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gimap：计算配对CRISPR目标的遗传相互作用
描述有助于在复杂的遗传实验中找到有意义的模式。第一个GIMAP从配对的CRISPR（群集的定期间隔短壁画重复序列）中获取数据，该屏幕已预处理到计数配对GRNA的计数表（指南ribonucleic Acid）读取。当残疾基因或成对的基因或对时，IN-POT数据将具有细胞计数的细胞计数。“ GIMAP”套件的输出是遗传互动得分，它是观察到的CRISPR评分与被指出的CRISPR评分之间的距离。预期的CRISPR分数是我们对两个无关基因的CRISPR values的期望。越远，观察到的CRISPR得分是从其表达的得分中，我们越怀疑遗传相互作用。这项包装中的工作基于弗雷德·哈钦森癌症Center（2021）的Alice Berger实验室的原始研究。
宿主免疫地位对不一致的反sars的影响 -
1个免疫基因组学和炎症研究团队，里昂大学，爱德华·赫里奥特医院，法国里昂69003； frederic.coutant@univ-lyon1.fr 2免疫学部，里昂 - 苏德医院，里昂的医院公民，69310法国Pierre-bénite，法国3号Dendritics-Edouard Herriot医院，法国69003 Lyon，法国； JEAN_JACQUES_PIN@HOTMAIL.FR 4病毒学系，北部医院网络国家参考中心感染剂学院，法国里昂69004； flimence.morfinfin-sherpa@chu-lyon.fr 5 Virpath团队，CIRI，INSERM U1111，CNRS UMR5308，ENS LYON，ENS LYON，CLAUDE BERNARD LYON 1，69100 LYON，LYON，法国6，法国6，感染和热带疾病，HOSTICES CIVER NIVERS，HOSTESSICESS FIVERS，HOSTESSICESS HOSIDERS HOSIDESS HOSIDESS，FIRMANDE SESE SESE SESE，699004，69.9004 004 004 004; tristan.ferry@chu-lyon.fr 7 Stapath Team，CIRI，Inserm U1111，CNRS，UMR5308，Ens Lyon，University Claude Bernard Lyon 1，69100法国里昂，法国8里昂8，圣伊蒂恩大学医院stephane.paul@chu-st-etienne.fr 9 Gimap Team，Ciri，Inserm U1111，CNRS，UMR530，University Claude Bernard Lyon 1，CIC 1408疫苗，42023 Saint-Etienne，法国，法国； bruno.pozzetto@univ-st-etienne.fr 10传染病特工和卫生部，圣泰恩大学医院，42055法国圣伊蒂安，法国11 Sainbiose 11 Sainbiose，Inserm，inserm，U1059，U1059，里昂大学，42270 Saint-Etienne，42270 Saint-Etienne，France，France; myriam.normand@univ-st-eetienne.fr 12，法国里昂69003 Edouard Herriot医院免疫学和风湿病学系