Labeo

Rohu Carp，Labeo Rohita的高质量染色体水平基因组组装及其在基于SNP的基因流量和性别测定的探索中的利用

Labeo Rohita（Rohu）对南亚的水产养殖很重要，其生产量接近大西洋鲑鱼。虽然对Rohu的遗传改善正在进行中，但在Rohu中，在其他水产养殖改善计划中常用的基因组方法已被阻止，部分原因是缺乏高质量的参考基因组。在这里，我们提出了使用下一代测序技术组合产生的高质量的从头基因组，从而产生了946 MB基因组，该基因组由25个铬虫和2,844个未放置的支架组成。值得注意的是，虽然大约是现有基因组序列的大小的一半，但我们的基因组代表了使用流量细胞仪新估计的基因组大小的97.9％。与该基因组结合使用了120个个体的测序，以预测三个主要河流（Jamuna，Padma和Halda）中的种群结构，多样性和差异，以推断Rohu中可能的性别确定机器。这些结果证明了新的Rohu基因组在现代化Rohu遗传改善计划的某些方面的实用性。