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从superString到索引：使用蒙版洞穴 - 轮毂转换（MBWT）
DNA测序数据的指数增长需要有效的解决方案，以存储和查询大规模𝑘 -MER集。虽然最近的索引方法使用频谱的弦乐集（SPS），全文索引或哈希，但它们通常会施加结构性约束或需求广泛的参数调整，从而限制了其在不同数据集和数据类型上的可用性。在这里，我们提出了FMSI，这是一种最小的参数，高度空间效率的成员索引和压缩字典，用于任意𝑘 -MER集。fmsi将近似最短的超级弦与蒙面的洞穴 - 轮毂变换（MBWT）结合在一起。与传统方法不同，FMSI在没有预定义的假设上进行操作，而对𝑘 -mer重叠模式则可以利用它们。我们证明，与第二好的竞争对手相比，FMSI比SSHASH，SBWT和CBL等已建立的索引提供了卓越的存储效率，其空间节省最高为2-3倍，具体取决于数据集，𝑘 -MER大小，采样，采样和基因组复杂性，同时支持快速成员和词典成员和义务质量。总体而言，这项工作将基于超弦的索引作为基因组数据的高度通用，灵活且可扩展的方法，并在Pangenomics，宏基因组学和大规模基因组数据库中进行了直接应用。
志愿者职位描述项目协调员，虚拟咖啡聊天小组背景：华盛顿大学医学记忆与大脑健康中心 (MBWC) 宣传片
志愿者职位描述项目协调员，虚拟咖啡聊天小组背景：华盛顿大学医学记忆与大脑健康中心 (MBWC) 通过提供卓越的护理、推进科学理解和临床最佳实践以及建立痴呆症友好社区，促进记忆丧失患者及其家人的福祉。作为其使命的一部分，MBWC 为社区提供各种教育、支持和社交参与计划——包括虚拟咖啡聊天。虚拟咖啡聊天是每周为记忆丧失患者举行的在线社交聚会。它于周二上午 10 点至 11 点通过 Zoom 进行。它提供了一个社交联系的机会，并有机会结识其他了解记忆丧失生活的人。一个典型的小组以破冰问题开始，然后轮流分享每个小组成员的近况。虽然该小组最初是为了应对疫情而成立的，但小组成员要求它继续作为一项持续的 MBWC 计划——并指出虚拟格式使整个地区的更多参与者可以访问它。我们目前正在寻找志愿者项目协调员来支持这一持续需求。职位名称：项目协调员、虚拟咖啡聊天主管：Marigrace Becker，MSW，社区教育与影响项目经理。206.744.2190，mbecker1@uw.edu。职责：志愿者项目协调员与联合协调员合作领导这个每周的虚拟项目。根据每周参与的人数，联合协调员可以一起工作，也可以分成两个分组讨论室。职责包括建立和维护积极包容的小组环境、欢迎新人、提出破冰问题、促进小组讨论、建立小组融洽关系、计时、管理 Zoom 会议和解决任何技术问题，并向项目经理报告任何问题。根据兴趣/经验，可能承担其他职责。时间投入/时间表：