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不同高危人乳头瘤病毒载量女性宫颈菌群变化
摘要：宫颈微生物群对女性性健康至关重要，其改变状态似乎在高危型乳头瘤病毒 (hrHPV) 感染的动态中起着核心作用。本研究旨在评估根据 hrHPV 的细菌群落组成的变化。我们为每个女性采集了两个样本，两个样本之间的间隔为 12 ± 1 个月，并对其中 66 名女性进行了随访。通过定量 PCR (qPCR) 估计 hrHPV 的病毒载量 (VL)，然后对其进行标准化（使用 HMBS 基因作为参考）并转换为 Log 10 尺度以便于解释。VL 分为阴性，无 hrHPV 拷贝；低，少于 10 0 hrHPV 拷贝；中等，介于 10 0 至 10 2 hrHPV 拷贝之间；高，>10 2 hrHPV 拷贝。通过 Illumina Novaseq PE250 平台描述微生物群组成。多样性分析揭示了 hrHPV VL 的变化，其中低 VL（<10 0 hrHPV 拷贝数）的女性表现出高多样性。群落状态类型 (CST) IV 是最常见的。然而，在高 VL 的女性中，发现与乳酸杆菌耗竭的关联较低。鸡乳杆菌和惰性乳杆菌是高 VL 女性中最丰富的物种，而低 VL 女性表现出乳酸杆菌优势的概率高出 6.06 倍。我们发现 78 种细菌属在低 VL 和高 VL 女性之间的丰度存在显著差异，其中 26 种被耗竭（例如，加德纳菌），52 种增加（例如，支原体）。多级混合效应线性回归显示，由于测量时间和 VL 之间的相互作用，多样性发生了变化，在第二次随访中，低 VL 的女性多样性下降（系数 = 0.47），而中等 VL 的女性多样性增加（系数 = 0.58）。在这里，我们首次报告宫颈微生物群受 hrHPV 拷贝数的影响，其中乳酸杆菌丰度下降、多样性增加和细菌类群丰富与低 VL 女性有关。
细胞学DNA甲基化用于宫颈癌筛查
子宫宫颈癌是全球妇女（1）和中国（2）中与癌症相关死亡的最常见原因之一，中国患者占全球新宫颈癌总数的28％（3）。鲁棒和标准筛查计划将显着降低宫颈癌的发生率（4）。目前，宫颈细胞学和/或高危人乳头瘤病毒（HRHPV）测试是主要筛查方法（5，6）。但是，细胞学和HRHPV测试都在其诊断准确性方面都有局限性（7，8）。一种具有很高准确性和可行性的成本益处对于宫颈癌筛查的决策至关重要（9），并且在中国等发展中国家也迫切需要。DNA甲基化是一种表观遗传机制，可导致基因的遗传沉默，而不会改变其编码序列（10，11）。已有100多个人类（宿主）基因可能是宫颈癌的甲基化生物标志物（12），其中一些基因已得到与宫颈癌发展相关的验证（13）。HPV整合事件下组蛋白修饰的变化与附近基因和内源性逆转录病毒的上调相关（14）。基因分型和甲基化标记是客观的，即使在尿液样本（15）中，也可以与自我获得的样品一起使用（9），在低收入和中等收入设置中具有很大的优势。多个面板已被用作分类器，由数十个候选宿主基因，病毒基因或两者以及其各种组合组成（16）。众多研究表明，甲基化对宫颈上皮内肿瘤（CIN）2或更严重的病变具有有利的筛查敏感性（CIN2+或高级上皮内病变[HSIL]）作为阳性HRHPV状态的女性的三叶叶方法。甲基化测试作为宫颈癌筛查的未来方法之一。但是，大多数研究仅针对宫颈癌筛查程序中甲基化测定的分类作用，而不是其独立的诊断能力。先前的宫颈程序和子宫肾脏或卵巢疾病对细胞学甲基化测定的影响几乎没有得到研究。果酱（连接粘附分子）家族是免疫球蛋白超家族的一部分，对上皮细胞和内皮细胞的紧密连接功能有直接影响（19）。jam3已被广泛研究为粘附和移民的调节剂（20）。最近的研究揭示了JAM3在肿瘤进展过程中肿瘤生长调节中的关键作用（21）。红细胞膜蛋白蛋白4.1像3（EPB41L3），也称为蛋白4.1b/dal-1，是一种膜骨骼蛋白，参与了各种细胞骨架相关的过程。其功能包含单元格