w在320至355 nm之间,最大发射波长反映了W对溶剂的暴露。在水溶液(PBS 1X)中测量这种荧光在非结构环境中观察(肽不会在水中形成α-螺旋)和胶束溶液,以研究脂肪样微环境的效果(图6a.3和6b.3)。我们观察到,超过1 mm,即DPC的CMC,DRS-B2的荧光发射最大值和H-B2移动向更短波长(“蓝移”),并显示出荧光强度的强烈增加(高染料移位)。这些光谱变化反映了从亲水性到疏水环境的变化,可以通过埋在DPC胶束的疏水层中的W残基来解释,或者
strands”在DNA折纸中,接吻环和RNA折纸中的其他连接器图案)。两种方法都已用于设计各种2D形状和3D结构(5,6)。大多数当前的3D折纸设计遵循在彼此顶部包装几层二维螺旋或螺旋束的方法,和/或弯曲的螺旋束如(7,8)中最初建议。3D设计的替代路径是创建一个线框结构,该结构仅包含3D模型的边界边缘和顶点。在这个方向上有几个值得注意的前虫前旅行(9,10),但是随着柔性且坚固的折纸技术的发展,它大多开始获得追随者(6,11)。与螺旋装箱相比,线框设计的一些优势包括使用链的经济,这允许建造较大的结构,并在低盐条件下更好地折叠。一些挑战是结构的刚性较低,尤其是对于大型的单螺旋边缘设计(可以通过使用多螺旋边缘来减轻,以增加链的使用来缓解)和大型复杂设计的产量低。已经存在几种核酸纳米结构设计工具(8、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21)。Most of these however address helix-packing designs, with the more recent ones oriented towards wireframe structures including vHelix (14), DAEDALUS (15) and ATHENA (18) for 3D DNA wireframes, Sterna (20) for single-stranded 3D RNA wireframes and PyDAEDALUS (21) for 3D RNA/DNA hybrid wireframes.这些工具主要支持一种特定的设计方法,每个工具也都处于离线状态,需要一个单独的过程来安装工具及其辅助库,有时可能很难找到或在最坏的情况下弃用。
该密码的核心仅使用 4 个字母(G、C、A、T),每个字母代表一种称为核苷酸碱基的东西。这些碱基成对工作,连接双螺旋的两个半部分,G 与 C,A 与 T。每个碱基只能与特定的伙伴配对!一组三个这样的字母称为密码子。密码子是一种代码,它告诉我们的身体构建一种称为氨基酸的特定分子。然后,这些分子按照 DNA 指示的顺序连接在一起,形成称为蛋白质的长链。我们的身体由蛋白质组成,例如我们的肌肉、皮肤,甚至唾液!可以将其视为形成链接(氨基酸)的指令(密码子),该链接可用于创建链(蛋白质)!
20 年前 1 在《医学杂志》(布宜诺斯艾利斯)的一篇有趣的社论中,Kotsias 博士强调了脱氧核糖核酸 (DNA) 双螺旋结构提出的纪念日。DNA 双螺旋结构发现于 1953 年,从那以后改变了整个生物医学科学。如今,距离这一发现 2 已经过去了 70 年,我们有必要记住人类的这一杰出进步。此外,今年也是人类基因组测序 3,4 的二十周年,后基因组时代由此开启,而人类基因组测序的进步被视为人类正在经历的第五次工业革命 5 的主角。因此,本文旨在反思 DNA 结构的七十年历史、人类基因组测序二十年以来的历史以及当前第五次工业革命对健康的影响。
为了保障公共安全而进行的技术监控(例如,摄像头、传感器、手机、 OSINT)渗透到个人生活的方方面面。在本文中,我们提出了这样一种观点,即人工智能的加入改变了监控生态系统的运作方式,因此值得产生一个新概念:监控人工智能生态系统。监控人工智能生态系统由相互关联的不同参与者(技术、人类、超人类、组织等)组成,所有这些参与者都参与了人工智能辅助的监控任务。它们不仅包含任何技术生态系统的通常复杂性,还包含人工智能的额外复杂性,具有技术和社会方面的新兴特征。我们主张在人工智能生态系统中开展工作时采用多方面视角,并描述(受人类学启发的)理解和解开人工智能监控生态系统的方法。民主控制的人工智能监控的发展需要系统地考虑五重螺旋(公共、私人、民间社会、学术界、自然)中的伦理、法律和社会方面(ELSA)。我们强调明确定义五重螺旋的哪些观点在人工智能监控中被考虑,哪些观点没有被考虑,以实现一套透明的(ELSA)价值观来指导人工智能监控的开发和实施。我们提供了一个示例,说明我们如何在智能城市技术开发和应用的试验场(即所谓的“生活实验室”)的背景下开发和应用(部分)这些方法。在这里,我们采取积极参与学者作为“批判性朋友”的立场,参与复杂的创新和评估过程。我们与该领域的对话伙伴一起,梳理和反思我们所探索的生活实验室设置中蕴含的(公共安全)价值观。最后,我们呼吁人们不要将监控人工智能系统理解为一个需要解决的问题,而要将其理解为一个需要高度多样化的利益相关者讨论的持续过程。
摘要载脂蛋白 AI (apoA-I) 在高密度脂蛋白 (HDL) 颗粒介导的胆固醇逆向转运中起着关键作用。然而,apoA-I 单点突变体的聚集可导致遗传性淀粉样蛋白病理。尽管已有多项研究探讨了这些突变引起的生物物理和结构影响,但很少有信息涉及导致 apoA-I 淀粉样蛋白行为的进化特征和结构特征之间的关系。我们结合进化研究、计算机模拟饱和诱变和分子动力学 (MD) 模拟,对 apoA-I 中存在的聚集易发区 (APR) 的保守性和致病作用进行了全面分析。序列分析表明,N 端 ɑ 螺旋束内 APR(此处称为 APR1)具有普遍的保守性。此外,使用 FoldX 引擎进行的稳定性分析表明,该基序有助于 apoA-I 的边缘稳定性。全长 apoA-I 模型的结构特性表明,通过将 APR 放入其结构中高度密集和刚性的部分可以避免聚集。与从 gnomAD 数据库中提取的 HDL 缺乏或天然沉默变体相比,与淀粉样蛋白病理相关的 apoA-I 点突变的热力学和致病影响表现出更高的不稳定效应。淀粉样蛋白变体 G26R 的 MD 模拟证明了 ɑ 螺旋束的部分展开和 apoA-I C 端出现 β 链次级元件。我们的研究结果强调了 APR1 是 apoA-I 结构完整性的相关成分,并强调了导致 APR 暴露的淀粉样蛋白变体的不稳定作用。这些信息有助于我们了解具有高度结构灵活性的 apoA-I 如何在其天然结构和形成淀粉样蛋白聚集体的内在趋势之间保持微妙的平衡。此外,我们的稳定性测量可以用作解释影响 apoA-I 的新突变的结构影响的代理。关键词:聚集、淀粉样变性、载脂蛋白、进化保守、变体。
sirtuin 6(SIRT6)是一种多面蛋白脱乙酰基酶/脱酰基酶,也是小分子寿命和癌症的主要靶标。在染色质的背景下,SIRT6在核小体中去除组蛋白H3的乙酰基,但是其核小体底物偏好的分子基础尚不清楚。我们的冷冻 - 与核小体复合体中人类SIRT6的电子显微镜结构表明,SIRT6的催化结构域从核小体入门位点pries DNA pries DNA,并通过使用呼吸酶锚固的组蛋白酸性贴剂结合了组蛋白H3 N末端螺旋,而SIRT6 Zinc Zinc结合域则与SIRT6 Zinc 6 Zinc结合域结合。此外,SIRT6与组蛋白H2A的C末端尾巴形成抑制作用。该结构提供了有关SIRT6如何脱乙酰化H3 K9和H3 K56的见解。
因此,人工智能生态系统利益相关者(图 3)构成了共享价值(共同)创造的关键驱动力,包括为所有人和共同利益创造知识和人工智能驱动的创新。希腊承认环境恶化是对未来生命的生存威胁,因此采用了扩大的利益相关者细分,将环境作为主要利益相关者之一。这与欧洲的愿景直接一致,即到 2050 年将欧洲打造为世界上第一个气候中和大陆(欧洲绿色协议 [7]),这是欧洲面向可持续未来的新增长战略。此外,将环境(自然生命)作为与人(人类生命)6 直接相关的核心利益相关者也符合五螺旋创新模式 7,该模式支持生态、知识和创新的共生。这在经济、社会和民主之间产生了协同效应 [8]。