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JRSEEK：人工智能符合病毒中的果冻roll折叠分类
jrseek：人工智能在病毒中遇到果冻卷折叠分类，杰森·E·桑切斯（Jason E. Sanchez）1，温汉·朱2（Wenhan Guo 2），丘奇安格李3，林李3 *，chuan xiao 2 * 1计算科学系，德克萨斯大学El Paso，El Paso，El Paso，El Paso，TX 2德克萨斯大学埃尔帕索分校的物理学，德克萨斯州埃尔帕索 *通信：电子邮件：lli5@utep.edu; cxiao@utep.edu关键字病毒；人工智能;机器学习；果冻卷；病毒结构摘要果冻卷（JR）折叠是病毒的衣壳和核蛋白质中发现的最常见的结构基序。其在许多不同病毒家族的动机中的普遍性开发了一种工具来预测其从序列中的存在。在当前的工作中，在六个不同的大语模型（LLM）嵌入训练的逻辑回归（LR）模型在将JR与非JR序列区分开时表现出超过95％的精度。用于训练和测试的数据集包括来自单个JR病毒，非JR病毒和非病毒免疫球蛋白样β-三明治（IGLBS）蛋白的序列，这些蛋白与JR结构上非常相似。鉴于病毒家族之间的低序列相似性和数据集的平衡性质，高精度尤其显着。同样，模型的准确性与LLM嵌入无关，这表明预测病毒JR折叠的峰精度更多地取决于数据质量和数量，而不是使用所使用的特定数学模型。鉴于许多病毒式衣壳和核素结构尚未解决，因此使用基于序列的LLMS是一种有前途的策略，可以轻松地应用于可用数据。Bert-U100嵌入的主成分分析表明，大多数IGLBS序列和JR和非JR序列的一个子集甚至在应用LR模型之前也可以区分，但是LR模型对于区分更歧义序列的子集是必要的。应用于双JR折叠时，BERT-U100模型能够为某些病毒家族分配JR图案，从而提供了该模型可推广性的证据。对于其他家庭而言，没有观察到这种概括性，激发了未来开发以双JR折叠告知的其他模型的需求。最后，BERT-U100模型还能够预测未分类病毒数据集中的序列是否产生JR倍数。给出了两个示例，JR预测由AlphaFold3证实。总的来说，这项工作表明JR折叠可以从其序列中预测。
SAJRS 2025 摘要书.pdf
摘要 9 OP01：通过小胶质细胞清除神经丝轻链以及小胶质细胞状态对生物标志物解释的影响（C Heiss、L Grötschel、E Rembeza、L Montoliu-Gaya、J Gentile、S Vallabh、E Minikel、H Zetterberg、S Fruhwürth）....................................................................................................................................... 10 OP02：揭示 CACNA1C 及其风险变异对双相情感障碍神经发育的影响（Melis Çelik、Mahnaz Nikpour、Bingqing He、Berta Marcó de La Cruz、Vika Telle、Parvaneh Nikpour、Lina Jonsson、Carl M. Sellgren、Mikael Landén、Erik Smedler）11 OP03：一种统治方式 商场？比较淀粉样蛋白、tau 和 FDG PET 对不同认知领域衰退的预测（S Karagianni、A Moscoso、M Schöll）12 OP04：单次或两次炎症损伤对小胶质细胞激活状态的差异和时间效应（Andrew S. Naylor、Christina Heiss、Henrik Zetterberg、Stefanie Fruhwürth）13 OP05：围产期接触表皮葡萄球菌是导致晚年自闭症的潜在因素（WK Chan、SMJ Shiadeh、S. Rasmusson、T. Chumak、C. Mallard 和 M. Ardalan）........................................................................................................................................................................................................ . . . . . . 14 OP06：BDC：推进微生物学方法及其临床和研究应用（E. Rudbeck、D. Schmidta、S. Thankaswamy Kosalaia、S. Abrahamssona、GP Di Santo Meztlera）. . . . . . . . . . . . . . . . . 15 OP07：利用金属蛋白酶进行子宫生物工程预处理支架：它会影响细胞相容性和免疫原性吗？ （De Miguel-Gómez L、Sehic E、Thorén E、Johannsson L、Hellström M、Brännström M）。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 16 OP08：频繁疼痛在患有注意力缺陷多动障碍 (SSB Berggren) 症状的 10-11 岁儿童中很常见。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 17 OP09：前列腺癌细胞外囊泡递送的 miRNA 可能智能地调控骨转移 ( Lijuan Yu, Roger Olofsson Bagge, Toshima Parris, Jiayun Liu, Xiaoke Hao, Lei Zheng ) ........................................................................................................................................................................................................ 18 OP10：平衡 KRAS 突变 III 期 NSCLC 患者的预后差异：将 durvalumab 添加到联合放化疗中可提高生存率（Ella A. Eklund、Mathilda Orgard、DeliceWallin、Sama I.Sayin、HenrikFagman、JohanIsaksson、SukanyaRaghavan、Levent M Akyürek、Jan Nyman、Clotilde Wiel、Andreas Hallqvist*、Volkan I. Sayin）... 19
Leena Matikainen, Milo š Pand ž ic´, Fashuai Li, Kirsi Karila, Juha Hyyppä, Paula Litkey, Antero Kukko, Matti Lehtomäki, Mika Karjalainen, Eetu Puttonen，“利用多时相多光谱机载激光扫描，Sentinel-2，和移动激光扫描在地图更新中的应用，”J. Appl。遥感. 13 (4), 044504 (2019), doi: 10.1117/1.JRS.13.4.044504。
摘要。遥感技术的快速发展为进一步发展目前主要基于被动航空图像的全国测绘程序提供了有趣的可能性。特别是，我们假设多时相机载激光扫描 (ALS) 在地形测绘方面具有巨大的未被发现的潜力。在本研究中，首次测试了多时相多光谱 ALS 数据的自动变化检测。结果表明，直接比较不同日期的高度和强度数据可以揭示与郊区发展相关的微小变化。未来工作的主要挑战是将变化与地图制作中感兴趣的对象联系起来。为了在未来的测绘中有效利用多源遥感数据，我们还研究了卫星图像和地面数据补充多光谱 ALS 的潜力。开发并测试了一种从 Sentinel-2 卫星图像时间序列中进行连续变化监测的方法。最后，使用地面移动激光扫描获取高密度点云并自动将其分为四类。将结果与 ALS 数据进行比较，并讨论了不同数据源在未来地图更新过程中可能发挥的作用。© 作者。由 SPIE 根据 Creative Commons Attribution 4.0 Unported 许可证发布。全部或部分分发或复制本作品需要完全署名原始出版物，包括其 DOI。[DOI：10.1117/1.JRS.13.4.044504]
联合区域战略 (JRS) - 美国国家南亚和中亚事务局 (SCA) 和美国国际开发署亚洲局
3. 局目标和宗旨 ................................................................................................................ 6
原始引文：Kapur, Narinder, Parand, Anam, Soukup, Tayana, Reader, Tom W. 和 Sevdalis, Nick (2015) 航空与医疗保健：对患者安全影响的比较评论。JRSM Open，7 (1)。 ISSN 2054-2704 DOI：10.1177/2054270415616548 允许通过 Creative Commons 许可重复使用此项目：
摘要 航空安全经常与医疗保健安全进行比较。在本期刊最近发表的一篇文章之后，英国政府成立了独立患者安全调查服务机构，以效仿航空领域类似的成熟机构。在详细审查了在航空实践背景下研究患者安全的相关出版物的基础上，我们制定了一个比较特征表和患者安全概念框架。得出并记录了航空和医疗保健领域安全相关行为的趋同和分歧。出现的关键安全相关领域包括清单、培训、机组资源管理、无菌驾驶舱、事件调查和报告以及组织文化。我们得出的结论是，虽然医疗保健在某些关键领域可以从航空业学到很多东西，但将航空业的经验教训转移到医疗保健行业需要细致入微，要考虑到医疗保健的具体特点和需求。根据本次审查，建议医疗保健行业应效仿航空业，为专门研究人为因素和患者安全和员工福祉相关心理方面的员工提供资源。专业和资格后员工培训可以特别包括认知偏差避免培训，因为这似乎在许多与患者安全和员工福祉有关的错误中发挥着关键作用。