综合多矩分析揭示了与疾病进展相关的新型特发性肺纤维化亚型。呼吸研究。24(1),1-12。•Ren,Yue,Peifeng Ruan,Mark Segal,Mirela Dobre,Jeffrey R. Schelling,Upasana Banerjee,Tariq Shafi,Peter Ganz,Ruth F. Dubin和Cric研究研究人员。2023。评估透析肾衰竭患者的大规模适体蛋白质组学平台。PLOS ONE。 18(12),E0293945。 •Peifeng Ruan和Shuang Wang。 2021。 disnep:一种特异性基因网络增强,以改善优先候选疾病基因的优先级。 生物信息学的简报,22(4),P.BBAA241。 •Peifeng Ruan,Shuang Wang和Hua Liang。 2020。mirpls:一种使用microRNA的癌症亚型的部分线性结构标识符方法。 生物信息学,36(19),pp.4902-4909。 •Peifeng Ruan,Ya Wang,Ronglai Shen和Shuang Wang。 2019。 使用关联信号注释来增强相似性网络融合。 生物信息学,35(19),pp.3718-3726。 •Hailin Huang,Jizi Shangguan,Peifeng Ruan和Hua Liang。 2019。 在高维AFT模型中的双层特征选择,并应用了基因组研究。 遗传学和分子生物学中的统计应用,18(5)。 •Ya Wang,Min Qian,Peifeng Ruan,Andrew E. Teschendorff和Shuang Wang。 2019。 使用加权表观遗传距离的方法检测表观遗传缺陷。 核酸研究,47(1),pp.e6-e6。PLOS ONE。18(12),E0293945。•Peifeng Ruan和Shuang Wang。2021。disnep:一种特异性基因网络增强,以改善优先候选疾病基因的优先级。生物信息学的简报,22(4),P.BBAA241。•Peifeng Ruan,Shuang Wang和Hua Liang。2020。mirpls:一种使用microRNA的癌症亚型的部分线性结构标识符方法。生物信息学,36(19),pp.4902-4909。•Peifeng Ruan,Ya Wang,Ronglai Shen和Shuang Wang。2019。使用关联信号注释来增强相似性网络融合。生物信息学,35(19),pp.3718-3726。•Hailin Huang,Jizi Shangguan,Peifeng Ruan和Hua Liang。2019。在高维AFT模型中的双层特征选择,并应用了基因组研究。遗传学和分子生物学中的统计应用,18(5)。•Ya Wang,Min Qian,Peifeng Ruan,Andrew E. Teschendorff和Shuang Wang。2019。使用加权表观遗传距离的方法检测表观遗传缺陷。核酸研究,47(1),pp.e6-e6。•Peifeng Ruan,Jing Shen,Regina M. Santella,Shuigen Zhou和Shuang Wang。2016。nepic:一种使用均值和方差组合信号进行表观遗传学研究的网络辅助算法。核酸研究,44(16),E134-E134。
(www.pichia.com),在这种酵母中成功表达了5000多种不同的蛋白质(Schwarzhans等,2017)。在P. p. p. p. p. p. p. p. p. p. opterer工程中的典型策略包括启动子工程(Nong等,2020; Lai等,2024; Zhou等,2023),信号肽修改(Lie等,2015),拷贝数的增加(Liu等,2020年; putteas et ease; wang al。 2019年),以及伴侣因子的引入(Zheng等,2019;Raschmanová等,2021)。 但是,基因组中的直接基因敲除可以导致P. P. P. P. P. p. p. pastoris代谢途径内的特定功能的丧失,从而破坏其整体代谢网络。 相比之下,利用合成生物学工具调节基因表达可能比传统的敲除或过表达方法更有效。 基因表达调节是许多细胞过程的基础(De Nadal等,2011; Nielsen和Keasling,2016年)。 当前,微生物中基因调节的主要工具是定期间隔短的短质体重复序列(CRISPR)系统的。 但是,使用CRISPR进行基因激活或抑制通常需要在CRISPR系统中蛋白质失活,添加激活或抑制域,以及仔细选择合适的SGRNA靶位点。 因此,CRISPR系统相对复杂且耗时。 此外,CRISPR的应用还受到宿主细胞接受度,异物蛋白质表达效率和目标位点选择准确性等因素的影响,这使得优化过程更加繁琐。在P. p. p. p. p. p. p. p. p. p. opterer工程中的典型策略包括启动子工程(Nong等,2020; Lai等,2024; Zhou等,2023),信号肽修改(Lie等,2015),拷贝数的增加(Liu等,2020年; putteas et ease; wang al。 2019年),以及伴侣因子的引入(Zheng等,2019;Raschmanová等,2021)。但是,基因组中的直接基因敲除可以导致P. P. P. P. P. p. p. pastoris代谢途径内的特定功能的丧失,从而破坏其整体代谢网络。相比之下,利用合成生物学工具调节基因表达可能比传统的敲除或过表达方法更有效。基因表达调节是许多细胞过程的基础(De Nadal等,2011; Nielsen和Keasling,2016年)。当前,微生物中基因调节的主要工具是定期间隔短的短质体重复序列(CRISPR)系统的。但是,使用CRISPR进行基因激活或抑制通常需要在CRISPR系统中蛋白质失活,添加激活或抑制域,以及仔细选择合适的SGRNA靶位点。因此,CRISPR系统相对复杂且耗时。此外,CRISPR的应用还受到宿主细胞接受度,异物蛋白质表达效率和目标位点选择准确性等因素的影响,这使得优化过程更加繁琐。在基因激活中,需要引入其他转录激活剂,而在基因抑制中,抑制因子必须进行精确设计和交付,以确保特定的调节。因此,尽管具有强大的基因调控能力,但CRISPR系统的操作复杂性和时间成本很高(Casas-Mollano等,2020; Chen等,2020)。相比,RNA干扰(RNAi)直接靶向RNA,影响蛋白质翻译,并为基因调节提供了更简单的方法。RNAi是一种由双链RNA(DSRNA)激活的基因沉默途径(Drinnenberg等,2009),由核糖核酸酶III(RNAseIII)酶处理,该酶加工成小型小型干扰RNA(sirnas)。dicer是一种酶,可将双链RNA裂解成小siRNA片段。这些siRNA随后引导参与RNA裂解的Argonaute蛋白靶向和裂解转录本,有效地沉降基因表达(Wang等,2019)。RNAi系统及其基本组件(dicer,argonaute和sirnas)通过简单的质粒转化步骤提供了一种更直接和灵活的方法来沉默基因。这减少了时间和精力,从而促进了各种菌株基因抑制策略的快速发展(Crook等,2014)。本报告详细介绍了P. P. P. P. P. rnai系统的第一个建立。可以创建这样的系统的假设是基于观察结果,即引入Argonaute蛋白和siRNA到P. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. apastoris。基因修饰的P. p. p. p. p. p. press这表明在P. Pastoris基因组中编码丁香样蛋白的基因的潜在存在。这项研究成功地证明了通过引入Hairpin RNA通过RNAi系统抑制单基因(增强的绿色荧光蛋白(EGFP))和双基因(EGFP /组氨酸(His))。
着:Shaotang歌曲,Yu Teng,Weichen Tang,Zhen Xu,Yuanyuan He,Jiawei Ruan,Takahiro Kojima,
这项工作得到了国家科学技术重大项目(2022ZD0114900)的部分支持Horizon Europe框架通过可触及的项目(101092518)。(Zihang Zhao和Yuyang li对这项工作也同样贡献。相应的作者:Lecheng Ruan和Yixin Zhu。)Zihang Zhao和Yixin Zhu曾与中国北京大学100871北京大学的人工智能研究所一起(电子邮件:zhaozihang@stu@stu.pku.edu.edu.cn; yixin.zhu@pku.edu.edu.cn)。Yuyang Li和Zhenghao Qi曾在中国北京大学,北京大学,北京大学和北京通用人工智能研究所,中国北京100080,中国以及自动化部,北京大学,北京大学,北京大学,北京大学,北京大学,北京100084,中国(电子邮件): {liyuyang20,qi-zh21}@mails.tsinghua.edu.cn)。Wanlin Li与中国北京100080的北京通用人工智能研究所合作(电子邮件:liwanlin@bigai.ai)。Lecheng Ruan曾在中国北京100871的北京大学工程学院以及中国武汉430075的PKU-Wuhan人工智能研究所(Ruanlecheng@ucucla.edu)任职。Zihang Zhao和Lecheng Ruan在这项工作中也部分地在北京通用人工智能研究所中。数字对象标识符(DOI):请参阅此页面的顶部。Kaspar Althoefer曾在英国伦敦皇后大学伦敦皇后大学工程与材料科学学院内的高级机器人中心 @皇后玛丽(Queen Mary),伦敦E1 4NS(电子邮件:k.althoefer@qmul.ac.uk)。
3。ruan d#,ye zw#,yuan s#,li z#,Zhang W#,ong cp,tang k,tank k,tam ttkk,guo j,xuan y,xuan y,huang y,zhang Q,Zhang Q,Zhang Q,Lee cl,Lu L,Lu L, div>>
si。Zhangyong,Li,J.,Ruan,L.,Reghu,S.,Ooi,Y.J.,Li,P.,Zhu,Y.,Hammond,P.T.,Verma,C.S.,Bazan,G.C.(2023)。设计师共β-肽共聚物选择性靶向抗性和生物膜革兰氏阴性细菌。生物材料,294,122004-。https://dx.doi.org/10.1016/j.biomaterials.2023.122004
Maoli Gong, 2, 2, 4 , 61 Jiayi Li, 5, 6, 61 Zilong Qin, 7, 61 9 Haoran Liu, 5 Friends, 5 Joel A. Roses, 10 Ana S.A. Sullivan, 12, Tianyun Wang, 16, 17 Susan M. Hiatt, Lahner, 21 Sherr Elliott, 22 Yiyan Ruan, 23 Cyril Mignot, 24 Boris Keren, 24 Hua Xie,Julie Gauthier,36,37 Jacques L. Michaud,37,38
火星样本回收直升机:旋翼机从火星表面回收第一批样本 (1359) Shannah Withrow-Maser、* H. Cummings、W. Johnson、C. Malpica、L. Meyn、N. Schatzman、L. Young,NASA 艾姆斯研究中心;M. Keennon、B. Pipenberg,AeroVironment, Inc.;H. Grip、T. Tzanetos,NASA 喷气推进实验室;B. Allan,NASA 兰利研究中心;A. Chan、W. Koning、A. Ruan,Science & Technology Corp.
另请参阅:体量子场的熵和蒸发黑洞的纠缠楔。A. Almheiri、N. Engelhardt、D. Marolf、H. Maxfield。arXiv:1905.08762。从半经典几何看霍金辐射的佩奇曲线。A. Almheiri、R. Mahajan、J. Maldacena、Y. Zhao。arXiv:1908.10996。复制虫洞和霍金辐射的熵。A. Almheiri、T. Hartman、J. Maldacena、E. Shaghoulian、A. Tajdini。arXiv:1911.12333。其他重要工作作者:Akers、Harlow、Bousso、Tomasevic、Chen、Fisher、Hernandez、Myers、Ruan、Rozali、Van Raamsdonk、Sully、Waddell、Wakeham
1 1衰老,抗衰老与认知表现实验室,上海老年医学与老年研究所,福丹大学,200040年上海2上海2上海临床老年医学临床主要实验室,霍阿德邦医院,上海医院,上海医学院,福丹医学院,200040年,Inever and Insterry and Intern,医院,医学神经生物学国家主要实验室和MOE脑科学中心,福丹大学,200031年上海,中国上海4 NHC福丹大学的主要听觉医学实验室,200032年上海,中国5号,中国5032年,教育型和神经科学系“ dibrain and dibrain of Bari aildo Moro and of Fornation of dotairone”美国国家胃肠病学研究所“ Saverio de Bellis”研究院,卡斯特拉纳·格罗特(Castellana Grotte),意大利Bari 70121 *通信:136661717346@163.com(Qingwei ruan); bingchen@fingchen@fudan@fudan.edu.cn(bing chen)1衰老,抗衰老与认知表现实验室,上海老年医学与老年研究所,福丹大学,200040年上海2上海2上海临床老年医学临床主要实验室,霍阿德邦医院,上海医院,上海医学院,福丹医学院,200040年,Inever and Insterry and Intern,医院,医学神经生物学国家主要实验室和MOE脑科学中心,福丹大学,200031年上海,中国上海4 NHC福丹大学的主要听觉医学实验室,200032年上海,中国5号,中国5032年,教育型和神经科学系“ dibrain and dibrain of Bari aildo Moro and of Fornation of dotairone”美国国家胃肠病学研究所“ Saverio de Bellis”研究院,卡斯特拉纳·格罗特(Castellana Grotte),意大利Bari 70121 *通信:136661717346@163.com(Qingwei ruan); bingchen@fingchen@fudan@fudan.edu.cn(bing chen)