单剂量静脉注射 XMT-2056 治疗可导致体内表达不同水平 HER2 的多种肿瘤模型中的肿瘤消退。靶向大鼠 HER2 的 XMT-2056 替代 ADC 用于同源 mBR9013(表达大鼠 HER2 的 GEMM 衍生肿瘤模型)和 EMT6-大鼠 HER2(经设计表达大鼠 HER2 的 EMT6)模型。ADC 和 HT-19(未偶联抗体)剂量基于抗体。* mRNA 表达基于 RSEM;Log2 转换。来自 DepMap 21Q2(公共),Broad Institute(2021 年)。# 使用 HALO 多重 IHC 软件构建的 HER2 算法进行图像分析。TPS = 肿瘤比例评分。
注意:第 27 天 22Rv1 肿瘤切片中 H3K27me3 IHC 阳性细胞的定量图像分析。单因素方差分析,然后进行 Tukey 多重比较检验。****,p<0.0001;TGI 86%;肿瘤生长抑制 (TGI) = [1 - (TVtf - TVt0) / (TVcf - TVc0)] × 100%;用载体 (n=3) 或 ORIC-944 200 mpk QD (n=4) 处理的 22Rv1 异种移植瘤的 RNA 测序以评估来自转移性前列腺肿瘤的 87 基因多梳抑制特征 (Yu 等人,Cancer Res 2007);ORIC-944 与载体,t 检验:*,p<0.05。
记录为“低”,低于一个标准差的记录为“未检测到”。没有表达值的蛋白质被记录为“不可用”丰度。从 IHC 获得的人体组织蛋白表达谱的自然格式是上述五个类别,因此没有调整。而对于从 HPA、GTEx 和 FANTOM5 整合的 RNA 共识表达谱,20 到 40 之间的共识标准化表达 (NX) 值被记录为“中”,高于此阈值的 NX 值被记录为“高”。同样,1-20 范围内的 NX 值被记录为“低”,低于
肺癌是癌症相关死亡的主要原因,每年全球约有 176 万人死于肺癌。间变性淋巴瘤激酶 ( ALK ) 和 c-ROS 致癌基因 1 ( ROS1 ) 基因融合是非小细胞肺癌 (NSCLC) 中公认的关键因素。尽管它们的发生频率相对较低,但它们的检测对于治疗决策和靶向治疗的实施至关重要。用于检测它们的公认方法是免疫组织化学 (IHC) 和荧光原位杂交 (FISH) 检测,以及基于 DNA 和 RNA 的测序检测。在这里,我们提出了一种基于图像的解决方案,可直接从苏木精和伊红 (H&E) 染色的病理切片图像进行分子分析。
摘要 背景 错配修复缺陷 (dMMR) 是免疫检查点阻断 (ICB) 反应的一个公认的生物标志物。将 MMR 熟练 (pMMR) 转化为 dMMR 表型以使肿瘤对 ICB 敏感的策略受到高度追捧。含溴结构域 4 (BRD4) 抑制和 ICB 的结合提供了有希望的抗肿瘤作用。然而,其潜在机制仍然未知。在这里,我们发现 BRD4 抑制会在癌症中诱导持续的 dMMR 表型。方法我们通过对癌症基因组图谱和临床蛋白质组肿瘤分析联盟数据进行生物信息学分析以及对卵巢癌标本的免疫组织化学 (IHC) 评分进行统计分析,证实了 BRD4 与错配修复 (MMR) 之间的相关性。通过定量逆转录 PCR、蛋白质印迹和 IHC 测量 MMR 基因 (MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)。通过全外显子组测序、RNA 测序、MMR 检测和次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶基因突变检测确认 MMR 状态。在体内和体外诱导 BRD4i AZD5153 耐药模型。通过细胞系之间的染色质免疫沉淀和来自 Cistrome 数据浏览器的数据研究了 BRD4 对 MMR 基因转录的影响。在体内证明了对 ICB 的治疗反应。通过流式细胞术测量了肿瘤免疫微环境标志物,例如 CD4、CD8、TIM-3、FOXP3。结果我们在转录和翻译方面确定了 BRD4 和 MMR 基因之间的正相关性。此外,BRD4 转录抑制会降低 MMR 基因表达,导致 dMMR 状态和突变负荷升高。此外,长期暴露于 AZD5153 可在体内和体外促进持久的 dMMR 特征,增强肿瘤的免疫原性,并且尽管获得了耐药性,但仍增加了对 α - 程序性死亡配体-1 疗法的敏感性。
CD8 (sc-1177,Santa Cruz Biotechnology)、抗 NK1.1 (14-5941-82C,eBioscience) 和抗 F4/80 (sc- 377009,Santa Cruz Biotechnology) 抗体。免疫组织化学 (IHC) 使用 MACH4 通用 HRP 聚合物检测系统 (BRI4012H,Biocare Medical) 和苏木精溶液 Gill II (GHS232,Sigma-Aldrich) 进行,如前所述 [24],最后,使用 Aperio ScanScope AT (数字幻灯片扫描仪,Leica Biosystems Inc) 获取全幻灯片数字图像。使用 NIH ImageJ (版本 1.52p) 进行定量分析,并以相对光密度表示。此外,通过使用抗 IFN-γ(505802,
背景 免疫系统对癌症疗法的反应可以表明患者在治疗后是否会有积极的结果。了解肿瘤微环境 (TME) 在肿瘤发生和治疗反应过程中如何演变对于开发个性化治疗以改善癌症治疗至关重要。借助强大而全面的多重成像技术,免疫生物标志物可用于检测髓系和淋巴细胞谱系和结构,当与特定的肿瘤生物标志物结合时,可以捕捉各种肿瘤中 TME 内的免疫反应。细胞类型特异性生物标志物的可用性,加上使用多重组织成像进行检测的能力,为免疫细胞群和 TME 中许多细胞类型的空间细胞相互作用提供了前所未有和新颖的见解。Cell DIVETM 多重成像解决方案允许通过迭代染色和染料失活工作流程探测和成像整个单个组织切片上的数十种生物标志物。从本质上讲,Cell DIVE 是一种精确且适应性强的开放式多路复用解决方案,可灵活选择多路复用成像研究中使用的生物标志物组的抗体。Cell Signaling Technology (CST) 拥有广泛的经 IHC 验证的抗体产品组合,可检测 TME 中的关键蛋白质,从而实现组织中的免疫细胞检测和表型分析。CST 提供已验证可用于 Cell DIVE 的现成 (OTS)、可立即发货的抗体偶联物,并提供经 IHC 验证的抗体与荧光团和其他检测试剂的定制偶联物。CST 采用严格的方法进行 IHC 验证,然后在 Cell DIVE 平台上进行验证,以确保成功检测蛋白质。在这里,我们展示了使用多种组织类型的数十种 CST 生物标志物的新面板进行多路复用 Cell DIVE 成像。方法 使用 4 通道加 DAPI 中的各种生物标志物偶联抗体 (Cell Signaling Technology) 对切片进行染色,并使用 Cell DIVE 进行成像。使用 Cell DIVE 工作流程 (Leica Microsystems) 完成多轮染色和成像。结果 开发多路复用面板需要最少的优化,能够识别复杂的细胞类型并揭示它们在肿瘤微环境中的细胞间相互作用。结论 多路复用全切片成像可以深入分析免疫细胞谱系,并为肿瘤微环境中的免疫和肿瘤细胞间相互作用提供新的见解。
大多数脑膜瘤被归类为1级,通常遵循良性课程。但是,当形态学上1级脑膜瘤侵入相邻的脑组织时,它们被重新分类为世界卫生组织(WHO)2级肿瘤,这会使预后恶化。肿瘤细胞入侵相邻结构需要细胞外基质(ECM)降解并减少细胞间粘附。基质金属蛋白酶9(MMP9)是参与ECM降解的关键蛋白,而E-钙粘着蛋白在维持细胞间粘附方面起着至关重要的作用。这项研究旨在比较MMP9和E-钙粘着蛋白在形态学上的1级脑膜瘤中的免疫组织化学(IHC)表达,并没有脑部入侵,并评估其表达与脑侵入之间的相关性。使用Soetomo General Academic Hospital诊断出患有1级脑膜瘤的患者的福尔马林固定的,石蜡包裹的组织样品进行了一项横截面设计的分析观察性研究。这项研究包括43名受试者,分为两组:脑膜侵袭(n = 20)和无脑部入侵的脑膜瘤(n = 23)。对MMP9和E-钙粘着蛋白进行 IHC染色,并使用H得分系统评估表达水平。 使用Mann-Whitney检验进行统计分析。 两组之间的MMP9表达没有显着差异(p = 0.08),尽管在脑膜瘤中有脑浸润的脑膜瘤中较高表达的趋势。 相比之下,与没有脑浸润的脑膜瘤相比,E-钙粘蛋白的表达显着降低(p <0.001)。IHC染色,并使用H得分系统评估表达水平。使用Mann-Whitney检验进行统计分析。 两组之间的MMP9表达没有显着差异(p = 0.08),尽管在脑膜瘤中有脑浸润的脑膜瘤中较高表达的趋势。 相比之下,与没有脑浸润的脑膜瘤相比,E-钙粘蛋白的表达显着降低(p <0.001)。使用Mann-Whitney检验进行统计分析。两组之间的MMP9表达没有显着差异(p = 0.08),尽管在脑膜瘤中有脑浸润的脑膜瘤中较高表达的趋势。相比之下,与没有脑浸润的脑膜瘤相比,E-钙粘蛋白的表达显着降低(p <0.001)。降低的E-钙粘蛋白表达与1级脑膜瘤中的脑浸润密切相关,并且可以作为这种攻击行为的预测指标。MMP9表达未达到统计学意义,但观察到的趋势需要进一步研究。这些发现突出了e-钙粘着蛋白在脑膜瘤进展中的潜在作用及其作为预后标记的效用。
描述将保留和共享项目的哪些科学数据,并为该决定提供理由。上述科学数据类型将根据存储库要求与协议和元数据共享,以便其他研究人员可以再现它们和/或产生新的假设。将生成的文件类型包括但不限于 *.docs, *.xls, *.pdf, *.cdx, *.mol)。具体来说,化学结构,合成工作流和分析化学将被上传为PDF文件。药物和分析化学测量将在电子表格和图表上进行处理和共享。用于组织病理学和免疫组织化学(IHC)实验,我们将保留图像和过程,并总结电子表格和图表上的数据。PET成像将作为PET/CT图像共享。C.元数据,其他相关数据和相关文档:
摘要 目的 揭示必需转录因子 PU.1 在类风湿关节炎 (RA) 发展中的作用和潜在机制。方法 通过蛋白质印迹和免疫组织化学 (IHC) 染色确定 RA 患者滑膜中 PU.1 及其潜在靶标 FMS 样酪氨酸激酶 3 (FLT3) 的表达和定位。使用 UREΔ(PU.1 敲低)和 FLT3-ITD(FLT3 激活)小鼠建立胶原抗体诱导性关节炎 (CAIA)。对于体外研究,使用 siRNA 研究了 PU.1 和 FLT3 对原代巨噬细胞和成纤维细胞样滑膜细胞 (FLS) 的影响。从机制上讲,进行了荧光素酶报告基因检测、蛋白质印迹、FACS 和 IHC,以显示 PU.1 对巨噬细胞和 FLS 中 FLT3 转录的直接调控。最后,使用 PU.1 的小分子抑制剂 DB2313,通过两种体内模型(CAIA 和胶原诱导性关节炎 (CIA))进一步说明 DB2313 对关节炎的治疗作用。结果与骨关节炎患者和正常对照相比,RA 患者的滑膜中 PU.1 的表达被诱导。与 RA 中的 PU.1 相比,FLT3 和 p-FLT3 表现出相反的表达模式。CAIA 模型表明,PU.1 是体内关节炎发展的激活剂,而 FLT3 是抑制剂。此外,体外测定结果与体内结果一致:PU.1 促进巨噬细胞和 FLS 的过度活化和炎症状态,而 FLT3 具有相反的作用。此外,PU.1 通过直接结合其启动子区来抑制 FLT3 的转录。 PU.1 抑制剂 DB2313 明显减轻了 CAIA 和 CIA 模型中对关节炎发展的影响。结论这些结果支持 PU.1 在 RA 中的作用,并且可能通过直接抑制 FLT3 产生治疗意义。因此,针对 PU.1 可能是 RA 的潜在治疗方法。