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值得关注的 SARS-CoV-2 变异株和
本报告中分析的数据截止时间为 2021 年 12 月 29 日。目前，英格兰通过测序或基因分型确诊的 Omicron VOC-21NOV-01 (B.1.1.529)（以下简称 Omicron）病例为 198,348 例，通过 S 基因靶标失败 (SGTF) 确诊的疑似病例为 451,194 例。这并不代表 Omicron 感染或病例的总数（大约 30% 的社区 PCR 检测是使用可以检测 SGTF 的检测方法进行的）；SGTF 占 12 月 29 日 S 基因检测病例的 93%，这是可归类为 Omicron 进行比较分析的病例数。截至 12 月 29 日，英格兰共有 815 名经实验室确诊（测序、基因分型或 SGTF）的 Omicron 患者从急诊室入院或转院。
COVID-19 疫苗有效性
*在 5% 的检测中，通过临床医生访谈收集 COVID-19 疫苗接种状况 **使用多变量逻辑回归计算优势比，调整单个年龄、性别、种族/民族、检测地点的 SVI（<0.5 对 ≥0.5）、药房承包商、潜在疾病（存在与不存在）、美国卫生与公众服务部检测地点所在区域和检测日期 ***其他排除标准：1) 报告最近一剂接种了 Novavax，且报告接种的 COVID-19 疫苗总剂量不到 2 剂；2) 报告在 2023 年 5 月 12 日之后接种了 Janssen（强生）COVID-19 疫苗剂量；3) 最近一剂接种时间距检测日期不到 7 天或 2023 年 9 月 1 日至 12 日期间；或 4) 注册检测时使用的问卷版本仅报告最近一剂疫苗的月份和年份，而不是日历日期。 **** 实时逆转录聚合酶链反应 (RT-PCR) 中的刺突基因 (S 基因) 扩增结果可用于随时间区分某些 SARS-CoV-2 谱系 (2)。在 2023 年传播的大多数谱系（包括 XBB 谱系）中检测到了 S 基因靶标存在 (SGTP)，而在 JN.1 和其他 BA.2.86 谱系中检测到了 S 基因靶标失败 (SGTF) Link-Gelles 等人。MMWR 2024：http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7304a2（结果已更新，自发表以来增加了一个月的数据。）
COVID-19 疫苗的有效性（2023-2024 年方案）
*在 5% 的检测中，通过临床医生访谈收集 COVID-19 疫苗接种状况。2023-2024 年 COVID-19 疫苗配方的接收情况由最近一剂的日期（即 2023 年 9 月 12 日之后）确定。**使用多变量逻辑回归计算优势比，调整单岁、性别、种族/民族、检测地点的 SVI（<0.5 对 ≥0.5）、药房承包商、潜在疾病（存在对不存在）、美国卫生与公众服务部检测地点所在区域和检测日期*** 其他排除标准：1) 报告最近一剂接种了 Novavax，且报告接种的 COVID-19 疫苗总剂量不到 2 剂；2) 报告在 2023 年 5 月 12 日之后接种了一剂 Janssen（强生）COVID-19 疫苗； 3) 在检测日期前 7 天内或 2023 年 9 月 1 日至 12 日期间接种了最新一剂 COVID-19 疫苗；或 4) 注册检测时使用的问卷版本仅报告了最近一剂疫苗接种的月份和年份，而不是日历日期。**** 实时逆转录聚合酶链反应 (RT-PCR) 中的刺突基因 (S 基因) 扩增结果可用于随时间区分某些 SARS-CoV-2 谱系 (2)。在 2023 年传播的大多数谱系中检测到了 S 基因靶标存在 (SGTP)，包括 XBB 谱系，而在 JN.1 和其他 BA.2.86 谱系中检测到了 S 基因靶标失败 (SGTF) Link-Gelles 等人 MMWR 2024：http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7304a2（自发表以来，结果已更新，添加了更多数据。）