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MIQE指南：发表的最低信息...
内容：发表定量实时PCR实验（MIQE）指南的最低信息针对结果的可靠性，以帮助确保科学文献的完整性，促进实验室之间的结合，并提高实验透明度。MIQE是一组指南，可介绍评估QPCR实验所需的最低信息。包括一个清单，伴随着手稿的初步提交给发布者。通过提供所有相关的实验条件和测定特性，审阅者可以符合所使用协议的有效性。对所有试剂，序列和分析方法的全面披露是必要的，可以使其他研究人员能够再现结果。MIQE详细信息应以缩写形式或在线补充发表。
MIQE指南：发表定量实时PCR实验的最低信息：临床化学55：4 611–622（2009）：Bustin，S
MIQE指南：发表定量实时PCR实验的最低信息：临床化学55：4 611–622（2009）：Bustin，S.A.，Benes，V.，Garson，J.A.，Hellemans，J。，Huggett，J.，Kubista，M.，M Ueller，R.，Nolan，T.，Pfaffl，M.W.，Shipley，G.L.，Vandesompele，J.
使用实时 PCR 进行基因表达分析
10. 实时PCR检测的验证和性能； 11.标准化策略（例如使用参考基因和全局标准化）； 12.相对定量分析方法（如ddct、相对标准曲线、效率校正等）； 13. 练习评估参考基因稳定性（Excel电子表格）； 14. 利用ddct方法对生物群体进行数据分析的练习（excel表格）； 15.数据分析软件及工具； 16. 审查 qPCR 出版最低指南（MIQE）； 17. 案例研究和科学文章教学策略本学科将采用以下策略：• 对话式说明课• 概念图• 协作学习• 指导学习和阅读相关文章• 准备研讨会：教学资源将使用的技术资源包括：计算机和数据系统、分析程序、软件、门户和网站、幻灯片演示和视频。评估标准 通过学科的标准 学生必须取得等于或高于 C 的成绩，并且出勤率等于或高于学科工作量的 75％。学习评估标准
一种环境DNA分析，用于检测危及的天使鲨（Squatina spp。）
Agersnap，S.，Larsen，W.B.，Knudsen，S.W.，Strand，D.，Thomsen，P.F.，Hesselsøe，M。Etal。（2017）。使用淡水样品中的环境DNA对贵族，信号和狭窄的小龙虾进行监测。PLOS ONE，12（6），E0179261。https://doi.org/10.1371/journal.pone。0179261 Andruszkiewicz，E.A.，Sassoubre，L.M。＆Boehm，A.B。（2017）。海洋鱼环境DNA的持久性和阳光的影响。PLOS ONE，12（9），E0185043。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0185043 Barnes，M.A。 ＆Turner，C.R。 （2016）。 环境DNA的生态及其对保护遗传学的影响。 保护遗传学，17（1），1 - 17。https：//doi.org/10.1007/s10592-015-015-015-0775-4 Boulanger，E.，Loiseau，N. （2021）。 环境DNA元法编码揭示并解开地中海海洋储量中的生物多样性保护悖论。 皇家学会的会议记录B，288（1949），20210112。https：// doi。 org/10.1098/rspB.2021.0112 Boussarie，G.，Bakker，J.，Wangensteen，O.S。，Mariani，S.，Bonnin，L.，Juhel，J.B.等。 （2018）。 环境DNA照亮了鲨鱼的黑暗多样性。 科学进步，4（5），EAAP9661。 https://doi.org/ 10.1126/sciadv.aap9661 Budd，A.M.，Cooper，M.K.，Le Port，A.，Schils，T. 等。 （2021）。 使用环境DNA在五十年内，首次检测了密克罗尼西亚关岛的急性濒危扇形的锤头鲨（Sphyrna Lewini）。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0185043 Barnes，M.A。＆Turner，C.R。（2016）。环境DNA的生态及其对保护遗传学的影响。保护遗传学，17（1），1 - 17。https：//doi.org/10.1007/s10592-015-015-015-0775-4 Boulanger，E.，Loiseau，N.（2021）。环境DNA元法编码揭示并解开地中海海洋储量中的生物多样性保护悖论。皇家学会的会议记录B，288（1949），20210112。https：// doi。org/10.1098/rspB.2021.0112 Boussarie，G.，Bakker，J.，Wangensteen，O.S。，Mariani，S.，Bonnin，L.，Juhel，J.B.等。（2018）。环境DNA照亮了鲨鱼的黑暗多样性。科学进步，4（5），EAAP9661。https://doi.org/ 10.1126/sciadv.aap9661 Budd，A.M.，Cooper，M.K.，Le Port，A.，Schils，T.等。（2021）。使用环境DNA在五十年内，首次检测了密克罗尼西亚关岛的急性濒危扇形的锤头鲨（Sphyrna Lewini）。生态指标，127，107649。https：//doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.107649 Bustin，S.A.（2009）。MIQE指南：最少发表定量实时PCR实验的信息。临床化学，55（4），611 - 622。https：//doi.org/10.1373/clinchem.2008.112797 Caza-Allard，I.＆Bernatchez，L。（2022）。生物和非生物因素对鱼环境DNA的产生和降解的影响：一种实验评估。环境DNA，4（2），453 - 468。https：//doi.org/10.1002/edn3.266 Collins，R.A.，Wangensteen，O.S.，O.S.，O'Gorman，E.J. ＆Genner，M.J。（2018）。海洋中环境DNA的持久性
通过环境 DNA 检测来检测极度濒危的天使鲨 (Squatina spp.)
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一种环境DNA分析，用于检测危及的天使鲨（Squatina spp。）
Agersnap，S.，Larsen，W.B.，Knudsen，S.W.，Strand，D.，Thomsen，P.F.，Hesselsøe，M。Etal。（2017）。使用淡水样品中的环境DNA对贵族，信号和狭窄的小龙虾进行监测。PLOS ONE，12（6），E0179261。https://doi.org/10.1371/journal.pone。0179261 Andruszkiewicz，E.A.，Sassoubre，L.M。＆Boehm，A.B。（2017）。海洋鱼环境DNA的持久性和阳光的影响。PLOS ONE，12（9），E0185043。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0185043 Barnes，M.A。 ＆Turner，C.R。 （2016）。 环境DNA的生态及其对保护遗传学的影响。 保护遗传学，17（1），1 - 17。https：//doi.org/10.1007/s10592-015-015-015-0775-4 Boulanger，E.，Loiseau，N. （2021）。 环境DNA元法编码揭示并解开地中海海洋储量中的生物多样性保护悖论。 皇家学会的会议记录B，288（1949），20210112。https：// doi。 org/10.1098/rspB.2021.0112 Boussarie，G.，Bakker，J.，Wangensteen，O.S。，Mariani，S.，Bonnin，L.，Juhel，J.B.等。 （2018）。 环境DNA照亮了鲨鱼的黑暗多样性。 科学进步，4（5），EAAP9661。 https://doi.org/ 10.1126/sciadv.aap9661 Budd，A.M.，Cooper，M.K.，Le Port，A.，Schils，T. 等。 （2021）。 使用环境DNA在五十年内，首次检测了密克罗尼西亚关岛的急性濒危扇形的锤头鲨（Sphyrna Lewini）。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0185043 Barnes，M.A。＆Turner，C.R。（2016）。环境DNA的生态及其对保护遗传学的影响。保护遗传学，17（1），1 - 17。https：//doi.org/10.1007/s10592-015-015-015-0775-4 Boulanger，E.，Loiseau，N.（2021）。环境DNA元法编码揭示并解开地中海海洋储量中的生物多样性保护悖论。皇家学会的会议记录B，288（1949），20210112。https：// doi。org/10.1098/rspB.2021.0112 Boussarie，G.，Bakker，J.，Wangensteen，O.S。，Mariani，S.，Bonnin，L.，Juhel，J.B.等。（2018）。环境DNA照亮了鲨鱼的黑暗多样性。科学进步，4（5），EAAP9661。https://doi.org/ 10.1126/sciadv.aap9661 Budd，A.M.，Cooper，M.K.，Le Port，A.，Schils，T.等。（2021）。使用环境DNA在五十年内，首次检测了密克罗尼西亚关岛的急性濒危扇形的锤头鲨（Sphyrna Lewini）。生态指标，127，107649。https：//doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.107649 Bustin，S.A.（2009）。MIQE指南：最少发表定量实时PCR实验的信息。临床化学，55（4），611 - 622。https：//doi.org/10.1373/clinchem.2008.112797 Caza-Allard，I.＆Bernatchez，L。（2022）。生物和非生物因素对鱼环境DNA的产生和降解的影响：一种实验评估。环境DNA，4（2），453 - 468。https：//doi.org/10.1002/edn3.266 Collins，R.A.，Wangensteen，O.S.，O.S.，O'Gorman，E.J. ＆Genner，M.J。（2018）。海洋中环境DNA的持久性
环境DNA调查，以检测热带淡水流中的一种流行的隐秘鱼类，AnablePsoides Cryptocallus
Agersnap，S.，Larsen，W.B.，Knudsen，S.W.，Strand，D.，Thomsen，P.F.，Hesselsøe，M。Etal。（2017）。使用淡水样品中的环境DNA对贵族，信号和狭窄的小龙虾进行监测。plos One，12（6），1 - 22。https：//doi.org/10.1371/journal.pone。0179261 Baudry，T.，Mauvisseau，Q.，Goût，J.，Arqué，A.，Delaunay，C.，Smith-Ravin，J。等。（2021）。在生物多样性热点中绘制一个超级侵蚀者，这是一个基于埃德娜的成功故事。生态指标，126，107637。https：//doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.107637 Bedwell，M.E。＆Goldberg，C.S。（2020）。环境DNA检测的空间和时间模式，以告知灯杆和底漆系统中的采样方案。生态与进化，10（3），1602 - 1612。https：// doi.org/10.1002/ece3.6014 Belle，C.C.，Stoeckle，B.C。＆Geist，J。（2019）。水生保护中淡水环境DNA研究的分类和地理代表。水上保护：海洋和淡水生态系统，29（11），1996 - 2009年。https：//doi.org/10.1002/aqc.3208 Biotope。（2020）。eTuded'Améliorationde la Connaissance sur le Poisson Gale（AnablePsoides Cryptocallus）：分布，Étatde Conservation，Mesures Et推荐。https://www.observatoire-eau-martinique.fr/ documents/rapport-poisson-gale-vf.pdf Brys，R.，Halfmaerten，D.，Neyrinck，S.，Mauvisseau，Mauvisseau，Q.（2020）。可靠的EDNA检测和欧洲天气loach（Misgurnus possilis）的定量。（2009）。（2019）。鱼类生物学杂志，98（2），399 - 414。https：//doi.org/10.1111/jfb.14315 Bustin，S.A.，Benes，V.，Garson，J.A. MIQE指南：最少发表定量实时PCR实验的信息。 临床化学，55（4），611 - 622。https：//doi.org/10.1373/clinchem.2008。 112797 Cantera，I.，Cilleros，K.，Valentini，A.，Cerdan，A.，Dejean，T.，Iribar，A。等。 为热带流和河流中的鱼类库存优化环境DNA采样工作。 科学报告，9（1），1 - 11。https：//doi.org/10.1038/S41598-019-019-39399-5 Ceballos，G.，Ehrlich，P.R.，P.R.，Barnosky，Barnosky，Barnosky，A.D. ＆Palmer，T.M。 （2015）。 加速现代人类引起的物种损失：进入第六次巨大灭绝。 科学进步，1（5），E1400253。 https://doi.org/10.1126/sciadv.1400253 Cowart，D.A.，Breedveld，K.G.H.，Ellis，M.J.，M.J.，Hull，J.M. ＆Larson，E.R。 （2018）。 环境DNA（EDNA）用于保护危险的小龙虾（Decapoda：Astacidea），通过监测入侵物种障碍和重新定位的种群。 甲壳类生物学杂志，38（3），257 - 266。https：//doi.org/10.1093/jcbiol/jcbiol/ ruy007 Cristescu，M.E。 （2019）。 环境RNA可以革新生物多样性科学吗？ 生态与进化的趋势，34（8），694 - 697。https：// doi。 org/10.1016/j.tree.2019.05.003 Deal Martinique，Ecovia。 ＆Creocean。 （2018）。 诊断 - Martinique环境环境。 https：//www.martinique。鱼类生物学杂志，98（2），399 - 414。https：//doi.org/10.1111/jfb.14315 Bustin，S.A.，Benes，V.，Garson，J.A.MIQE指南：最少发表定量实时PCR实验的信息。临床化学，55（4），611 - 622。https：//doi.org/10.1373/clinchem.2008。112797 Cantera，I.，Cilleros，K.，Valentini，A.，Cerdan，A.，Dejean，T.，Iribar，A。等。为热带流和河流中的鱼类库存优化环境DNA采样工作。科学报告，9（1），1 - 11。https：//doi.org/10.1038/S41598-019-019-39399-5 Ceballos，G.，Ehrlich，P.R.，P.R.，Barnosky，Barnosky，Barnosky，A.D.＆Palmer，T.M。（2015）。加速现代人类引起的物种损失：进入第六次巨大灭绝。科学进步，1（5），E1400253。https://doi.org/10.1126/sciadv.1400253 Cowart，D.A.，Breedveld，K.G.H.，Ellis，M.J.，M.J.，Hull，J.M.＆Larson，E.R。（2018）。环境DNA（EDNA）用于保护危险的小龙虾（Decapoda：Astacidea），通过监测入侵物种障碍和重新定位的种群。甲壳类生物学杂志，38（3），257 - 266。https：//doi.org/10.1093/jcbiol/jcbiol/ ruy007 Cristescu，M.E。（2019）。环境RNA可以革新生物多样性科学吗？生态与进化的趋势，34（8），694 - 697。https：// doi。org/10.1016/j.tree.2019.05.003 Deal Martinique，Ecovia。＆Creocean。（2018）。诊断 - Martinique环境环境。https：//www.martinique。developpement-durable.gouv.fr/img/pdf/diagnostic_vf.3.pdf deiner，K。＆Altermatt，F。（2014）。自然河中无脊椎动物环境DNA的运输距离。PLOS ONE，9（2），E88786。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0088786 Dorazio，R.M。 ＆Erickson，R.A。 （2018）。 ednaocupancy：用于环境DNA数据的多尺度占用建模的R包。 分子生态资源，18（2），368 - 380。https：//doi.org/10.1111/1755-0998.12735 Ferreira，A.R.L.，Sanches Fernandes，L.F.，L.F. ＆Pacheco，F.A.L。 （2017）。 使用嵌套的部分最小二乘回归评估对河流生态系统的人为影响。 总体科学https://doi.org/10.1371/journal.pone.0088786 Dorazio，R.M。＆Erickson，R.A。 （2018）。ednaocupancy：用于环境DNA数据的多尺度占用建模的R包。分子生态资源，18（2），368 - 380。https：//doi.org/10.1111/1755-0998.12735 Ferreira，A.R.L.，Sanches Fernandes，L.F.，L.F.＆Pacheco，F.A.L。（2017）。使用嵌套的部分最小二乘回归评估对河流生态系统的人为影响。总体科学