基础谱系特征的存在表示乳腺,膀胱和胰腺的超侵略性人腺癌。然而,维持这种异常细胞状态的生化机制知之甚少。在这里,我们进行了基于标记的遗传筛选,以搜索维持胰腺导管腺癌(PDAC)中基础身份所需的因素。这种方法揭示了Med12是该疾病基底细胞状态的强大调节剂。使用生化重构和表观基因组学,我们表明MED12通过桥接转录因子ΔNP63(基底谱系的已知主调节剂)通过介体复合物激活谱系特异性增强子元素来实现此功能。与这一发现一致,与缺乏基础特征的PDAC细胞相比,基底样PDAC的生长对MED12的损失非常敏感。综上所述,我们的遗传筛选显示了一种生化相互作用,该相互作用在人类癌症中具有基础认同,这可以作为肿瘤谱系指导的治疗剂的靶标。
。CC-BY 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经同行评审认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2024年1月25日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2024.01.22.576603 doi:Biorxiv Preprint
常规检验α-肌血症(TPSAB1和TPSB2)淀粉样变性(家族性,TTR)AS,Angelman综合征NaApeceped(AIRE)Beckwith-Wiedemann(BWS)恶性。黑色素瘤(CDKN2A)NaEGFR突变(T790M等)在CtDNA上(仅在Streck Bct或Paxgene DNA管中)FG(Keller Clanslome,Med12)NaHblrg,Gilbert综合征(UGT1A1)naHblrg,她差异。胃癌(CDH1)Na na hed,低蛋白外胚性发育不良(EDA)HFE-HH,HERED。
在微级量表上控制pH值可能对研究,医学和行业的应用很有用,因此代表了合成生物学和微流体的宝贵应用。提出的囊泡系统将不同的颜色转化为周围溶液中特定的pH值变化。它可以与两个轻驱动的质子泵细菌紫红质和蓝色的光吸收蛋白淡淡的蛋白质Med12一起使用,它们在脂质膜上以相反的方向定向。计算机控制的测量设备实现了一个反馈循环,以自动调整和维护所选的pH值。可以建立跨越两个单元的pH范围,从而提供时间和pH分辨率。作为一个应用示例,呈pH敏感的酶反应,在浅色控制反应进展的情况下。总而言之,使用工程蛋白质体的浅色控制的pH调节为在微级别的不同情况下(例如合成生物学应用中)打开了新的可能性,以在微层尺度上控制过程。
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组:AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1
1 Cold Spring Harbour Laboratory,Long Island,NY 11724,美国; habowsk@cshl.edu(A.N.H.); poornim@cshl.edu(D.P.B.); caligiu@cshl.edu(G.C。)2美国盐湖城汉斯曼癌症研究所肿瘤科学系,美国盐湖城,美国犹他州84112; sandra.scherer@hci.utah.edu 3儿童研究所和德克萨斯大学西南部达拉斯大学的儿科,美国德克萨斯州75235,美国; Arin.aurora@utsouthwestern.edu 4 Jackson Laboratory,Farmington,CT 06032,美国; Bill.Flynn@jax.org 5美国俄勒冈州健康与科学大学肿瘤学科学系,美国97239; langere@ohsu.edu 6美国俄勒冈州俄勒冈州健康与科学大学外科系,美国97239; Brodyj@ohsu.edu 7分子与医学遗传学系,俄勒冈州健康与科学大学,波特兰,美国97239,美国; searsr@ohsu.edu 8 Ospedale San Raffaele,20054年意大利米兰; foggetti.giorgia@hsr.it 9 New Haven,纽黑文市CT 06520,内科。 anna.arnal@yale.edu 10病理学系,耶鲁大学,纽黑文,CT 06520,美国; don.nguyen@yale.edu(d.x.n. ); katerina.politi@yale.edu(K.A.P。) 11 Terasaki生物医学创新研究所,美国加利福尼亚州90024,美国; xiling.shen@terasaki.org 12美国杜克大学杜克大学医学系,美国北卡罗来纳州27710; shiaowen.hsu@duke.edu 13美国加利福尼亚州旧金山分校的放射学和生物医学成像系,美国加利福尼亚州94158; donna.peehl@ucsf.edu(D.M.P. ); john.kurhanewicz@ucsf.edu(J.K。); renuka.sriram@ucsf.edu(R.S.) 14美国芝加哥西北大学Lurie儿童医院儿科,美国伊利诺伊州60611; msuarezpalacios@luriechildrens.org(M.S.2美国盐湖城汉斯曼癌症研究所肿瘤科学系,美国盐湖城,美国犹他州84112; sandra.scherer@hci.utah.edu 3儿童研究所和德克萨斯大学西南部达拉斯大学的儿科,美国德克萨斯州75235,美国; Arin.aurora@utsouthwestern.edu 4 Jackson Laboratory,Farmington,CT 06032,美国; Bill.Flynn@jax.org 5美国俄勒冈州健康与科学大学肿瘤学科学系,美国97239; langere@ohsu.edu 6美国俄勒冈州俄勒冈州健康与科学大学外科系,美国97239; Brodyj@ohsu.edu 7分子与医学遗传学系,俄勒冈州健康与科学大学,波特兰,美国97239,美国; searsr@ohsu.edu 8 Ospedale San Raffaele,20054年意大利米兰; foggetti.giorgia@hsr.it 9 New Haven,纽黑文市CT 06520,内科。 anna.arnal@yale.edu 10病理学系,耶鲁大学,纽黑文,CT 06520,美国; don.nguyen@yale.edu(d.x.n.); katerina.politi@yale.edu(K.A.P。)11 Terasaki生物医学创新研究所,美国加利福尼亚州90024,美国; xiling.shen@terasaki.org 12美国杜克大学杜克大学医学系,美国北卡罗来纳州27710; shiaowen.hsu@duke.edu 13美国加利福尼亚州旧金山分校的放射学和生物医学成像系,美国加利福尼亚州94158; donna.peehl@ucsf.edu(D.M.P.); john.kurhanewicz@ucsf.edu(J.K。); renuka.sriram@ucsf.edu(R.S.)14美国芝加哥西北大学Lurie儿童医院儿科,美国伊利诺伊州60611; msuarezpalacios@luriechildrens.org(M.S.14美国芝加哥西北大学Lurie儿童医院儿科,美国伊利诺伊州60611; msuarezpalacios@luriechildrens.org(M.S.); sophia.xiao@northwestern.edu(s.x.); yuchdu@luriechildrens.org(y.d。); xli@luriechildrens.org(X.-N.L.)15杰维尔医学肿瘤学系,戴维·科赫·科赫(David H. nnavone@mdanderson.org(n.m.n。 ); elabanca@mdanderson.org(E.L。)16阿拉巴马大学伯明翰伯明翰伯明翰市阿拉巴马州阿拉巴马州35233的辐射肿瘤学系 *通信:cwilley@uabmc.edu;电话。 : +1-205-934-567015杰维尔医学肿瘤学系,戴维·科赫·科赫(David H. nnavone@mdanderson.org(n.m.n。); elabanca@mdanderson.org(E.L。)16阿拉巴马大学伯明翰伯明翰伯明翰市阿拉巴马州阿拉巴马州35233的辐射肿瘤学系 *通信:cwilley@uabmc.edu;电话。: +1-205-934-5670
