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Pombase -UCL发现 - 伦敦大学学院
了解控制真核细胞行为的复杂机制和过程是现代生物学的基本目标。schizosaccharomyces pombe（S。pombe）是对这种追求至关重要的模型生物之一。利用S. pombe的研究在阐明细胞周期控制的基本原理（Nurse 2020），细胞分裂（Mangione and Gould 2019），染色体生物学（Sato等人（Sato等）中起着关键作用（Sato等人。2021），表观遗传遗传（Grewal 2023），端粒生物学（Kanoh 2023）和许多其他核心保存的细胞过程。最近，衰老（Ohtsuka等人2023），自噬（Alao等人2023），RNA ProseSing（Larochelle等人 2017），转录后调节（Hernández-Elvira和Sunnerhagen 2022），自噬（XU和DU 2022）和线粒体过程（Dinh and Bonnefoy 2023）已成为更多焦点的领域。 Pombase（https://www.pombase.org）是S. Pombe的权威模型有机体数据库（MOD），是一个支持裂变酵母研究人员和更广泛的科学界的全面知识基础（Lock等人（Lock等） 2020; Harris等。 2022; Toda等。 2023）。 通过详细的策展，标准化和从数千个聚焦典范中得出的信息的整合，它为基因和蛋白质水平的分子数据提供了一个存储库。 Pombase的目标是成为一个完全可访问的，可访问的，可互操作的和可重复使用的（公平） - 集合资源（Wilkinson等人。 2016）。2023），RNA ProseSing（Larochelle等人2017），转录后调节（Hernández-Elvira和Sunnerhagen 2022），自噬（XU和DU 2022）和线粒体过程（Dinh and Bonnefoy 2023）已成为更多焦点的领域。Pombase（https://www.pombase.org）是S. Pombe的权威模型有机体数据库（MOD），是一个支持裂变酵母研究人员和更广泛的科学界的全面知识基础（Lock等人（Lock等）2020; Harris等。2022; Toda等。2023）。通过详细的策展，标准化和从数千个聚焦典范中得出的信息的整合，它为基因和蛋白质水平的分子数据提供了一个存储库。Pombase的目标是成为一个完全可访问的，可访问的，可互操作的和可重复使用的（公平） - 集合资源（Wilkinson等人。2016）。除了复杂的查询工具外，Pombase还提供了跨多个分类轴的生物和域级概述，包括功能，过程，位置，表型，人类疾病基因直系同源物，策展和特征性进展。
病原体 - 宿主相互作用数据库（PHI-base）
Phi-Base 5网站上的软件开发工作由Molecular Connections Pvt Ltd（印度班加罗尔）提供。Phi-canto策划工具是与剑桥大学的Pombase团队合作开发的，金·卢瑟福（Kim Rutherford）提供软件开发和Val Wood提供了有关新策展过程的咨询和培训。由Incatools开发的本体论开发试剂盒的协助，由Upheno Project与Nico Matentzoglu协商（Sentancicly Ltd，曾经是EMBL-EBI）协商，由Upheno Project开发的统一表型本体学的开发。基因本体论的编辑者，尤其是Pascale Gaudet（瑞士 - 普罗特，瑞士生物信息学研究所），开发了新的本体论术语，以协助Phi-Base中病原体 - 霍斯特过程的策划。自2011年以来，Phi-base数据已在每个Ensembl释放中托管。Phi-Canto和Phipo的开发是由英国生物技术与生物科学研究委员会（BBSRC）（BB/S020020/1）资助的。PHI-BASE的持续发展目前由Rothamsted Research的两个学院战略计划提供资金：增长健康（BB/X010953/1; BBS/E/E/RH/230003A）并提供可持续的小麦（BBS/E/E/RH/230001B）。