们的发现强调,肠道微生物组与其宿主之间的关系是动态的和双向的。然而,肠道细菌多样性和组成的变化在多大程度上有助于增强青蛙中的冬眠生理,仍然是一个悬而未决的问题,需要进一步研究。