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当代欧洲马鹿遗传结构的全基因组 SNP 评估突出了欧洲边缘种群和主要混合区的区别
图 2 个体层面的遗传结构。（a）树状图描绘了个体之间的欧几里得遗传距离。该图是通过将最小二乘法 (OLS) 聚类应用于个体之间的欧几里得距离输入矩阵而生成的。个体之间的遗传距离用个体之间的总路径长度表示。（b）主坐标分析 (PCoA)。散点图显示了根据应用于个体之间欧几里得距离输入矩阵的 PCoA 的前两个排序轴。第一个 PC 轴已被镜像以模拟地理位置。（c）OLS 聚类模型的残差误差。该图右侧的热图描绘了树状图中的路径长度与实际遗传距离之间的差异。红色表示吸引力：个体之间的实际距离小于树状图所显示的距离。蓝色表示排斥力：个体之间的实际距离大于树状图所显示的距离。种群代码如表 1 所示，其中 (a) 面板中的下标表示在树状图的不同生根位置分裂的亚种群。
尸体马拉维人种群中脑动脉动脉动脉脑的解剖变异和形态学特性
背景：对脑电动杆菌的解剖结构（CAC）的了解对于理解其作为附带灌注和压力均衡的动脉吻合结构的作用很重要，并且可以解释观察到的跨种群神经血管疾病患者的变化。这项研究旨在了解马拉维人口中CAC的解剖结构和形态计量学特性。材料和方法：在医疗法律尸检期间，最近24种黑人马拉维人尸体收集大脑。使用位于距大脑底部30厘米高的相机拍摄的CAC的照片。全圈属性和分段容器参数，注意完整性，典型，对称性和节式容器直径和长度。结果：在69.57％的CAC中发现了完整的圆形配置。典型的37.5％是典型的典型性患病率为26.09％。血管不对称性。有7例血管植物和12例血管发育不全。后验交通动脉（PCOA）是最大的（12个变化），最宽（7.67 mm）和最长（27.7毫米）的血管，而前交通动脉（ACOA）是最短（0.78 mm）。在这项研究中，ACOA和PCOA都是最狭窄的血管（0.67 mm）。CAC变化似乎与不同人群中观察到的变化相似。（Folia Morphol 2021; 80，4：820–826）结论：马拉维人群中存在CAC的解剖学变化，应在临床实践中考虑。
Metataxonomic和代谢组学证据与龋齿有关的生物膜稳态破坏：一项体外研究
图3通过主坐标分析（PCOA），Caries Biofilms群体与共生相分离，显示了18个样本之间的分布；进行了Anosim，Permanova和PermDISP测试，以测试先验定义的组的显着性。结果表明，两组之间通过系统发育定性（未加权的unifrac p-值= 0.017）和定量（对加权Unifrac距离p -value = 0.003的永久分析）措施之间的显着差异，也显示了jaccard距离（Permanova perterov p -value curtis discort = 0.00001）和bray curtiv = 0.001 = 0.001） 0.001）
基于简单序列重复 (SSR) 标记的南非仙人掌梨品种 (Opuntia spp.) 的遗传多样性和分化
摘要 仙人掌属植物（Opuntia ficus-indica (L.) Mill.）是能够耐受恶劣环境条件的最知名农作物之一。南非是少数拥有大量仙人掌种质资源的国家之一，这些种质资源代表了移地保护种群。然而，人们对该种群的遗传多样性知之甚少。此外，一些基因型在形态上不明显，因此，对于新手农民和研究人员来说，识别种质资源中的样本是一项挑战。本研究旨在使用八个简单序列重复 (SSR) 标记来区分和测量代表南非仙人掌种质资源的 44 个栽培品种的遗传多样性。显然，这些品种具有中等水平的多样性（平均多态性信息含量 PIC = 0.37，Nei 无偏基因多样性 = 0.42），可区分 90% 的品种。使用算术平均数 (UPGMA) 的非加权配对法对品种进行分析，发现主要分为三个聚类，而主坐标分析 (PCoA) 则显示，根据品种在农业中的用途，其聚类不明显。
保守西非车前草的遗传多样性（Musa ...
摘要：评估种质的遗传多样性对于声音种质管理及其在育种计划中的成功利用至关重要。这项研究旨在估计车前草配件之间的遗传多样性，并使用简单序列重复（SSR）标记在基因型之间建立关系。SSR标记物在20个车前草附属物中扩增了21个等位基因，每个位点3.50等位基因和主要等位基因频率（平均值±SD，0.80±0.34）。多态信息内容（PIC）和香农的多样性指数分别为0.054至0.919和0.000至1.864。分子方差分析（AMOVA）表明，种群中基因型之间发生了88％的遗传变异，人群之间观察到最小的变异。这会导致区分种群时的NEI遗传距离和FST值可以忽略不计。基因流速明确证明了采用共同主导标记的功效，正如主坐标分析（PCOA）和树状图所证明的那样。这项研究表明，在车前草种群中的20个车前草配件之间存在明显的遗传差异，并建立了新的集群群体，为未来在育种计划中使用提供了宝贵的见解。
从印度移民和印度 - 加拿大人中的非西方化向西方化肠道微生物组的过渡与饮食适应性有关
alpha多样性 - 使用16S扩增子序列，向前消失，反向读数在251个基础上被截断。框表示第一四分位数和第三四分位数之间的四分位间范围（IQR），水平线表示中位数，晶须是IQR的1.5倍以内的上和下值。alpha多样性。（a）Pielou的均匀度显示出显着差异（H = 85.7，P = 1.07E-17）。成对比较表明，印第安人的均匀均高于欧洲加拿大人（H = 56.2，Q = 6.51E-13），欧洲移民（H = 17.0，Q = 7.32e-05）和印度 - 加拿大人（H = 10.8，Q = 10.69e-03）。欧洲 - 加拿大的控制也比印度移民（H = 41.4，Q = 6.09e-10）和印度加拿大人（H = 21.7，Q = 8.10E-06）高得多。（b）香农的多样性显示出显着差异（H = 79.8，p = 1.89e-16）。成对比较表明，印第安人的多样性明显低于欧洲加拿大人（H = 56.7，Q = 3.91e-12），欧洲移民（H = 32.9，Q = 4.94E-08），印度 - 加拿大人，H = 14.3，Q = 14.3，Q = 2.59e-04）和Indo-Indo-Indo-Mignmants（H = 6. H = 17）6.66，6.66。欧洲 - 加拿大对照组的得分也明显高于印度移民（h = 20.0，q = 2.62e-05）和印度 - 加拿大人（h = 14.4，q = 2.59e-04）。beta多样性 - 使用shot弹枪序列，向前的反复读取和反向读数以10个碱基对修剪，固定最大长度为120个碱基对。使用Bray Curtis差异和加权Unifrac探索了Beta多样性，并使用成对的置换式多元方差分析（PermanOva）来测试组之间的差异。（c）Bray Curtis原理坐标分析（PCOA）图显示，在前两个轴上捕获了45.3％的变异。与Bonferroni校正的成对比较显示，大多数群体之间存在显着差异，印第安人和西方同类群的印第安人和印度移民的明显聚类。（d）加权unifrac PCOA图显示，在前两个轴上捕获了61.8％的变化，还检测到显着差异。成对比较结果可以在附录E中找到。印度的肠道表现出了杆菌和蛋白质细菌的占主导地位，欧洲加拿大人表现出很高的富公司。印度移民的消失（挥发性和/或与人类工业化社会有效）相关的大量分类单元，包括Eubacterium和Erysipelotrichaceae。印度 - 加拿大人拥有诸如Collinsella等消失的分类单元，以及Blossum（Bloom或在城市化/现代化社会中被选中）的大量丰富，例如Anaerostipes和Blautia。
基于SSR和IPBS标记的Zanthoxylum物种的遗传多样性分析和DNA指纹构建
zanthoxylum是一种用途广泛的经济树种，用于其香料，调味料，石油，药用和工业原材料的应用，并且在中国拥有悠久的耕种和驯化历史。这导致了许多品种的发展。但是，混合品种和命名混乱的普遍性极大地阻碍了Zanthoxylum资源和行业发展的有效使用。因此，在Zantoxylum上进行遗传多样性研究和多样性鉴定至关重要。这项研究分析了使用SSR和IPBS分子标记物的80个Zanthoxylum品种的遗传特征，从而导致DNA指纹创建。这项研究分别鉴定出具有32个SSR标记和10个IPB标记的206和127等位基因，每个标记的平均值为6.4和12.7等位基因（NA）。SSR和IPB标记的平均多态性信息含量（PIC）分别为0.710和0.281。80 Zanthoxylum登录的遗传相似性系数范围为0.0947至0.9868，从0.2206到1.0000，平均值分别为0.3864和0.5215，表明实质性遗传多样性。通过主坐标分析（PCOA）证实的聚类分析将这些加入分为三个主要组。使用SSR标记物对三个Zanthoxylum（Z. bungeanum，Z。a和piperitum）种群进行遗传分化的分析显示，平均遗传分化系数（FST）为0.335，基因流量（Nm）为0.629，均为0.629，表现为显着的遗传遗传差异。分子方差分析（AMOVA）表明，遗传变异的65％发生在个体内部，而人群中发生了35％。基于贝叶斯模型的种群遗传结构的分析将所有材料分为两组。32 SSR标记的PI和PISIBS值为
微生物群落的多样性和结构，在有或不具有富含Mannan的分数的情况下铺设母鸡
动物中的胃肠道微生物组为操纵提供了一个有吸引力的目标，以改善动物健康和生产性能。更好地了解鸡肉肠道微生物组，以及如何使用营养干预措施来调节微生物群。大多数鸡肠道微生物组的研究都检查了肉鸡，很少有针对层微生物组的研究。这项研究的重点是研究补充曼南的富含分数（MRF）对峰值层次和峰值后层的盲肠微生物群的影响。在一项喂养试验中，在随机完整的块设计中，喂食奶酪女性的母鸡被喂食对照饮食或用MRF补充的对照饮食。cecal含量是从每次治疗的10个随机选择的鸟类中收集的，并在4个时间点进行元基因组分析（D 16、32、64和84 MRF引入）。alpha多样性分析表明，在D 16，D 32和D 64补充后，ChAO1显着较大，但与对照相比，MRF补充层的D 84在D 84时较低（P <0.005）。PCOA图表明，物种水平的细菌群落组成在每个时间点上对照和MRF补充层之间的较大差异（p <0.001）。微生物组分析表明，在补充MRF的84天之后，致病细菌单核细胞增生李斯特菌，弯曲杆菌的空肠，粪肠球菌和梭状芽胞杆菌的差异明显较低。肠道菌群的细菌多样性增加是对入侵病原体的定殖耐药性的关键决定因素之一。在这项研究中，我们观察到在育雏中补充MRF后的84天中，在84天中观察到了更大的α和β多样性，并较低的细菌病原体进行了检测。参考抗生素耐药性和粮食安全的全球挑战，通过使用天然非抗生素替代品来降低致病细菌种类，对于食物链完整性以及氟ock健康尤其重要。
补充芽孢杆菌法属芽孢杆菌对断奶猪的性能，全身免疫和肠道菌群的影响，并用致病性的肠毒素大肠杆菌F18
这项研究的目的是研究饮食补充芽孢杆菌的影响（B.）淀粉菌对断奶猪的生长性能，腹泻，全身免疫和肠道菌群的实验感染了F18肠毒素大肠杆菌（ETEC）。单独容纳50只断奶猪（7.41±1.35 kg bw），并随机分配给以下五种治疗方法之一：假控制（con-），Sham B. amyloliquefaciens（bam-）（BAM-），受到挑战的控制（con +），受到挑战的B. amyloliquefiquefaciens（B. amyloliquefiquefaciens）（BAM +）（BAM +）和挑战Carbadex（agp）（agp + carbadex）。实验持续了28天，适应7天，第一次ETEC接种后21天。ETEC挑战减少（P <0.05）猪的平均每日增益（ADG）。 与CON +，AGP +增强（p <0.05）ADG相比，而B. amyloliquefaciens的补充趋于（p <0.10），以将猪的ADG从接种后第0天增加到21天（PI）。 ETEC挑战在第7和21 pi上增加了（p <0.05）白细胞（WBC），而BAM +猪在第7天PI的WBC趋于较低（p <0.10），并且与CON +相比，在第21天PI的WBC较低（P <0.05）WBC。 与AGP +粪便菌群相比，BAM +在第0天的Lachnospileaceae的相对丰度较低（P <0.05），在第21 pie PI和梭状芽孢杆菌科的相对丰度较低（P <0.05），但较高（p <0.05）的相对丰度在0。ETEC挑战减少（P <0.05）猪的平均每日增益（ADG）。与CON +，AGP +增强（p <0.05）ADG相比，而B. amyloliquefaciens的补充趋于（p <0.10），以将猪的ADG从接种后第0天增加到21天（PI）。ETEC挑战在第7和21 pi上增加了（p <0.05）白细胞（WBC），而BAM +猪在第7天PI的WBC趋于较低（p <0.10），并且与CON +相比，在第21天PI的WBC较低（P <0.05）WBC。与AGP +粪便菌群相比，BAM +在第0天的Lachnospileaceae的相对丰度较低（P <0.05），在第21 pie PI和梭状芽孢杆菌科的相对丰度较低（P <0.05），但较高（p <0.05）的相对丰度在0。在回肠摘要中，BAM +中的香农指数高于AGP +中的div>。bray-curtis pcoa在第21 pi pi中从假猪与ETEC感染的猪收集的卵植物中显示了细菌群落组成的不同。但是，用BAM +中的猪的富度（p <0.05）的相对丰度更大，但在卵形 +猪中，放线菌和杆菌的相对丰度（p <0.05）的相对丰度低于AGP +中的猪。iLeal Digesta具有比BAM +中的Pig较高（p <0.05）的塞梭菌strictu stricto 1，但比猪更低（p <0.05）。总而言之，补充淀粉芽孢杆菌倾向于增加ADG，并且对ETEC感染的猪腹泻的影响有限。