NucleOmag®HMWDNA试剂盒设计用于从细胞,组织和植物材料中分离出高分子量DNA。此外,还显示了全血(EDTA),唾液,颊拭子以及细菌和酵母样品的兼容性。该程序基于在适当的缓冲液条件下核酸对顺磁珠的可逆吸附。样品裂解是使用裂解缓冲液HM1或HMB和蛋白酶K进行酶促的。用于将核酸与顺磁珠,结合缓冲液HM2和核瘤®B-珠的结合添加到转移和清除的裂解物中。磁分离后,使用洗涤缓冲液HM3,HM4和70%乙醇洗涤顺磁珠以去除污染物和盐分。使用冲洗缓冲液HM5去除以前的洗涤步骤的残留乙醇。接下来,高度纯化的DNA用洗脱缓冲液HM6洗脱,可直接用于下游应用。可以手动使用NucleOmag®HMWDNA试剂盒,也可以在标准的液体处理仪器和自动磁分离器上自动化。
NucleOmag®HMWDNA试剂盒设计用于从细胞,组织和植物材料中分离出高分子量DNA。此外,还显示了全血(EDTA),唾液,颊拭子以及细菌和酵母样品的兼容性。该程序基于在适当的缓冲液条件下核酸对顺磁珠的可逆吸附。样品裂解是使用裂解缓冲液HM1或HMB和蛋白酶K进行酶促的。用于将核酸与顺磁珠,结合缓冲液HM2和核瘤®B-珠的结合添加到转移和清除的裂解物中。磁分离后,使用洗涤缓冲液HM3,HM4和70%乙醇洗涤顺磁珠以去除污染物和盐分。使用冲洗缓冲液HM5去除以前的洗涤步骤的残留乙醇。接下来,高度纯化的DNA用洗脱缓冲液HM6洗脱,可直接用于下游应用。可以手动使用NucleOmag®HMWDNA试剂盒,也可以在标准的液体处理仪器和自动磁分离器上自动化。
提取高分子量(HMW)DNA进行长读测序,几乎没有碎片和高纯度是从蓝细菌物种中获取的。在这里,我们描述了一种使用Promega的向导R○HMW DNA提取试剂盒从两个蓝细菌物种中获取高分子量DNA的修改方法。套件中使用的协议是“ 3.D。从革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌中分离HMW DNA”方案。在协议中的关键步骤中,我们建议除去细胞碎片的挥之不去的残留物,例如蓝细菌物种的粘液层,以防止其粘在产生的DNA颗粒上。此自定义的修改是在步骤11和12之间进行的,并称为METIS(最大化提取,转移异丙醇步骤)。此步骤大大减少了剩余的粘液层,如果保留将粘贴在DNA上,并使DNA不适合敏感的下游下一代测序,例如PACBIO测序。该方案已用于组装来自蓝细菌的两个基因组(Sychococcussp。和微囊孢子虫),一个来自革兰氏阴性细菌,lacibacter。它还允许在不使用有毒化学物质(例如苯酚)的情况下快速提取HMW DNA,而无需购买额外的试剂。