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程序和清单 - 使用Nanobind套件从DNA Genotek Oragene设备中收集的唾液中提取纳米宾HMW DNA
初始版本2024年10月1日仅研究使用。不适用于诊断程序。©2024加利福尼亚州的太平洋生物科学（“ PACBIO”）。保留所有权利。本文档中的信息如有更改，恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知，条款，条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。太平洋生物科学，PACBIO徽标，PACBIO，Circulomics，Omniome，Smrt，Smrt，Smrtbell，Iso-Seq，Sequel，sequel，Nanobind，sbb，sbb，sbb，revio，onso，apton，apton，kinnex，peretarget和sprq是Pacbio的商标。
技术说明 - 使用 DNA Genotek Oragene 设备收集并使用 Nanobind 试剂盒提取的唾液 DNA 样本的 HiFi 测序性能
采集了 30 位捐献者的唾液样本，其中 90% 的分析前 DNA 质量 >2 µg。从 27 个样本中提取了 HMW DNA，其中 93% 的产量 >500 ng。提取后，使用 Qubit dsDNA BR 检测试剂盒对 DNA 进行定量，并使用 Femto Pulse 系统（安捷伦科技公司）进行表征。使用 SMRTbell ® 制备试剂盒 3.0 为部分样本制备 HiFi 文库，并使用 SPRQ™ 化学方法在 Revio 系统上进行测序。每个样本都在一个 Revio SMRT 测序池上进行测序。表 1 总结了五个代表性样本的测序数据。这些样本产生了 4.7 到 15.9 µg 的 HMW DNA。HiFi 测序产量为 119 到 133 Gb 的 HiFi 数据，每个基因组的覆盖率为 27 到 40 倍，足以进行全面的 WGS 变异检测。 75% 到 95% 的读数映射到人类参考基因组 (GRCh38)。
分析物的人类基因组产品
1 Oragene•DX产品手册。 pd-hb-00001 2非侵入性的，辅助收集的高量和质量基因组DNA从幼儿的唾液中。 DNA Genotek。 PD-WP-018 3 Oracollect•RNA产品手册。 DNA Genotek。 pd-hb-00021 4总DNA和RNA产生250μl等分试样的综合剂•根据Oragene•DX人为因素研究的结果，用Qiagen rneasy powermicrobiome kit 5提取的唾液DNA和RNA [K141410和K192920]。1 Oragene•DX产品手册。pd-hb-00001 2非侵入性的，辅助收集的高量和质量基因组DNA从幼儿的唾液中。DNA Genotek。PD-WP-018 3 Oracollect•RNA产品手册。DNA Genotek。pd-hb-00021 4总DNA和RNA产生250μl等分试样的综合剂•根据Oragene•DX人为因素研究的结果，用Qiagen rneasy powermicrobiome kit 5提取的唾液DNA和RNA [K141410和K192920]。
saliva的DNA
1预期的收率取决于供体抽取体积和选择的提取方法。2人群和实验室方法对DNA产量和可变性的影响。DNA Genotek。PD-WP-00031。3 Oragene DX产品手册PD-HB-00001_ISSUE10。4非侵入性，辅助收集幼儿唾液的高量和质量基因组DNA。DNA Genotek。PD-WP-018。5 Birnboim HC，Iwasiow RM，James CMP。（2008）。使用Oragene自我收集试剂盒收集的唾液样品的人类基因组DNA含量。
KI 生物库样本服务价格表，2025 年
DNA 提取 价格包括 UV 浓度测量 从 400 µL EDTA 全血（包括分装到 2 个备用样品）104 瑞典克朗 从 4 mL EDTA 全血 306 瑞典克朗 从 Oragene™ 试剂盒 207 瑞典克朗 从口腔拭子 202 瑞典克朗 外部 DNA 提取客户的管理费 包括协议、IT、说明和验证
关税 v.20_ENG
VMUE01 提供新鲜样本（血液/器官，全额捐赠） 6,98 € 11,18 € 13,31 € VMUE01-OB 获取新鲜样本（血液/器官，全额捐赠） 10,47 € 16,77 € 19,96 € VMUE02 提供新鲜样本（组织碎片） 3,97 € 8,01 € 9,54 € VMUE02-OB 获取新鲜样本（组织碎片） 5,95 € 12,02 € 14,31 € VMUE05 提供固定载玻片上的切片 14,64 € (*) 19,22 € (*) 22,88 € (*) VMUE05-OB 获取固定载玻片上的切片 21,96 € (*) 28,83 € (*) 34,32 € (*) VMUE07 提供切片固定试管中的切片供应（10 μm 切片） 4,32 € (*) 8,38 € (*) 9,98 € (*) VMUE07-OB 固定试管中的切片供应（10 μm 切片） 6,48 € (*) 12,57 € (*) 14,97 € (*) VMUE09 冷冻试管中的切片供应（20 μm 切片） 4,52 € (*) 8,59 € (*) 10,23 € (*) VMUE09-OB 冷冻试管中的切片供应（20 μm 切片） 6,78 € (*) 12,89 € (*) 15,34 € (*) VMUE11 冷冻载玻片上的切片供应 4,73 € (*) 8,81 € (*) 10,49 € (*) VMUE11-OB在冷冻载玻片上 7,09 € (*) 13,22 € (*) 15,74 € (*) VMUE13A 提供样本矩阵部分 (TMA)，无需区域选择 177,50 € 190,22 € 226,46 € VMUE13A-OB 提供样本矩阵部分 (TMA)，无需区域选择 266,25 € 285,33 € 339,68 € VMUE13B 提供样本矩阵部分 (TMA)，带区域选择 183,07 € (*) (**) 196,07 € (*) (**) 233,41 € (*) (**) VMUE13B-OB 提供样本矩阵部分 (TMA)，带区域选择 274,60 € (*) (**) 294,10 € (*) (**) 350,12 € (*) (**) VMUE15 提供 DNA (1 μg) (冷冻组织) 3,00 € 7,00 € 8,33 € VMUE15-OB 获取 DNA (1 μg) 4,50 € 10,50 € 12,50 € VMUE17 提供 c-DNA (1 μg) 38,45 € 44,22 € 52,64 € VMUE17-OB 获取 c-DNA (1 μg) 57,67 € 66,33 € 78,96 € VMUE22 提供保存的体液 (500μl) 1,86 € 5,80 € 6,91 € VMUE22-OB 获取保存的体液 (500μl) 2,79 € 8,70 € 10,36 € VMUE24 提供血清 (最多 500µl) 2,96 € 6,96 € 8,29 € VMUE24-OB 获得血清供应（最多 500µl） 4,45 € 10,44 € 12,43 € VMUE26 提供血浆（最多 500 μl） 3,45 € 7,47 € 8,89 € VMUE26-OB 获得血浆供应（最多 500 μl） 5,17 € 11,20 € 13,33 € VMUE29A 提供手动固定在载玻片上的细胞 17,46 € 22,18 € 26,41 € VMUE29A-OB 提供手动固定在载玻片上的细胞 26,19 € 33,27 € 39,61 € VMUE29B 提供通过离心机固定在载玻片上的细胞 25,75 € 30,88 € 36,77 VMUE29B-OB 获得用离心机固定在载玻片上的细胞 38,62 € 46,33 € 55,15 € VMUE31 提供未经 DNAsa 处理的 RNA (1 μg) 7,82 € 12,06 € 14,35 € VMUE31-OB 获得未经 DNAsa 处理的 RNA (1 μg) 11,73 € 18,08 € 21,53 € VMUE32 提供用 DNAsa 处理的 RNA (1 μg) 6,71 € 10,89 € 12,96 € VMUE32-OB 获得用 DNAsa 处理的 RNA (1 µg) 10,06 € 16,33 € 19,44 € VMUE34 提供尿液（最多 500 μl） 2,20 € 6,16 € 7,33 € VMUE34-OB 获得尿液样本（最多 500 μl） 3,30 € 9,24 € 11,00 € VMUE35 提供 RNA（最多 1 μg），使用 PAXgene 试管 2,29 € 6,25 € 7,44 € VMUE35-OB 获得 RNA（最多 1 μg），使用 PAXgene 试管 3,43 € 9,38 € 11,17 € VMUE37 提供 Oragene 中收集的 DNA（1 μg） 5,01 € 9,11 € 10,84 € VMUE37-OB 获得 Oragene 中收集的 DNA（1 μg） 7,51 € 13,66 € 16,26 € VMUE40 提供新鲜样本（全血） 1,87 € 5,82 € 6,92 € VMUE40-OB 获取新鲜样本（全血） 2,81 € 8,72 € 10,39 € VMUE41 提供含蛋白酶抑制剂的体液（500 μl） 6,38 € 10,55 € 12,56 € VMUE41-OB 获取含蛋白酶抑制剂的体液（500 μl） 9,57 € 15,82 € 18,83 € VMUE42 提供 OCT 中的冷冻组织（整块） 2,67 € 6,65 € 7,91 € VMUE42-OB 获取 OCT 中的冷冻组织（整块） 4,00 € 9,97 € 11,87 € VMUE43 提供 RNAlater 中的组织 5,17 € 9,28 € 11,04 € VMUE43-OB 获取RNAlater 7,76 € 13,92 € 16,57 € VMUE44 组织固定并包含在石蜡中（整块） 11,93 € 16,38 € 19,50 € VMUE44-OB 获取固定并包含在石蜡中的组织（整块） 17,90 € 24,57 € 29,24 € VMUE45 提供石蜡固定组织圆柱体 1 mm Ø 12,34 € 16,80 € 20,01 € VMUE45-OB 获取固定在石蜡中的组织圆柱体 1 mm Ø 18,51 € 25,21 € 30,01 € VMUE46 提供粪便（180 至 200 毫克之间） 5,14 € 9,25 € 11,01 € VMUE46-OB 获取粪便（180 至 200 毫克之间） 7,72 € 13,88 € 16,52 € VMUE48 提供细胞组分 1 毫升 3,57 € 7,59 € 9,04 € VMUE48-OB 获取细胞组分 1 毫升 5,35 € 11,39 € 13,56 € VMUE49 提供白膜和/或红细胞（试管） 3,07 € 7,07 € 8,42 € VMUE49-OB 获取白膜和/或红细胞（试管） 4,60 € 10,60 € 12,62 €38 € 19,50 € VMUE44-OB 获取固定并包含在石蜡中的组织（整块） 17,90 € 24,57 € 29,24 € VMUE45 提供石蜡固定组织圆柱体 1 mm Ø 12,34 € 16,80 € 20,01 € VMUE45-OB 获取固定在石蜡中的组织圆柱体 1 mm Ø 18,51 € 25,21 € 30,01 € VMUE46 提供粪便（180 至 200 mg 之间） 5,14 € 9,25 € 11,01 € VMUE46-OB 获取粪便（180 至 200 mg 之间） 7,72 € 13,88 € 16,52 € VMUE48 提供细胞部分 1 ml 3,57 7,59 欧元 9,04 欧元 VMUE48-OB 获得细胞组分 1 毫升 5,35 欧元 11,39 欧元 13,56 欧元 VMUE49 提供白膜和/或红细胞（试管） 3,07 欧元 7,07 欧元 8,42 欧元 VMUE49-OB 获得白膜和/或红细胞（试管） 4,60 欧元 10,60 欧元 12,62 欧元38 € 19,50 € VMUE44-OB 获取固定并包含在石蜡中的组织（整块） 17,90 € 24,57 € 29,24 € VMUE45 提供石蜡固定组织圆柱体 1 mm Ø 12,34 € 16,80 € 20,01 € VMUE45-OB 获取固定在石蜡中的组织圆柱体 1 mm Ø 18,51 € 25,21 € 30,01 € VMUE46 提供粪便（180 至 200 mg 之间） 5,14 € 9,25 € 11,01 € VMUE46-OB 获取粪便（180 至 200 mg 之间） 7,72 € 13,88 € 16,52 € VMUE48 提供细胞部分 1 ml 3,57 7,59 欧元 9,04 欧元 VMUE48-OB 获得细胞组分 1 毫升 5,35 欧元 11,39 欧元 13,56 欧元 VMUE49 提供白膜和/或红细胞（试管） 3,07 欧元 7,07 欧元 8,42 欧元 VMUE49-OB 获得白膜和/或红细胞（试管） 4,60 欧元 10,60 欧元 12,62 欧元