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珊瑚表现出独特的微生物重组模式，以在极端的近海环境中茁壮成长
来自环境更为温和的珊瑚礁栖息地的同种生物。我们分别通过 ITS2 和 16S rRNA 测序研究了全生物生理学以及珊瑚相关微生物（共生藻科和细菌）的可塑性。我们假设泻湖和相邻珊瑚礁栖息地之间的珊瑚相关微生物（共生藻科和细菌）的差异可能支持珊瑚宿主的生产力，并最终支持珊瑚在极端环境中生存的能力。在泻湖中，所有珊瑚物种都表现出降低光合作用与呼吸比率 (P/R) 的代谢调整，但这伴随着高度分化的珊瑚宿主特异性微生物关联。这通过不存在共享的 ITS2 类型谱（共生藻科基因型的代理）得到证实。我们
细胞色素P450酶在植物微生物中的作用...
摘要：细胞色素P450是古老的酶，这些酶在属于所有生命王国（包括病毒）的生物中扩散，其中植物中发现的P450基因数量最多。在哺乳动物中已经广泛研究了细胞色素P450的功能表征，在该哺乳动物中，这些酶参与了药物的代谢以及污染物和有毒化学物质的排毒。这项工作的目的是概述细胞色素P450酶在介导植物与微生物之间相互作用中的作用。最近，几个研究小组开始研究P450酶在植物和（微）生物之间的相互作用中的作用，重点是Holobiont Vitis Vitis vinifera。葡萄藤与大量微生物密切相关，并相互相互作用，从而调节了几种藤蔓生理功能，从生物和非生物胁迫耐受性到收获时的水果质量。
海葵：珊瑚共生研究的模型系统
热带珊瑚礁是世界上最多样化和最具生产力的生态系统之一，支持着一系列生态系统产品和服务，为数百万人的福祉做出贡献。然而，由于当地和全球的人为影响，全球珊瑚礁覆盖率正在下降（ Wilkinson，1999 ）。特别是，全球气候变化导致的大规模白化事件的频率和严重程度预计在未来会进一步增加，并威胁到珊瑚礁的长期生存（ Hughes 等人，2017 ）。这种海洋生态系统的营养和结构基础依赖于石珊瑚和它们相关的微生物共生体（光合甲藻、细菌、古菌等）之间的互利关系，形成一种称为珊瑚全生物的元生物（ Ste ́ venne 等人，2021 ）。尽管人们对珊瑚全生物功能的分子基础有了越来越多的了解，但我们的知识仍然存在重大空白。如果我们要充分了解珊瑚宿主与其微生物共生体之间建立和维持相互作用的潜在基本过程，以及珊瑚是否或如何适应环境干扰并生存下来，就必须揭示珊瑚宿主与其微生物共生体之间相互作用的建立和维持的潜在基本过程。模型生物的使用有着成功的记录，并在分子、细胞和发育生物学方面取得了重大进展（ Jacobovitz 等人，2023 年）。模型生物 Aiptasia，即 Exaiptasia diaphana，是一种小型海葵，遍布亚热带和热带海洋水域，细胞内寄生着共生的甲藻（科：Symbiodiniaceae）（ LaJeunesse 等人，2018 年）。与珊瑚不同，海葵没有碳酸钙骨架，可以在实验室条件下轻松操作和培养，并且可以在兼性共生状态下生存，这允许在非共生对照动物上进行实验（Matthews 等人，2016 年）。自 2008 年正式提出将其作为研究刺胞动物共生的模型系统以来（Weis 等人，2008 年）。越来越多的实验室采用海葵来探索以下研究问题：发育和
病原体的生物和综合控制
都灵大学将组织我们的下一次会议：“从单个微生物到针对一种健康的微生物组”。讨论将以一种健康的整体框架来重点介绍植物疾病的生物控制如何不仅有利于植物，而且还偏爱土壤，动物和人类健康。植物疾病越来越被视为营养不良过程，在该过程中，植物及其共生体代表的Holobiont转向了患病的健康状况，称为病原体。了解这一概念和植物 - 微生物组相互作用将有助于促进新的生物防治解决方案。植物性疾病的生物控制将是针对当前和未来挑战的基础，例如气候变化，可以通过开发弹性的农业系统或农场到叉子策略来减轻这种挑战，该战略提供了一种具体的工具来针对可持续的作物保护。除了生物防治产品外，更多的微生物碱产物还用于农业，例如生物刺激剂，生物肥料和植物增强剂。生物防治剂不仅可以用作微生物产品，而且可以作为天然产品的潜在来源，可用于作物保护。
疾病，健康和不断变化的世界中的珊瑚微生物组
石质珊瑚，礁生态系统的发动机和工程师，面临人为环境变化的前所未有的威胁。珊瑚是构成细菌，古细菌，病毒和真核微生物的多样化社区的Holobionts。最近的研究表明，细菌微生物组在珊瑚生物学中具有关键作用。健康的细菌组合有助于营养循环和压力弹性，但是污染，过度捕获和气候变化会破坏这些共生关系，从而导致疾病，漂白，并最终导致珊瑚死亡。尽管在表征细菌的时空多样性方面取得了进展，但我们才刚刚开始欣赏它们的功能贡献。在这篇综述中，我们总结了细菌与其他Holobiont成员之间的生态和代谢相互作用，突出了影响细菌群落结构的生物和非生物因素，并讨论了气候变化对这些社区及其珊瑚宿主的影响。我们强调基于微生物组的干预措施如何帮助破译珊瑚健康的关键机制并促进珊瑚礁的弹性。最后，我们探讨了如何利用最近的技术发展来应对珊瑚微生物学中一些最紧迫的挑战，从而为该领域的未来研究提供了路线图。
有益木本植物生长和健康的内生真菌研究进展
摘要 近年来，微生物对于植物生存的重要性越来越被人们所认识，内生真菌作为全生物的一部分，可以赋予植物生长优势。多数研究表明，林木内生真菌可以促进宿主植物生长，增加抗逆性，从而提高林木的生存竞争力，但内生真菌对木本植物生长发育有益的例子尚未得到系统的总结。本文从林木有益内生真菌的各个方面（定义、分类、定殖机制等）入手，重点介绍其在木本植物生长、防御生物和非生物胁迫中的有益作用，以及林木对内生真菌的响应。此外，本文还列出了一系列从杉木（Cunninghamia lanceolata）中筛选有益内生真菌并验证其有益功能的试验，探讨它们之间的互利关系。本综述不仅为今后林木有益内生真菌的研究提供了理论基础，而且有助于从分子角度机理理解其对未来森林资源可持续利用和生态环境保护的潜在意义。
使用修改...
沿海和河口环境处于内源性和外生压力下，危害居住的生物群的生存和多样性。多个（a）生物应激源和Holobiont相互作用的可能协同作用的信息在易北河河口大部分缺失，但对于估计对动物生理学的不可预见的影响至关重要。在这里，我们试图利用宿主转录RNA-seq和Gill Mucus Microbial 16S rRNA MetabarCoding数据，并在网络分析方法中结合了生理和非生物测量方法，以反应多个压力源对少数压力源对少数压力的影响，属于Lar eStuaries的Juevenile Sander Lucioperca。我们发现以g组织特异性转录响应为特征的中鞘区域与渗透传感和组织重塑相匹配。肝动物转录组强调，来自高度浊度区域的Zander经历了受损的身体状况支持的饥饿。潜在的致病细菌，包括Shewanella，acinetobacter，Aeromonas和Chryseobacterium，沿淡水过渡和氧气最小区域占据了吉尔微生物组。它们的发生与宿主ill中强烈的适应性和先天的转录免疫反应相吻合，并增强了肝组织中的能量需求，从而支持其潜在的致病性。总体而言，我们证明了信息从将OMIC数据整合到鱼类生物监测到鱼类的生物监测并指出具有疾病潜力的细菌物种所获得的信息。
分散限制的归因可以更好地解释植物菌群的装配模式
解开社区组装过程对于完全了解微生物群在农业生态系统中的功能至关重要。然而，许多植物微生物组调查逐渐揭示了随机过程在与强大的宿主过滤效果相结合的内生根微生物群的组装中占主导地位，这是一个重要的问题。解决此类冲突或不一致不仅有助于准确预测根部内生菌菌群的组成和结构及其驱动机制，而且还为确定性和随机过程在根部内生菌群的组装中的相对重要性和作物生产力和营养性质量和营养性质量和营养性质量和营养质量的相对重要性之间提供了重要的指导。在这里，我们提出，分散限制的不适当划分可能是这种不一致的主要原因，可以在分散限制的比例纳入确定性过程之后可以解决。本文解释了这种调整在微生物组和植物宿主之间形成霍比特的框架下的合理性，并提出了沿土壤 - 植物连续体的内生微生物群动态组装模式的潜在理论框架。考虑到根部生物学微生物群的组装是复杂的，我们建议谨慎和逐步验证从确定性过程到中性成分到中性成分再到随机过程，当决定未来分散限制的归因以促进基于可持续性农业的扩展和应用基于可持续性的农业组成模式，以促进对社区的发展和应用。
洞察珊瑚的细菌分数
与珊瑚宿主相关的摘要细菌是多种多样且丰富的，最近的研究表明，这些共生体参与宿主的弹性对人为应激。尽管具有推定的重要性，但致力于培养珊瑚相关的细菌的工作很少受到关注。结合了已发表和未发表的数据，在这里我们报告了从源自热带，温带和冷水栖息地的珊瑚中分离出的可培养细菌的多样性和功能的全面概述。我们的MetaSurvey考虑了从52项研究中总共3,055个分离株。有1,045个具有全长16S rRNA基因序列，跨越了138个术语，并在proteeobacteria，firmicutes，firmicutes，chitoidetetes和pactinobacteria peryla中描述了138个。我们使用74种菌株的可用基因组和菌株中有益细菌 - 核共生的潜在特征进行了比较基因组分析。我们的分析揭示了。400个生物合成基因簇是抗氧化剂，抗菌，细胞毒性和其他次级代谢物的生物合成的基础。此外，我们发现了可能参与宿主结肠和宿主 - 西姆比恩识别，抗病毒防御机制和/或综合代谢相互作用的基因组特征（以前尚未用于珊瑚 - 杆菌共生剂），我们建议将其作为用于筛选珊瑚雌性筛查的新靶标。我们的结果强调了细菌培养物在阐明珊瑚霍洛皮特功能的重要性，并指导益生菌候选物的选择
高温增加了通过VI型分泌系统
海上温度和热浪的上升对全世界的珊瑚礁构成了重大威胁。属于弧菌属的途径尤其是由于它们与温度相关疾病的关联，后者在人类和珊瑚[1]和珊瑚[2]中均表现出峰值感染率。夏季温度的升高与霍乱病原体的弧菌病原体的爆发爆发相关，突出了温度对弧菌致病性的直接影响[3]，尽管与温度相关感染的特定机制仍然被忽略了。弧菌Coralliilyticus是对温度波动敏感的机会性珊瑚病原体，感染多种珊瑚种类，并对礁生态系统构成全球威胁，尤其是当温度超过27°C时[4]。尽管珊瑚宿主具有多种防御机制，但细菌如V。Coralliilyticus发展了殖民和入侵的多种策略。先前的研究已经探索了这些策略，包括蛋白酶和血素蛋白的分泌，运动能力的调节以及通过预言诱导与共生细菌的竞争[2，5]。在发表在《 PLOS生物学》中发表的研究中，Mass及其同事揭示了V中2型VI型分泌系统（T6SS）的激活。在高温下[6]。他们确定了由T6SS1和T6SS2部署的抗核效应器排放的一系列抗菌效应器（图1），使其能够绕开珊瑚宿主的防御机制。这一发现加强了珊瑚病原体侵入和感染珊瑚的多功能策略。珊瑚微生物组在维持珊瑚健康中起着至关重要的作用。珊瑚动物与光合性内共生鞭毛藻和各种微生物，包括细菌，真菌，古细菌和噬菌体的多种微生物。罗森伯格（Rosenberg