替代蛋白(AltProts)代表了一种新认识的生物活性蛋白,这些蛋白质是根据已经注释的基因中的替代开放式阅读框(ALTORF)编码的。这项研究的重点是SLC35A4基因,该基因编码参考蛋白SLC35A4和替代蛋白AltSLC35A4。结合了显微镜和生化分析,我们证实了内部线粒体膜中AltSLC35A4的存在,从而解决了先前的相互矛盾的报告。先前采用核糖体分析的研究表明,在砷钠诱导的氧化应激期间,SLC35A4的参考编码序列在所有细胞mRNA中的转化效率上的提高最大。我们的结果证实了这种翻译的上调,在氧化应激期间以上游ORF依赖性方式出现了SLC35A4蛋白同工型。值得注意的是,在氧化应激期间,AltSLC35A4的表达保持不变。敲出SLC35A4以可救出的方式增强对氧化应激的敏感性,表明对SLC35A4在应力抗性中的直接影响。总而言之,我们的研究为SLC35A4双重编码性质的功能意义提供了令人信服的证据,以抗氧化应激,并突出了在真核基因功能研究中考虑AltProts的重要性。
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一组蛋白质是运输(ESCRT)所需的内体分选复合物,在膜重塑中起着至关重要的作用,这是一种涉及细胞膜重排的细胞过程。理解和控制ESCRT的特定部分由于其复杂的组织而具有挑战性。在这里,我们描述了一种天然产物 - 例如复合触觉,专门破坏了ESCRT的特定部分,称为IST1 -CHMP1B复合物。使用触觉素作为化学工具,我们研究了该复合物如何有助于不同的膜重塑事件。有趣的是,诱使诱导非规范的LC3脂质 - 涉及失速内体的非规范自噬(自饮食)的过程。这一发现进一步丰富了我们对ESCRT功能的理解,并强调了小分子作为揭示复杂生物学机制的宝贵工具的重要性。
缩写:3C,染色体构象捕获;4C,环状染色体构象捕获;ATAC-seq,使用测序检测转座酶可及染色质;Cas9,来自化脓性链球菌的内切酶;CHIP-seq,染色质免疫沉淀和 DNA 测序;CRISPR,成簇的规律间隔的短回文重复序列;CTCF,CCCTC 结合因子;EXT1,外骨化素糖基转移酶 1;GSIS,葡萄糖刺激的胰岛素分泌;GWAS,全基因组关联研究;MED30,RNA 聚合酶 II 转录亚基 30 的介质;pcHi-C,启动子捕获 Hi-C;R,调控区;RAD21,双链断裂修复蛋白 rad21 同源物;SLC30A8,溶质载体家族 30 成员 8;SNP,单核苷酸多态性; T2D,2 型糖尿病;TAD,拓扑关联结构域;UTP23,UTP23 小亚基加工体成分。
1参见第35页:2019年6月5日,欧洲议会和理事会的指令(EU)2019/ 944-关于电力和修订指令的共同规则2012/27/ eu(europa.eu)2请参阅第7页。 2019年,英国政府通过了法律上的立法,到2050年,零温室气体排放的目标。苏格兰政府还立法为2045年设定零净目标,威尔士政府打算引入立法,以修改其现有的2050年目标,以实现零排放净。
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成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 和 CRISPR 相关蛋白 (Cas9) 系统是一种适应性免疫反应防御机制,古细菌和细菌利用该机制降解外来遗传物质 (4,6)。该机制可重新用于其他功能,包括哺乳动物系统的基因组工程,例如基因敲除 (KO) (1,2,3,5)。CRISPR/Cas9 KO 质粒产品利用来自 Broad 研究所张实验室开发的全基因组 CRISPR 敲除 (GeCKO) v2 库的向导 RNA (gRNA) 序列,能够识别和切割特定基因 (3,5)。
