废水监视已成为公共卫生流行病学中的关键工具。特别是由19009年大流行的催化,现代文化独立的测序方法由于能够提供全面的观点而变得必不可少。在这项研究中,我们提出了一种创新的,综合的方法,用于同时病原体检测,抗菌耐药性(AMR)监测以及废水系统中的功能分析。通过利用Zymo Research提供的先进样品制备技术并利用PACBIO ONO SO-READ-READ测序,我们的目标是提高我们对废水环境中微生物动力学的理解。
仅研究使用。不适用于诊断程序。©2024加利福尼亚州的太平洋生物科学(“ PACBIO”)。保留所有权利。本文档中的信息如有更改,恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知,条款,条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。Pacific Biosciences,PACBIO徽标,PACBIO,Circulomics,Omniome,Smrt,Smrtbell,Iso-Seq,Seqel,Seqel,Nanobind,SBB,Revio,Revio,Onso,Apton,Apton和Kinnex是PacBio的商标。
ONSO简短阅读的测序系统是一种可扩展且灵活的台式平台,通过通过绑定(SBB™)技术进行独特的测序来提供非凡的准确度。具有固有的测序噪声,ONSO系统使研究人员能够发现以前错过的稀有变体,并在较低的测序深度下进行。ONSO系统提供的准确性将有助于在诸如液体活检测试(MRD),微生物群落中的抗生素耐药性监测等领域的突破性发现,基因编辑实验中的脱靶分析以及许多其他“针刺中的刺激性”应用程序中的最高水平。
对于每个样本,从步骤 4b.15 中取出 2 µL PCR 扩增文库进行定量分析:接下来必须按照“Onso TM 文库的 qPCR 定量分析”程序使用 Onso Library 定量试剂盒 (PacBio 102-431-800) 通过 qPCR 准确评估文库数量。这将确保在簇生成期间能够实现最佳簇密度。注意:步骤 4b.17 可以与步骤 4b.16 同时进行。
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