b) 阐明肿瘤微环境 (TME) 细胞生态系统中的串扰。几项使用下一代测序的遗传景观研究已几乎完整地描述了转录定义的 DLBCL 亚型(如细胞源分类)背景下最常见的体细胞基因改变和结构基因组变化 (4–7)。然而,人们对 DLBCL 的免疫生物学知之甚少,这反映在对免疫系统压力的反应中特定体细胞基因突变的克隆选择和 TME 的特定组成。DLBCL 的 TME 主要由非恶性免疫细胞组成,例如 T 细胞、NK 细胞、巨噬细胞和基质细胞。最近的研究表明,TME 在肿瘤细胞维持、免疫逃逸和治疗失败中起关键作用 (8, 9)。鉴于激活免疫效应细胞对消除癌症的重要性,许多免疫疗法,如程序性细胞死亡 1 (PD-1) 阻断、嵌合抗原受体 (CAR) T 细胞和 T 细胞结合抗体,已在多种癌症(包括淋巴瘤)中得到评估并获得 FDA 批准 (10–13)。然而,对免疫生物学的深入了解可以导致开发更具特异性的治疗方法,并可以指导合理的
目的:在这项概念验证研究中,我们提出了一种新的方法,用于将泡沫的数字量化(优先表达的黑色素瘤抗原)作为诊断辅助,以区分良性和恶性黑素细胞病变。所提出的方法利用了Prame和Sox10的免疫组织化学虚拟双核染色来精确识别感兴趣的黑素细胞细胞,该细胞与数字图像分析相结合以量化词点。方法:我们的研究包括10种化合物Nevi,3个Halo Nevi和10个黑色素瘤。组织载玻片用泡沫染色,扫描,盖玻璃玻璃玻璃玻璃,用Sox10染色,再次扫描,最后进行数字分析。使用标准的定位系统,将数字定量的核索引与皮肤科医生的手动定性评估进行了比较。结果:数字量化的核索引的灵敏度为70%,特异性为100%,用于将黑色素瘤与良性病变分离。手动定性核得分的灵敏度为60%,特异性为100%。使用ROC-Analyses比较两种方法,我们的数字定量方法(AUC:0.931,95%CI:0.834; 1.00,SD:0.050)与手动定性方法(AUC:0.877,95%CI:0.725:0.725; 1.725; 1.00,SD:0.725; 1.00; 1.00; 1.00; 0.078:0.025;结论:我们发现,我们的新型数字定量方法至少在将病变分类为良性或恶性的情况下与当前的手动定性评估一样精确。我们的方法具有成为操作员独立,客观和可复制的优势。此外,我们的方法可以轻松地在已经数字化的病理部门中实施。鉴于队列的大小很小,要进行更多的研究来验证我们的发现。
Dermtech色素性病变测定(PLA)测试测量六个基因的表达(Prame,Linc00518,CMIP,B2M,ACTB,PPIA)。对通过直径至少5 mm的皮肤样品进行了测试,这些病变是通过角质层标本的非侵入性,专有的粘合剂斑块活检获得的。该测试在手掌,脚底,指甲或粘膜的手掌上不起作用,不应用于出血或溃疡病变。PLA测试报告包括两个结果。第一个是PLA MAGE(黑色素瘤相关的基因表达),它表明风险较低(未检测到Prame和Linc00518表达),中等风险(检测到Prame或Linc00518的表达)或高风险(同时检测到Prame和Linc00518的表达)。第二个结果是算法PLA评分,范围为0至100,得分较高,表明对恶性疾病的怀疑更高。尚不清楚PLA测试是否应用作皮肤镜检查的替代,分类或附加测试。PLAPLUS™测试还包括对TERT变体的测试。
ALK (4) NRAS (2) ARID1A (1) NRG1 (2) ATM (2) NTRK (6) ATR (1) P53 (1) BRAF (15) PALB (1) BRCA (2) PDGFR (2) CCND (1) PIK3 (5) CDK4/6 (1) POLD1 (2) CDKN2 (1) POLE (2) ctDNA (3) PRKC (2) CTNNB1 (1) PTCH1 (2) DDR (5) RAF (2) EGFR (10) RAS (2) ERK (2) RET (4) EWSR1 (1) ROS1 (5) EZH2 (1) SMO (1) FBXW7 (1) STK11 (1) FGFR (4) TAF15 (1) GNAQ/11 (2) TMB (4) HRD (7) TP53 (1) IDH (2) TSC (1) KIT (2) UGT1A1 (1) KRAS (24) CCNE1 (1) MDM2 (1) CLDN (3) MEK (3) FET (1) MET (5) FRa (1) MMR (2) FUS (1) MRD (2) HER2 (12) MSI-H (1) MAGE (2) MTAP (4) MUC (1) MYC (1) PD-L1 (12) Nectin-4 (2) PRAME (1) NF1 (6)
摘要癌症/睾丸抗原(CTA)在黑色素瘤和肺癌中广泛表达,成为这些恶性肿瘤中疫苗接种策略和基于T细胞的疗法的有希望的靶标。尽管认识到肿瘤内异质性对免疫疗法的临床反应的基本影响,但我们对CTA表达中肿瘤内异质性的理解仍然有限。我们采用单细胞mRNA测序来描述临床衍生的黑色素瘤和肺癌样品中癌细胞的CTA表达谱。我们的发现显示了CTA表达中高度的肿瘤内转录异质性。在黑色素瘤中,每个细胞都表达至少一个CTA。 但是,大多数单独的CTA,包括广泛使用的治疗靶标NY-ESO-1和MAGE,都局限于细胞的亚群,并在其表达中不协调,从而导致具有不同CTA谱的癌细胞的镶嵌物。 但是,观察到协调的表达主要在高度结构和进化相关的CTA基因中。 重要的是,在黑色素瘤中均匀地表达了CTA的较小子集,包括Prame和Gage和Mage-A家族的几个成员,强调了它们作为治疗靶标的潜力。 在肺癌中还观察到了CTA表达的广泛异质性。 然而,CTA阳性癌细胞的频率明显较低,并且仅在该癌症类型的五个肿瘤之一中鉴定出同质表达的CTA。在黑色素瘤中,每个细胞都表达至少一个CTA。但是,大多数单独的CTA,包括广泛使用的治疗靶标NY-ESO-1和MAGE,都局限于细胞的亚群,并在其表达中不协调,从而导致具有不同CTA谱的癌细胞的镶嵌物。协调的表达主要在高度结构和进化相关的CTA基因中。重要的是,在黑色素瘤中均匀地表达了CTA的较小子集,包括Prame和Gage和Mage-A家族的几个成员,强调了它们作为治疗靶标的潜力。在肺癌中还观察到了CTA表达的广泛异质性。然而,CTA阳性癌细胞的频率明显较低,并且仅在该癌症类型的五个肿瘤之一中鉴定出同质表达的CTA。我们的发现强调了在免疫疗法开发和临床测试中仔细选择CTA目标选择的必要性,并提供了一个合理的框架来识别最有希望的候选人。
造血干细胞移植(HSCT)是高危急性淋巴细胞白血病(ALL)的患者的治疗方法,但复发仍然是治疗衰竭的主要原因。为了防止疾病复发,我们准备并注入了供体衍生的多种白血病抗原 - 特定T细胞(MLSTS),靶向启发,WT1和Survivin,它们是白血病相关的抗原,经常在B-和T-All中表达。我们的目标是最大程度地提高移植物与白血病效应,同时最大程度地减少移植物抗宿主病(GVHD)的风险。我们对11例患者(8个儿科,3个成人)患者给予MLST(剂量范围,0.5 3 10 7至2 3 10 7细胞),没有观察到剂量限制毒性,急性GVHD或细胞因子释放综合征。8个可评估患者中有6名保留在长期完全缓解中(中值:46.5个月;范围9-51)。在这些个体中,我们在输注后不久检测到肿瘤反应性T细胞的频率增加,对靶向和非靶向,已知的肿瘤相关抗原的活性表明体内抗原扩散。相比之下,这两名经历了复发的患者,这种体内扩增不存在。总而言之,同种异体HSCT后供体衍生的MLST是可行且安全的,可能有助于控制疾病,这证明了体内肿瘤指导的T细胞扩张的证明。因此,这种方法代表了预防所有患者复发的有前途的策略。
摘要目的:过继转移、离体扩增的多抗原靶向 T 细胞 (multiTAA-T) 代表了一种新的、潜在有效且无毒的乳腺癌 (BC) 治疗方法。在这项首次人体试验中,我们研究了向复发/难治/转移性 BC 患者施用靶向肿瘤表达抗原 Survivin、NY-ESO-1、MAGE-A4、SSX2 和 PRAME 的多 TAA T 细胞的安全性和临床效果。材料和方法:多 TAA T 细胞产品是从接受过大量治疗的所有亚型转移性或局部复发性不可切除 BC 患者的外周血中生成的,并以 2 × 10 7 /m 2 的固定剂量水平输注。患者间隔 4 周接受两次细胞输注,并确定安全性和临床活性。细胞在门诊环境中施用,并且未经淋巴细胞清除化疗。结果:所有患者均患有雌激素受体/孕激素受体阳性的 BC,其中一名患者还患有人类表皮生长因子受体 2 阳性。没有治疗相关毒性,输注耐受性良好。在接受并输注多 TAA T 细胞的 10 名接受过大量治疗的患者中,9 名病情出现进展,而一名接受过 10 种疗法的患者病情稳定时间延长(5 个月),这与针对靶抗原的 T 细胞体内扩增和持续存在有关。此外,在 7/10 名接受多 TAA 输注后的患者中观察到抗原扩散和针对一系列非靶向肿瘤抗原的 T 细胞内源性激活。结论:多 TAA T 细胞耐受性良好,并可诱导难治性 BC 患者的病情稳定。这与体内 T 细胞扩增、持续存在和抗原扩散有关。这种方法的未来方向可能包括其他策略,以增强多 TAA T 细胞对 BC 患者的治疗效果。
弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 是一种侵袭性造血肿瘤,会影响人类和狗。虽然之前对犬 DLBCL (cDLBCL) 的研究大大提高了我们对该疾病的了解,但这些研究的大部分都依赖于全外显子组测序,而全外显子组测序在检测编码区以外的拷贝数畸变和其他基因组变化方面的能力有限。此外,许多此类研究缺乏足够的临床随访数据,因此很难在遗传变异和患者结果之间建立有意义的关联。我们的研究旨在使用全基因组测序来描述 cDLBCL 的突变情况,这些样本来自之前参加临床试验的 43 只狗,并且有纵向随访。我们专注于识别与编码点突变、拷贝数畸变显著或反复突变的基因,以及它们与患者结果的关联。我们确定了 26 个反复突变的基因、18 个拷贝数增加和 8 个拷贝数丢失。与之前的研究一致,最常见的突变基因包括 TRAF3 、 FBXW7 、 POT1 、 TP53 、 SETD2 、 DDX3X 和 TBL1XR1 。最显著的拷贝数增加发生在 13 号染色体上,与 MYC 和 KIT 等关键致癌基因重叠,而最常见的缺失是 26 号染色体上的局部缺失,包括 IGL 、 PRAME 、 GNAZ 、 RAB36 、 RSPH14 和 ZNF280B 。值得注意的是,我们的复发性突变基因集中显著富集了参与表观遗传调控的基因。特别是,我们在两个组蛋白基因 H3C8 和 LOC119877878 中发现了热点突变,导致 H3K27M 改变,预计会导致基因表达失调。最后,生存分析显示,H3C8 中的 H3K27M 突变与无进展生存的风险比增加有关。拷贝数异常与生存无关。这些发现强调了表观遗传失调在 cDLBCL 中的关键作用,并确认狗是研究新型组蛋白修饰治疗策略的生物活性的相关大型动物模型。
Love Al,Steen DM的Van,Van MM Loenen,Handway RS,Boer MD,Red Ro AH,Lugtart GJ,Van KC,Hiemstra PS,Hiemstra PS,犹太人I,Griffioen MD,Veelen PA,Veelen PA,Falkenburg JH,MH。PRAME特异性的Allo-HLA-Strict T细胞具有有效的反应性反应使用T-sell基因转移。Clin.Cancer Res。 2011; 17:5615-5625。 Lugthart G,Albon SJ,MG的奶酪,Meij P,湖泊AC,Amrolia PJ。 对称生成器 J.Mumunother。 2012; 35:42-5 Albon SJ,Mancao C,Gilmour K,Ship G,Rich I,Brewin J,Lugthart G,Wallace R,Amrolia PJ。 优化CD71 的方法 细胞疗法。 2013; 15:109-1 Rich I,Brewin J,Blugthart G,Albon SJ,Puls M,Amrolia PJ。 EBV-规格的产生鼓膜对钙化抑制剂具有免疫适应性的抗性。 AM.J.Transplant 2013; 13:3244-3 lugthart G,老热,MM的老家,CM,Holten MG,MH,Bredius RG,Van Tol MJ,Lankester AC。 他们将能够调和和调和长期股东: bio。 Lugthart G,Oomen MA,CM的Oomen,Ball LM,Brests D,WJ Cloud,Smiers FJ,FJ,Vermont CL,Bredius RG,Schilham MW,MW,Van To MJ,MJ,Lankester AC。 2015; 21:293-299。Clin.Cancer Res。2011; 17:5615-5625。 Lugthart G,Albon SJ,MG的奶酪,Meij P,湖泊AC,Amrolia PJ。 对称生成器 J.Mumunother。 2012; 35:42-5 Albon SJ,Mancao C,Gilmour K,Ship G,Rich I,Brewin J,Lugthart G,Wallace R,Amrolia PJ。 优化CD71 的方法 细胞疗法。 2013; 15:109-1 Rich I,Brewin J,Blugthart G,Albon SJ,Puls M,Amrolia PJ。 EBV-规格的产生鼓膜对钙化抑制剂具有免疫适应性的抗性。 AM.J.Transplant 2013; 13:3244-3 lugthart G,老热,MM的老家,CM,Holten MG,MH,Bredius RG,Van Tol MJ,Lankester AC。 他们将能够调和和调和长期股东: bio。 Lugthart G,Oomen MA,CM的Oomen,Ball LM,Brests D,WJ Cloud,Smiers FJ,FJ,Vermont CL,Bredius RG,Schilham MW,MW,Van To MJ,MJ,Lankester AC。 2015; 21:293-299。2011; 17:5615-5625。Lugthart G,Albon SJ,MG的奶酪,Meij P,湖泊AC,Amrolia PJ。对称生成器J.Mumunother。 2012; 35:42-5 Albon SJ,Mancao C,Gilmour K,Ship G,Rich I,Brewin J,Lugthart G,Wallace R,Amrolia PJ。 优化CD71 的方法 细胞疗法。 2013; 15:109-1 Rich I,Brewin J,Blugthart G,Albon SJ,Puls M,Amrolia PJ。 EBV-规格的产生鼓膜对钙化抑制剂具有免疫适应性的抗性。 AM.J.Transplant 2013; 13:3244-3 lugthart G,老热,MM的老家,CM,Holten MG,MH,Bredius RG,Van Tol MJ,Lankester AC。 他们将能够调和和调和长期股东: bio。 Lugthart G,Oomen MA,CM的Oomen,Ball LM,Brests D,WJ Cloud,Smiers FJ,FJ,Vermont CL,Bredius RG,Schilham MW,MW,Van To MJ,MJ,Lankester AC。 2015; 21:293-299。J.Mumunother。2012; 35:42-5Albon SJ,Mancao C,Gilmour K,Ship G,Rich I,Brewin J,Lugthart G,Wallace R,Amrolia PJ。 优化CD71 的方法 细胞疗法。 2013; 15:109-1 Rich I,Brewin J,Blugthart G,Albon SJ,Puls M,Amrolia PJ。 EBV-规格的产生鼓膜对钙化抑制剂具有免疫适应性的抗性。 AM.J.Transplant 2013; 13:3244-3 lugthart G,老热,MM的老家,CM,Holten MG,MH,Bredius RG,Van Tol MJ,Lankester AC。 他们将能够调和和调和长期股东: bio。 Lugthart G,Oomen MA,CM的Oomen,Ball LM,Brests D,WJ Cloud,Smiers FJ,FJ,Vermont CL,Bredius RG,Schilham MW,MW,Van To MJ,MJ,Lankester AC。 2015; 21:293-299。Albon SJ,Mancao C,Gilmour K,Ship G,Rich I,Brewin J,Lugthart G,Wallace R,Amrolia PJ。优化CD71细胞疗法。2013; 15:109-1Rich I,Brewin J,Blugthart G,Albon SJ,Puls M,Amrolia PJ。EBV-规格的产生鼓膜对钙化抑制剂具有免疫适应性的抗性。 AM.J.Transplant 2013; 13:3244-3 lugthart G,老热,MM的老家,CM,Holten MG,MH,Bredius RG,Van Tol MJ,Lankester AC。 他们将能够调和和调和长期股东: bio。 Lugthart G,Oomen MA,CM的Oomen,Ball LM,Brests D,WJ Cloud,Smiers FJ,FJ,Vermont CL,Bredius RG,Schilham MW,MW,Van To MJ,MJ,Lankester AC。 2015; 21:293-299。EBV-规格的产生鼓膜对钙化抑制剂具有免疫适应性的抗性。AM.J.Transplant 2013; 13:3244-3 lugthart G,老热,MM的老家,CM,Holten MG,MH,Bredius RG,Van Tol MJ,Lankester AC。 他们将能够调和和调和长期股东: bio。 Lugthart G,Oomen MA,CM的Oomen,Ball LM,Brests D,WJ Cloud,Smiers FJ,FJ,Vermont CL,Bredius RG,Schilham MW,MW,Van To MJ,MJ,Lankester AC。 2015; 21:293-299。AM.J.Transplant 2013; 13:3244-3lugthart G,老热,MM的老家,CM,Holten MG,MH,Bredius RG,Van Tol MJ,Lankester AC。他们将能够调和和调和长期股东:bio。Lugthart G,Oomen MA,CM的Oomen,Ball LM,Brests D,WJ Cloud,Smiers FJ,FJ,Vermont CL,Bredius RG,Schilham MW,MW,Van To MJ,MJ,Lankester AC。2015; 21:293-299。2015; 21:293-299。Cidofovir对没有T细胞重构的干细胞移植受者中腺病毒血浆DNA水平的影响。biol.blood骨髓移植。Lugthart G,Van Ostaijen-Ten Dam MM,Van Tol MJ,Lankester AC,Schilham MW。CD56(DIM)CD16( - )NK细胞表型可以通过冷冻保存诱导。血液2015; 125:1842-1843。