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使用离子迁移率质谱技术探索tau蛋白的PHF6肽段的聚集倾向
摘要：肽和蛋白质聚集涉及寡聚物种的形成，但是不同构象的低聚物和大小之间的复杂相互作用使它们的结构阐明变得复杂。使用离子迁移率质谱法（IMMS），我们旨在揭示与tau蛋白的Ac-PHF6-NH 2肽段聚集的早期步骤，从而区分不同的寡聚物种并获得聚集途径的不足。通常被忽略但可以改变肽的聚集倾向的重要因素是末端上限组。在这里，我们证明了IM-MS的使用来探测AC-PHF6-NH 2，AC-PHF6，PHF6-NH 2和未映射的PHF6肽段的骨料形成的早期阶段。使用硫酸氟T荧光测定法和透射电子显微镜确定了四个PHF6段的聚集倾向。开发了一种基于IM后片段化和四极杆选择的新方法 - 开发了QQ-TOF（捕获的离子迁移率）光谱仪，以增强低聚物分配，尤其是对于高阶聚集体。这种方法推动了同种物种的IM识别限制，它们的签名显得彼此近距离，并随着越来越多的低聚物大小而近距离，并为IM-MS数据的解释提供了新的见解。此外，将TIMS碰撞横截面值与波动波离子迁移率（TWIMS）数据进行比较，以评估被困离子迁移率结果中潜在的仪器偏置。这两个IM-MS仪器平台基于不同的离子迁移率原则，并具有不同的配置，从而为我们提供了对保存弱界生物分子复合物（如肽聚集体）的宝贵见解。
白血病蛋白PHF6和PHIP形成一种染色质复合物，抑制髓样白血病
髓样白血病是具有多种突变景观的异质性癌症。尽管许多突变的基因属于普通蛋白质复合物，但有些缺乏已知的功能伙伴，并且具有不清楚的作用。pHF6是一种良好的染色质结合蛋白，复发突变赋予急性和慢性髓样白血病的不利预后。在这里，使用人PHF6敲除和救援，我们表明PHF6是一种转录阻遏物，可结合活性染色质并抑制茎基因程序。我们剖析了九个临床错义突变，并表明所有人都会产生不稳定的，肌莫尔的或非功能性的PHF6蛋白。在收敛的证据线指导下，我们将PHIP（一种新认识的AML突变蛋白）视为PHF6的功能合作伙伴。我们表明PHIP损失表PHF6损失，并且PHF6需要PHIP占据染色质并发挥下游转录效应。我们的工作将两个不同的白血病蛋白统一的PHF6和PHIP统一成为一种抑制AML茎的常见功能复合物。
PHF10多克隆抗体
背景信息PHF10，也称为BRG1相关因子45a，是498个氨基酸蛋白，该氨基酸蛋白位于核中，属于Sayp家族。PHF10通过染色质重塑参与转录活性调节。它属于神经祖细胞特异性染色质重塑复合物（NPBAF复合物），是神经祖细胞增殖所必需的。在神经发育过程中，随着神经元退出细胞周期并致力于其成人状态，从茎/祖细胞转换为有丝分裂后染色质重塑机制。从增殖神经茎/祖细胞到有丝分裂后神经元的过渡需要NPBAF和NBAF复合物的亚基组成。作为神经祖细胞出口有丝分裂并分化为神经元，含有ACTL6A/BAF53A和PHF10/BAF45A的NPBAF复合物被交换为同源替代ACTL6B/BAF53B和DPF1/BAF45B和DPF3/BAF3/BAF45C SUBUNICECIFICICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICAIFICACTICACTL6B/BAF53B和DPF1/BAF45B和DPF1/BAF45B。NPBAF复合物对于多能神经干细胞的自我更新/增殖能力至关重要。NBAF复合物与波峰一起起着调节基因对树突生长必不可少的活性的作用。PHF10作为几种同工型存在，每个同工型的分子量为42 kDa，37 kDa，51 kDa和56 kDa。
表观遗传读取器 PHF21B 调节小鼠社会记忆和突触可塑性相关基因
简介 哺乳动物大脑中突触连接的形成是一个高度协调的过程，涉及通过各种整合的表观遗传调节器和转录因子精确控制基因表达。突触发育、功能和可塑性失调会导致神经回路缺陷，从而导致多种神经行为障碍 (1, 2)。突触功能障碍是神经发育障碍（如自闭症谱系障碍、智力障碍和精神分裂症）和神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病）的共同特征 (2-4)。例如，NMDA 受体介导 (NMDAR 介导) 和 α -氨基-3-羟基-5-甲基-4-异恶唑丙酸受体介导 (AMPAR 介导) 的传递在自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病中受到不利影响。此外，编码突触后支架蛋白 SH3 和多个锚蛋白重复域 (SHANK) 家族成员的基因突变是自闭症和精神分裂症的风险因素 (1)。此外，患者队列的全外显子组测序和靶向候选基因测序以及家族谱系研究已发现与神经行为障碍相关的罕见变异和遗传风险因素 (2)。虽然这些研究有助于了解与突触失调有关的下游蛋白质，但关于上游调节因子和控制其表达的分子机制仍有许多未知之处。
表观遗传读取器 PHF21B 调节小鼠社会记忆和突触可塑性相关基因
简介 哺乳动物大脑中突触连接的形成是一个高度协调的过程，涉及通过各种整合的表观遗传调节器和转录因子精确控制基因表达。突触发育、功能和可塑性失调会导致神经回路缺陷，从而导致多种神经行为障碍 (1, 2)。突触功能障碍是神经发育障碍（如自闭症谱系障碍、智力障碍和精神分裂症）和神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病）的共同特征 (2-4)。例如，NMDA 受体介导 (NMDAR 介导) 和 α -氨基-3-羟基-5-甲基-4-异恶唑丙酸受体介导 (AMPAR 介导) 的传递在自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病中受到不利影响。此外，编码突触后支架蛋白 SH3 和多个锚蛋白重复域 (SHANK) 家族成员的基因突变是自闭症和精神分裂症的风险因素 (1)。此外，患者队列的全外显子组测序和靶向候选基因测序以及家族谱系研究已发现与神经行为障碍相关的罕见变异和遗传风险因素 (2)。虽然这些研究有助于了解与突触失调有关的下游蛋白质，但关于上游调节因子和控制其表达的分子机制仍有许多未知之处。
PHF5A有助于维持癌症茎...
摘要。目标。癌症干细胞（CSLC）与肿瘤复发，转移和耐药性密切相关。PHD指域蛋白5A（PHF5A）与非小细胞肺癌（NSCLC）的肿瘤发生和发展有关。PHF5A在NSCLC CSLC中的作用和调节机制尚不清楚。这项研究旨在确定CSLC的生物学特征以及PHF5A在维持NSCLC中的作用。方法。H1299-SPHERES和A549-SPHERE通过流式细胞仪通过肿瘤组形成测定和CSLC获得。使用免疫荧光染色，qRT-PCR和Western印刷物测试了CD133，E-钙粘蛋白1，E-钙粘蛋白，波形蛋白，PHF5A和组蛋白脱乙酰基酶8（HDAC8）的表达。CCK-8和Transwell分析来确定NSCLC中CSLC和粘附单层细胞的增殖，迁移和侵袭能力。我们调节CSLC中的PHF5A表达和HDAC活性，以探索NSCLC组织中靶蛋白的PHF5A在Stemness维持中的机理。结果。与单层细胞相比，CSLCs对顺铂介导的抑制，迁移和侵袭的抑制作用以及pHF5A和HDAC8的高表达降低，并伴有EMT标记的改变。NSCLC CSLC中PHF5A的靶向敲低导致茎表型和HDAC8表达降低，而HDAC活性的抑制会影响Stemness的维持。此外，靶蛋白的表达在NSCLC组织中显示出一致的变化。结论。与单层细胞相比，NSCLC的癌症样表型特性发生了变化，PHF5A参与了CSLC的干性维持，并且此过程可能与HDAC8的激活有关。
PHF19 抑制作为多发性骨髓瘤的治疗靶点
表观遗传失调越来越多地被认为是多发性骨髓瘤 (MM) 的一个致病因素。特别是 H3 赖氨酸 27 (H3K27me3) 的三甲基化，它由多梳抑制复合物 2 (PRC2) 的亚基 PHD 指蛋白 19 (PHF19) 催化，最近已被证明是 MM 致瘤性的关键介质。在 MM 中 PHF19 的过度表达与更差的临床结果有关。然而，虽然有越来越多的证据表明 PHF19 过度表达在 MM 致癌作用中起着关键作用，但下游机制仍有待阐明。在当前的研究中，我们使用 PHF19 的功能性敲低 (KD) 来研究 PHF19 的生物学作用，并表明 PHF19KD 会导致体外和体内肿瘤生长减少。 PHF19 KD 后，bcl2、myc 和 EGR 等主要癌症因子的表达降低，进一步强调了 PHF19 在 MM 生物学中的作用。此外，我们的研究结果还强调了 PHF19 过表达对预后的影响，这与生存率下降显著相关。总体而言，我们的研究强调了这样一个前提：针对 PHF19-PRC2 复合物将为新型 MM 疗法开辟道路。