摘要脆弱的X综合征(FXS)代表了遗传性智力残疾的最普遍形式,是自闭症谱系障碍的第一个单根原因。fxs是由于不存在RNA结合蛋白FMRP(脆弱的X信使核糖核蛋白)而引起的。神经元迁移是大脑发育的重要步骤,允许神经元从其生发壁nir将其移动到最终整合位点。FMRP在神经元迁移中的确切作用在很大程度上尚未开发。使用FMR1 -NULL小鼠中产后鼻迁移(RMS)神经元的实时成像,我们观察到,FMRP的缺失会导致神经元迁移延迟和轨迹改变,与中心体运动的缺陷有关。RNA干扰诱导的FMR1的敲低表明这些迁移缺陷是细胞自主的。值得注意的是,与这些迁移缺陷有关的主要FMRP mRNA靶标是微管相关蛋白1b(MAP1B)。击倒MAP1B表达有效地拯救了大多数观察到的迁移缺陷。最后,我们通过证明没有FMRP的缺乏在迁移神经元核的微管的笼子中诱导缺陷来阐明发挥作用时的分子机制,而迁移神经元核的细胞核的缺陷,这是由MAP1B敲击救出的。我们的发现揭示了FMRP与MAP1B合作的新型神经发育作用,通过影响微管细胞骨架来共同策划神经元迁移。
引言青光眼是指各种眼睛条件,其标志着眼睛上的压力增加(称为眼压)(IOP)和对视神经的损害。这种情况会导致视力逐渐降低,如果未经处理,则可能最终导致完全失明[1,2]。青光眼是各种各样的神经退行性疾病,其特征在于视觉神经炎的异常形式,逐渐导致视网膜神经纤维层的恶化和最终死亡。这种状况最终导致大量视力障碍[3]。眼室的机械转移过程的故障会导致结构改变,水性幽默排水不良,以及青光眼中的小梁造成分解。视网膜刺激和Muller细胞,小胶质细胞以及星形胶质细胞的激活是由这种功能障碍引起的。这些变化最终可能导致渐进的视力丧失[4]。被称为原发性先天性青光眼(PCG)的疾病是严重的视觉障碍,这是由于前室角和视神经头的发展引起的。通常,它出现在怀孕的第九个月。没有PCG的已知病因,它与任何其他发育障碍无关。光敏感性,眼内压力增加,前巩膜的减弱和延伸,哭泣过多,眼睑的炎症,视神经萎缩,角膜雾霾以及地球肿大是症状。并发症可能包括辨别膜恶化和结膜红斑。PCG可以偶发地发生或在家庭中运行,建议遗传咨询以识别有缺陷基因的载体并防止进一步的视觉障碍[5,6]。
会损害另一种药物的吸收,从而导致可能致命的药理作用。由于有关 OATP 抑制机制的信息有限,并且不同研究中的实验性 OATP 抑制数据不一致,因此预测 OATP 介导的 DDI 具有挑战性。本研究引入了异构 OATP-配体相互作用图神经网络 (HOLIgraph),这是一种新颖的计算模型,它将分子建模与图神经网络相结合,以增强对药物诱导的 OATP 抑制的预测。通过将配体(即药物)分子特征与来自严格对接模拟的蛋白质-配体相互作用数据相结合,HOLIgraph 的表现优于仅依赖配体分子特征的传统 DDI 预测模型。HOLIgraph 在预测 OATP1B1 抑制剂时实现了超过 90% 的中位平衡准确度,明显优于纯基于配体的模型。除了改善抑制预测之外,用于训练 HOLIgraph 的数据还可以表征参与抑制药物-OATP 相互作用的蛋白质残基。我们确定了某些优先与抑制剂相互作用的 OATP1B1 残基,包括 I46 和 K49。我们预计此类相互作用信息将对未来对 OATP1B1 的结构和机制研究很有价值。科学贡献。HOLIgraph 通过将对接模拟得出的蛋白质-配体相互作用纳入图神经网络框架,为 DDI 预测引入了一种新范式。这种方法得益于 OATP1B1 的最新结构突破,与仅依赖配体特征的传统模型有很大不同。通过实现高预测准确性和揭示机制见解,HOLIgraph 为药物设计和 DDI 预测中的计算工具设定了新的轨迹。
有机阴离子运输多肽(OATP)对于肝药物摄取至关重要,影响了药物疗效和毒性。预测OATP介导的药物相互作用(DDIS)由于结构性数据有限和整个研究的实验性OATP抑制数据而具有挑战性。这项研究介绍了异质的OATP-rigand相互作用图神经网络(HOLI-GNN),这是一种新型的计算方法,将分子建模与图神经网络相结合,以增强OATP介导的药物抑制的预测。通过将配体分子特征与蛋白质配体相互作用数据相结合,Holi-GNN的表现优于传统的基于配体的方法。与基于ECFP和RDKIT的模型相比,HOLI-GNN的中位数F1和AUC得分分别为0.78和0.90,分别基于XGBoost(F1:0.68和0.78; AUC:0.70和0.75)。除了改善抑制预测之外,我们还表征了与抑制性药物相互作用相对于非抑制性药物相互作用的蛋白质残基,特别是突出了残基T42,F224,I353,F356和F386。我们推测这些疏水堆积残基或抑制作用的局部位置可能是竞争性抑制机制的重要方面。我们的模型增强了OATP抑制剂预测的性能,并批判性地提供了可解释的交互信息,以告知未来的机械调查。
一组蛋白质是运输(ESCRT)所需的内体分选复合物,在膜重塑中起着至关重要的作用,这是一种涉及细胞膜重排的细胞过程。理解和控制ESCRT的特定部分由于其复杂的组织而具有挑战性。在这里,我们描述了一种天然产物 - 例如复合触觉,专门破坏了ESCRT的特定部分,称为IST1 -CHMP1B复合物。使用触觉素作为化学工具,我们研究了该复合物如何有助于不同的膜重塑事件。有趣的是,诱使诱导非规范的LC3脂质 - 涉及失速内体的非规范自噬(自饮食)的过程。这一发现进一步丰富了我们对ESCRT功能的理解,并强调了小分子作为揭示复杂生物学机制的宝贵工具的重要性。
1 Monash Biomedicine Discovery Institute,Monash University,Clayton,Victoria3800。2澳大利亚克莱顿市莫纳什大学生物化学与分子生物学系,澳大利亚3800。3莫纳什制药科学研究所,莫纳什大学,帕克维尔,维多利亚州3052,澳大利亚。4美国普渡大学的化学和分子药理学系,西拉斐特,美国47907,美国5号沃尔特和伊丽莎·霍尔医学研究所,澳大利亚维多利亚州帕克维尔3052,帕克维尔。6澳大利亚维多利亚州墨尔本大学医学生物学系,澳大利亚3052。6澳大利亚维多利亚州墨尔本大学医学生物学系,澳大利亚3052。
背景:马代谢综合征(EMS)是一种多因素病理学,收集胰岛素抵抗,低度炎症和过去或慢性层状炎。在EMS发病机理的几种分子机制中,由蛋白质酪氨酸磷酸酶1 B(PTP1B)介导的负胰岛素信号传导增加已成为肝胰岛素抵抗和与ER应力增加,产生的自动化和破坏性自动化相关的一般代谢困扰的临界轴。因此,使用PTP1B选择性抑制剂(例如MSI-1436)可能被视为用于适当管理EMS和相关条件的黄金治疗工具。因此,本研究旨在验证MSI-1436在EMS受影响马中肝脏代谢平衡,胰岛素敏感性和炎症状态的全身性给药的临床效率。此外,已经分析了MSI-1436治疗对肝组织中肝自噬机械和相关的ER应激的影响。
淋巴瘤是起源于淋巴造血系统的恶性肿瘤,分为霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤。现有数据调查估计,2020年全球新发病例509,590例,淋巴瘤死亡人数超过248,724例(1)。弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是最常见的非霍奇金淋巴瘤,约占所有病例的30%,其中还包括特定亚型或疾病实体(2)。在目前的临床诊断和治疗策略中,R-CHOP(瑞妥昔单抗、环磷酰胺、阿霉素、长春新碱和泼尼松)是首选的治疗方案,具有良好的抑制疾病发展的能力(3)。许多患者要么复发,要么出现原发性难治性疾病并最终死于该病(4,5)。为DLBCL的检测和治疗提供新的诊疗思路,需要开展DLBCL生物标志物相关研究,并进一步探究相关分子机制,为DLBCL的临床治疗提供新的诊疗策略。
Ruth F. Rocha a , Tiago Rodrigues c , Angela CO Menegatti a, b* , Gonçalo JL Bernardes c,d* , HernánTerenzi a 5 a 结构分子生物学中心,生物化学系,圣卡塔琳娜州联邦大学,Trindade 校区,88040-900,弗洛里亚诺波利斯,SC,巴西 b 皮奥伊联邦大学,CPCE,64900-000,Bom Jesus,PI,巴西 c 分子医学研究所,里斯本大学医学院,Avenida Professor Egas Moniz,1649-028 Lisbon,葡萄牙 10 d 剑桥大学化学系,Lensfield Road,CB2 1EW,剑桥,英国
