然后,我们对磷酸肽丰度谱进行了 k 均值聚类,以比较两种细胞培养物之间蛋白质磷酸化的动态变化(图 1d,扩展数据图 2a)。在簇 2 和簇 3 中观察到了最大的差异,其特征是在系统素处理后 1 分钟内磷酸化迅速且短暂地下降。这些簇中不到 20%(198)的肽来自 syr1,而来自系统素反应野生型的肽则超过 80%(1036)(图 1c)。然后,我们检查了这 1036 个肽在 syr1 细胞中是否显示出随时间变化的磷酸化变化,如果是,它们属于哪个簇。我们在除 2 和 3 之外的所有簇中都发现了它们;它们都没有在处理后 1 分钟显示出系统素引起的丰度下降(图 1e)。数据表明,SYR1 介导的系统素反应以细胞蛋白质快速、瞬时去磷酸化为特征,这意味着蛋白磷酸酶在系统素信号传导早期就被激活。
然后,我们对磷酸肽丰度谱进行了 k 均值聚类,以比较两种细胞培养物之间蛋白质磷酸化的动态变化(图 1d,扩展数据图 2a)。在簇 2 和簇 3 中观察到了最大的差异,其特征是在系统素处理后 1 分钟内磷酸化迅速且短暂地下降。这些簇中不到 20%(198)的肽来自 syr1,而来自系统素反应野生型的肽则超过 80%(1036)(图 1c)。然后,我们检查了这 1036 个肽在 syr1 细胞中是否显示出随时间变化的磷酸化变化,如果是,它们属于哪个簇。我们在除 2 和 3 之外的所有簇中都发现了它们;它们都没有在处理后 1 分钟显示出系统素诱导的丰度下降(图 1e)。数据表明,SYR1 介导的系统素反应以细胞蛋白质快速、瞬时去磷酸化为特征,这意味着蛋白磷酸酶在系统素信号传导早期就被激活。
