小草原松鸡 ( Tympanuchus pallidicinctus; LEPC) 是北美草原松鸡的标志性物种,以其华丽而壮观的繁殖季节展示而闻名。不幸的是,该物种在其大部分历史分布区内都已消失,当代种群数量也急剧下降,这主要是由于气候和人为因素造成的。这些下降导致美国鱼类和野生动物管理局于 2022 年决定根据 1973 年《濒危物种法》将两个不同的种群群体 (DPS;即北部和南部 DPS) 确定并列为受威胁或濒危物种。在此,我们描述了一个带注释的参考基因组,该基因组是从南部 DPS 采集的 LEPC 样本生成的。我们选择了南部 DPS 的代表,因为北部 DPS 存在基因渗入的可能性,那里的一些种群与大草原松鸡 ( Tympanuchus cupido ) 杂交。这个新的 LEPC 参考组装体由 206 个支架折叠、45 Mb 的 N50 和 15,563 个预测的蛋白质编码基因组成。我们通过估计代表性 LEPC 和相关物种的全基因组杂合性来证明这个新基因组组装体的实用性。LEPC 样本中的杂合性为 0.0024,接近相关物种范围(0.0003–0.0050)的中间值。总体而言,这个新的组装体提供了宝贵的资源,将增强草原松鸡的进化和保护遗传学研究。
Helicoverpa Zea(鳞翅目:夜养科)是北美洲和南美主要种植作物的害虫。该物种适应了不同的宿主植物,并对几种杀虫剂产生了抗性,包括苏云金芽孢杆菌(BT)杀虫蛋白在转基因棉和玉米中。Helicoverpa Zea种群在热带和亚热带地区全年持续存在,但是季节性迁移到温带地区增加了相关作物损害的地理范围。为了更好地了解这些生理和生态特征的遗传基础,我们为来自BT抗性菌株的单个H. Zea雄性HAZSTARK_CRY1ACR生成了高质量的染色体水平组装。HI-C数据用于将最初的375.2 MB重叠组装脚手架成30个常染色体和Z性染色体(支架N50 = 12.8 MB和L50 = 14)。SCAF折叠组件是通过新型管道PolishClr对错误校正的。线粒体基因组通过改进的管道组装并注释。对该基因组组装的评估表明,鳞翅目基准通用单拷贝直系同源物集的98.8%是完整的(98.5%作为完整的单副本)。重复元素约占组装的大约29.5%,其多数(11.2%)被归类为恢复元素。这个针对H. Zea的染色体规模参考组件,Ilhelzeax1.1,将促进未来的研究,以评估和增强可持续的作物生产实践。
背景:多种因素会导致缺血/再灌注损伤 (IRI),包括激活 NLRP3 炎症小体及其副产物,例如白细胞介素 1β (IL-1β) 和 caspase-1。然而,NLRP3 可能相反地表现出心脏保护特性。本研究旨在评估新型 NLRP3 抑制剂 INF195 在体外和体内的保护作用。方法:为了研究 NLRP3 与心肌 IRI 之间的关系,我们合成了一系列新型 NLRP3 抑制剂,并通过对接研究研究了它们假定的结合模式。通过体外研究,我们确定 INF195 是抑制 NLRP3 的最佳药物。我们测量了在三种不同剂量的 INF195(5、10 或 20 μ M)存在下,对小鼠离体心脏进行 30 分钟全身缺血/一小时再灌注的梗死面积。我们通过 ELISA 分析了心脏组织匀浆中的 caspase-1 和 IL-1β 浓度。使用单因素方差分析和 Tukey 检验确定统计学意义。结果与结论:INF195 可降低 NLRP3 诱导的人类巨噬细胞焦亡。用 5 和 10 μ M INF195 预处理心脏可显著减少梗死面积和 IL-1β 水平。数据表明,心腔内 NLRP3 激活会导致 IRI,低剂量 INF195 可通过减少梗死面积发挥心脏保护作用。然而,在 20 μ M 时,INF195 功效会下降,导致缺乏心脏保护作用。需要研究确定高剂量的 INF195 是否具有脱靶效应或双重作用,从而可能消除 NLRP3 的有害功能和心脏保护功能。我们的研究结果凸显了一种新型化学支架的潜力,该支架可进一步优化,在缺血/再灌注环境中提供 NLRP3 抑制和心脏保护。