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社论抗性结核病和生物信息学
结核病（TB）是仅次于Covid19的感染因素的第二大死亡原因。这种疾病是由结核菌细菌引起的。但是，还有其他细菌也可以在人类和其他动物中引起它，并且是结核分枝杆菌复合物的一部分，即：M。Afri Canum，M。Cannetti，M。Orygis，M。Orygis，M。Bovis，M。Microti，M。Microti，M。Canetti，M。Caprae，M。Caprae。M. Pinnipedi和M. Mungi。TB会影响身体的不同组织；但是，在大多数情况下，它会影响肺部，称为肺结核。受这种疾病影响的患者会出现症状，例如咳嗽需要超过15天的时间来治愈，咳嗽，体重减轻，食欲不振，夜汗和发烧峰。
利尻岛巴氏硬蜱和巴氏硬蜱携带微生物的存在：一项生态调查
摘要 利尻岛耸立于日本海，约 8,000 年来一直处于火山休眠状态。这个有人居住的小岛上没有中型到大型野生动物，是东亚迁徙路线上各条路线上野生鸟类迁徙的重要中途停留地。进行了一项为期 5 年的调查，以探索蜱虫和蜱传微生物的生物地理学。通过标记植被，在整个调查期间，主要收集到分布在远东有限地点的巴氏硬蜱 (Pomerantzev, 1948)。巴氏硬蜱由两个单倍群组成，即旭川型和利尻型，其中利尻型的流行率和核潮汐多样性分别超过 90% 和 0.068。野生动物调查显示，红背田鼠和野鸟（包括东方绿雀和黑脸鹀）是它们吸血的宿主。此外，红背田鼠感染了蜱传病原菌 Candidatus Ehrlichia khabarensis（5/21，24%）。到目前为止，仅在哈巴罗夫斯克和温哥华报道过具有相同基因序列的微生物。在寻宿主成年巴氏硬蜱中也检测到了 Ca . E. khabarensis 基因。这些结果表明利尻岛是巴氏硬蜱和巴氏硬蜱传播微生物的避难所。此外，在远东地区由全沟硬蜱传播的美国谱系巴贝斯虫似乎在巴氏硬蜱和野生啮齿动物之间也得以保留。各种因素影响着该岛独特的生态系统。利尻岛的历史和生态生物地理学有助于我们了解蜱虫和相关微生物的起源、进化和扩张。
自由生活啮齿动物中的细胞因子基因多态性和寄生虫敏感性：非编码变体的重要性
遗传变异与感染易感性之间的关联长期以来一直在自由宿主中进行研究，以推断出塑造免疫基因遗传多态性的当代进化力。尽管对蛋白质与病原体衍生的配体相互作用，例如MHC（主要的组织相互作用复合物）或TLR（TLR样受体），但对免疫系统的传递臂知之甚少。细胞因子是触发和调节免疫反应的信号分子，是先天性和适应性免疫之间的关键联系。In the present study we investigated how genetic variation in cytokines in bank voles Myodes glareolus affects their susceptibility to infection by parasites (nematodes: Aspiculuris tianjensis , Heligmosomum mixtum , Heligmo- somoides glareoli ) and microparasites ( Cryptosporidium sp , Babesia microti , Bartonella sp . )。我们专注于三种细胞因子：肿瘤坏死因子（TNF），淋巴毒素α（LTα）和干扰素β（IFNβ1）。总体而言，我们确定了与线虫易感性相关的四个单核苷酸聚合物（SNP）：两个位于ltα中的两个单核苷酸（SNP），其中两个位于IFNβ1中。其中一个变体是代名词，另一个位于内含子中。与寄生虫负载相关的每个SNP都位于选择的密码子中或旁边，三个密码子显示了阳性选择的签名，以及一个净化选择之一。我们的结果表明，细胞因子容易受到寄生虫驱动的选择，而非编码变体虽然在宿主寄生虫共同进化的遗传背景中通常被忽略，但可能在野生系统中感染的易感性中起作用。
作用于免疫力的IgE受体多态性的影响...
摘要个体的基因型是其免疫功能的重要预测指标，随后，它们控制或避免感染并最终为下一代贡献了后代。然而，受到不同内在和/或外部环境的相同基因型也可能导致不同的表型结果，在受控实验室研究中可能会遗漏。捕获基因型和环境变异性的自然野生动植物种群为更充分理解遗传变异的表型表达提供了机会。我们确定了高亲和力免疫球蛋白E（IgE）受体（GC和非GC单倍型）中的同义多态性，该受体（GC和非GC单倍型）对免疫基因表达，感染的易感性以及在田野孢子的自然种群中对个人感染的易感性和生殖成功具有性别依赖性影响。我们发现，性别之间的GC单倍型对免疫基因表达的影响有所不同。不管性别如何，在具有GC单倍型的个体中，促炎和抗炎基因的表达比没有单倍型的个体。然而，具有GC单倍型的雄性对促炎基因的信号更强，而女性对抗炎基因的信号更强。此外，我们发现了GC单倍型对女性中常见的微寄生虫Microti感染的可能性，而女性中携带GC单倍型的女性更有可能被感染。最后，我们发现GC单倍型对男性生殖成功的影响 - 男性带有GC单倍型的生殖成功较低。这是多态性的罕见例子，我们能够遵循自然人群中男性和女性的免疫，感染和繁殖的后果。
乳酸脱氢酶作为控制双芽巴贝斯虫的潜在治疗药物靶点
双梗巴贝斯虫是一种蜱传顶复门血液原虫，可引起牛巴贝斯虫病。目前用于治疗牛巴贝斯虫病的药物有几个缺点，包括毒性、无法有效清除寄生虫以及可能产生耐药性。寻找针对寄生虫必需和独特代谢途径的化合物是寻找替代药物治疗方法的合理方法。基于基因组序列和转录组学分析，可以推断无氧糖酵解是巴贝斯虫的主要三磷酸腺苷 (ATP) 供应，而乳酸脱氢酶 (LDH) 是该途径中必需的酶之一。此外，巴贝斯虫的 LDH 序列与其牛同源物不同，因此是一种潜在的化疗靶点，可减少寄生虫的 ATP 供应，但不减少宿主的 ATP 供应。已知棉酚是狭义牛巴贝斯虫和广义田鼠巴贝斯虫以及其他相关寄生虫中LDH的有效特异性抑制剂，但目前还没有关于狭义双芽巴贝斯虫寄生虫的此类数据。据此，我们表明LDH氨基酸序列在狭义巴贝斯虫中高度保守，但在广义巴贝斯虫中并非如此。对双芽巴贝斯虫LDH的预测性结构分析表明，与牛巴贝斯虫相比，与棉酚结合的关键氨基酸是保守的。棉酚对双芽巴贝斯虫的体外生长有显著（P < 0.0001）抑制作用，处理72小时后IC 50 为43.97 mM。在60 mM棉酚时观察到最大IC（IC 98）。然而，与暴露于 DMSO 的对照细胞相比，用 60 mM (IC 98 ) 棉酚培养牛 PBMC 时，观察到对细胞活力的显著影响。有趣的是，在 3% 氧气中培养的 B. bigemina 表达的 LDH 水平明显高于在含有 ~20% 氧气的环境条件下维持的寄生虫，并且对棉酚的抵抗力更强。总之，结果表明棉酚有可能成为一种有效的抗 B. bigemina 感染药物，但应在体内研究中进一步评估治疗剂量下宿主毒性的风险。