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确定有效益生菌活性的因素
简介：本研究的目的是评估小儿益生菌各种市场产品中包含的细菌盐酸中孵育过程中渗透胁迫的抗性和存活。材料和方法：在研究的第一阶段中，将测试样品以模拟婴儿和大儿童的胃酸环境的不同浓度的不同浓度孵育。研究的第二部分涉及将益生菌微生物暴露于渗透应激条件（4％NaCl溶液中的孵化）。在研究的两个阶段中，在实验过程中的生存微型ISM的数量减少以对数尺度确定，并计算了存活率。结果：益生菌的最佳存活率是在含有细菌菌株最大多样性并由微囊化技术产生的益生菌标本中发现的。最低的表面率是在益生菌标本中发现的，该标本包含传统技术产生的单一益生菌菌株。在具有不同技术产生的益生菌菌株相同多样性的标本中，益生菌细菌的存活率毫无疑问。结论：益生菌市场标本可预期最高的治疗作用，其中包含最高的细菌菌株，并由微囊化技术产生。这项技术保证了益生菌在负酸性和渗透应激条件下的最大生存率。
硫磺梯度沿智利温泉瓷器的温度梯度沿温度梯度的分布和活性
摘要：在陆地温泉中，微生物垫群落的一些成员利用硫化学物种来减少和氧化代谢。在这项研究中，使用拟议的元元方法和特定的apprifiencation and Perpeciogologies and Practififuctation and Perpeci-Omplifuctation and Prifucte and（Apprififucte and Amplififation and apprififation and apprififation and apprififation and prop），在本研究中评估了沿温度梯度（48-69°C）沿温度梯度（48-69°C）评估硫代生物代谢细菌的多样性和活性。 （硫代水解酶）基因。总体而言，硫代谢的关键参与者沿温度梯度大有不同，这与评估与当前全球气候变化情况下与硫循环相关的微型ISMS的可能影响有关。我们的结果强烈表明，硫酸盐还原发生在整个温度梯度中，取决于温度，并由不同的分类单元支持。同化的硫酸盐还原是最相关的途径，而硫磺氧化系统（SOX）在低温下可能更多样化。氯氯氯植物的成员在66℃下显示出较高的硫循环相关转录活性，对硫酸盐还原和对硫代硫酸盐的氧化有潜在的贡献。相比之下，在最低温度（48℃），伯克霍尔德里亚斯（Burkholderiales）和乙酰杆菌（均为假霉菌（Pseudomonadota），也称为蛋白杆菌）在非相似硫酸盐还原/氧化和硫代硫酸盐的代谢方面表现出更高的贡献。蓝细菌和平霉菌在还原性硫酸盐还原方面特别活跃。对APR A和SOX B基因的分析指向Burkholderiales（γ-杆菌）的成员是这些基因的温度梯度沿着温度梯度沿最主要和活跃的。Changes in the diversity and activity of different sulfur-metabolizing bacteria in photoautotrophic microbial mats along a temperature gradient revealed their important role in hot spring environments, especially the main primary producers ( Chloroflexota / Cyanobacteriota ) and diazotrophs ( Cyanobacteriota ), showing that carbon, nitrogen, and sulfur cycles are highly linked in these extreme系统。
在模拟 ERCP 环境中研究创新内窥镜干燥和储存方法的有效性
因为微生物可以在潮湿的表面生长并形成生物膜。在这项实验性非临床研究中，我们研究了一种新型快速干燥方法在再处理十二指肠镜时的有效性。方法在一系列 40 次测试中，在非临床 ERCP 模拟中将三根十二指肠镜暴露于含有四种肠道微生物超生理负荷的人工测试土壤中，然后用 PlasmaTYPHOON 进行再处理和干燥。在自动净化后和用 PlasmaTYPHOON 干燥后立即采集远端尖端和工作通道的培养物。使用氯化钴纸测试和内窥镜检查来评估干燥效果。结果工作通道的污染从净化后的 86.4% 下降到干燥后的 33.6%，其中 94% 的干燥后阳性样本属于一个十二指肠镜。该十二指肠镜工作通道持续受到铜绿假单胞菌污染。另外两台十二指肠镜在净化后的通道样本中仅显示低水平的铜绿假单胞菌，但在干燥后没有。氯化钴试纸测试和内窥镜检查显示良好的干燥效果。结论在净化后的湿式内窥镜中经常发现肠道微生物阳性培养物。PlasmaTYPHOON 是一种有效的快速干燥方法，能够在净化后消灭几乎所有残留的微生物，前提是没有形成生物膜，即使在使用超生理浓度的细菌负荷时也是如此。PlasmaTYPHOON 的临床使用有可能减少内窥镜污染、湿式污染内窥镜的使用，从而降低患者感染的风险。
Yuyan Wang-斯坦福大学Yuyan Wang-斯坦福大学
o北京大学监督学院。2023年12月。2023年11月。2023年11月。o AIBA研讨会，坦普尔大学（Virtual）。2023年10月。2023年9月。2023年8月。2023年6月。o加利福尼亚大学，河滨商学院。2023年2月。2022年11月。o宾夕法尼亚大学沃顿商学院。2022年11月。2022年11月。2022年10月。O2022 Infelss年会。2022年10月。o SC约翰逊商学院，康奈尔大学（Virtual）。2022年10月。2022年10月。O第16届ACM推荐系统会议（Recsys 2022）。2022年9月。2022年9月。2022年9月。2022年6月。
综合和比较生物学
概要海洋哺乳动物在其进化枝中表现出一些最戏剧性的生理适应性，并提供了无与伦比的洞察力，以对相对较短的时间尺度上推动收敛进化的机制。这些适应中的一些，例如对缺氧的极端耐受性和长期的食物剥夺，在大多数限制性哺乳动物中并不常见，并且挑战了已经建立的供应和需求平衡的代谢原则。非靶向的OMICS研究开始揭示此类适应性的遗传基础，但是目前缺乏测试这些动物功能意义的工具。用原代细胞的细胞建模代表了阐明生理适应的分子病因的强大方法，这是在器官中加速基因组至酚类研究的关键步骤，其中不可能转传（例如，大型，较大的，长寿，长期，全面的，全面的，联邦，联邦保护的物种）。原代细胞中的基因扰动研究可以直接评估特定的突变，基因丢失或重复的赋予功能优势，例如海洋哺乳动物中的缺氧或胁迫耐受性。在这里，我们总结了原代细胞中的遗传和药理操纵方法如何在其他非传统哺乳动物物种中进行先进的机械研究，并强调了在海洋哺乳动物中进行此类研究的需求。我们还提供了在模仿体内态的条件下与海洋哺乳动物细胞分离，培养和进行实验的关键注意事项。我们提出，原代细胞培养是进行功能机理研究（例如基因敲低，过表达或编辑）的关键工具，可以提供对海洋哺乳动物生理适应的基因组和有机体水平之间缺失的联系。
PNB设计师：设计用于动物和植物的Prime和Base Editor指南的Web应用程序
抽象背景：CRISPR工具箱通过标记效应子域的快速扩展，以酶促无效CAS9（DCAS9）或Cas9 Nickase（NCAS9）导致了几种有希望的新基因编辑策略。最近的添加包括CRISPR胞嘧啶或腺嘌呤碱基编辑器（CBES和ABES）和CRISPR Prime编辑器（PES），其中脱氨酶或逆转录酶分别融合到NCAS9。这些工具在动物和植物模型中建模并纠正引起疾病的突变的巨大希望。但到目前为止，还没有广泛可用的工具可以自动化BE和PE试剂的设计。结果：我们开发了PNB Designer，这是一种基于Web的PEGR NAS设计的应用程序，用于BES，并指导RNA。PNB设计师使设计定位指向RNA的指南RNA针对跨越多个王国的变体或参考基因组上的单个或多个靶标的指南RNA。与PNB设计师一起，我们设计了PegrNA，以模拟所有已知疾病，从而导致Clinvar可用的突变。此外，PNB设计人员可用于设计指南RNA来安装或恢复SNV，用一个CBE和七个不同的ABE PAM变体扫描基因组，并返回最佳使用。PNB设计师可以在http：//fgcz-shiny .uzh.ch.ch.ch/pnbde signe r/结论上公开访问：结论：使用PNB设计师，我们为CRISPR PE和BE Reagents创建了一种用户友好的设计工具，应该简化选择编辑策略和避免设计并避免设计并进行设计。
睡眠和心血管疾病 - 包裹：沃里克
本综述围绕检查睡眠与心血管疾病（CVD）的相交的最新证据。在本综述中的睡眠将进一步细分，以确定睡眠数量和质量，还将考虑在CVD的背景下，一些更常见的睡眠障碍，例如失眠和阻塞性睡眠呼吸暂停。睡眠障碍已在有睡眠障碍和CVD风险的几个特定种群中进一步探讨。其次，审查将介绍受睡眠和睡眠障碍影响的CVD的一些风险因素，包括高血压，糖尿病和肥胖。它还将检查潜在的基础机械机械，包括炎症，食欲控制，内分泌和遗传过程，这些过程受睡眠和睡眠障碍影响，导致CVD发展的风险增加。此外，我们将考虑睡眠和心血管危险因素之间观察到的双向关系。例如，肥胖症，CVD的危险因素可能会受到睡眠的影响，但反过来又可以增加某些睡眠障碍发育的风险，而睡眠障碍会破坏睡眠，从而导致肥胖发展的进一步风险和CVD风险增加。最后，审查将探讨围绕包括睡眠部分的生活方式干预措施以及如何影响CVD风险因素的管理。将讨论对睡眠不良和睡眠障碍健康影响的认识的需求，以及需要进行政策干预以改善睡眠以促进改善健康和福祉的必要性。
CRISPR-Cas 及其广泛应用
摘要：CRISPR-Cas 系统是一种强大的工具，可用于体内编辑大多数生物（包括人类）的基因组。多年来，该技术已应用于多个领域，例如农业中的作物升级和育种，包括创造无过敏食品、消灭害虫、改良动物品种、生物燃料行业，甚至可以用作基于细胞的记录设备的基础。在人类健康方面的可能应用包括通过创造转基因生物制造新药、治疗病毒感染、控制病原体、临床诊断应用和治疗由体细胞（例如癌症）或遗传（孟德尔遗传病）突变引起的人类遗传疾病。该系统最具争议的可能用途之一是修改人类胚胎，目的是在出生前预防或治疗人类。然而，该领域的技术发展速度快于法规，其巨大但有争议的潜力引起了一些担忧。在这种情况下，需要颁布适当的法律并制定道德准则，以便正确评估这种方法的优势和风险。在这篇评论中，我们总结了这些基因组编辑技术的潜力及其在人类胚胎治疗中的应用。我们将分析 CRISPR-Cas 的局限性以及在治疗胚胎中可能造成的基因组损伤。最后，我们将讨论所有这些如何影响法律、道德和常识。
![arxiv：2206.08336v2 [q-bio.qm] 2023年1月27日](/simg/g:\will\search\icon\source\c\c441eb90dd6affeff4125bfcb809d98667997d48.webp)
arxiv：2206.08336v2 [q-bio.qm] 2023年1月27日
1引言扩展和激活T细胞的肽疫苗已成为一种有希望的预防性和治疗方法，用于应对与健康相关的挑战，包括传染病和癌症（Malonis，Lai，Lai和Vergnolle 2019）。与基于整个器官或基于整个细胞蛋白亚基的整个器官或亚基疫苗相比，肽疫苗是基于一系列的蛋白质碎片（肽），这些蛋白质碎片（肽）具有足够的反应，并且具有更大的反应性，而又一次反应了，这是造成的，而这些反应范围更大，这是造成的，而这些反应是更大的反应，而这些反应是更大的反应（等2014）。肽疫苗的设计包括选择免疫原性蛋白片段，通常称为表位（Li等人2014），当疫苗中包括时会扩大表位时特定的T细胞。机器学习的进步使我们能够预测主要的组织辅助分子（MHC）分子将通过自适应免疫系统进行监视（Ching等人2018，Reynisson等。 2020），可以用来识别将显示哪些表位（Sohail等人。 2021）。 个体所显示的表位取决于其MHC基因的特定等位基因，因此免疫系统显示的肽可能会因个人而异（Zaitouna，kaur，）而有很大差异2018，Reynisson等。2020），可以用来识别将显示哪些表位（Sohail等人。2021）。个体所显示的表位取决于其MHC基因的特定等位基因，因此免疫系统显示的肽可能会因个人而异（Zaitouna，kaur，
海洋浮游植物中的RNA和DNA测量的新双染色技术
RNA：DNA比率已被用作各种海洋器官中生长速率的生化指标（Sutcliffe 1970，Buckley＆Lough 1987，Bulow 1987，Clemmesen 1987，Clemmesen 1987，1988，Clarke等，Clarke等，1988，Raae等。 1988，Mordy＆Carlson 1991），包括Phyto-Plankton（Dortch等人 1983，1985，Mordy＆Carlson 1991）。 由于RNA和DNA的化学相似性，通过经典方法分别量化每种都需要冗长的提取。 此外，通过分光光度法（紫外线浸泡）和量热法（使用RNA和二苯胺的脑甲醇用于DNA）的最终量化很困难，从而使低剂量和干扰因提取其他细胞成分以及除核酸以外的许多细胞成分（例如 Herbert等。 1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1988，Raae等。1988，Mordy＆Carlson 1991），包括Phyto-Plankton（Dortch等人 1983，1985，Mordy＆Carlson 1991）。 由于RNA和DNA的化学相似性，通过经典方法分别量化每种都需要冗长的提取。 此外，通过分光光度法（紫外线浸泡）和量热法（使用RNA和二苯胺的脑甲醇用于DNA）的最终量化很困难，从而使低剂量和干扰因提取其他细胞成分以及除核酸以外的许多细胞成分（例如 Herbert等。 1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1988，Mordy＆Carlson 1991），包括Phyto-Plankton（Dortch等人1983，1985，Mordy＆Carlson 1991）。 由于RNA和DNA的化学相似性，通过经典方法分别量化每种都需要冗长的提取。 此外，通过分光光度法（紫外线浸泡）和量热法（使用RNA和二苯胺的脑甲醇用于DNA）的最终量化很困难，从而使低剂量和干扰因提取其他细胞成分以及除核酸以外的许多细胞成分（例如 Herbert等。 1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1983，1985，Mordy＆Carlson 1991）。由于RNA和DNA的化学相似性，通过经典方法分别量化每种都需要冗长的提取。此外，通过分光光度法（紫外线浸泡）和量热法（使用RNA和二苯胺的脑甲醇用于DNA）的最终量化很困难，从而使低剂量和干扰因提取其他细胞成分以及除核酸以外的许多细胞成分（例如Herbert等。 1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心Herbert等。1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1971，Cattolico 1978）。可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1968，Thoresen等。1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异1983，Clemmesen 1988）。例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。（1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。RNA con-中心