1 Revio SPRQ 测序板 - 1 rxn 部分列在客户价目表中,可通过标准采购流程和客户中心(电子商务)订购。2 Revio SPRQ 聚合酶试剂盒 + 清理珠捆绑包 PN 103-520-100 包括 Revio SPRQ 聚合酶试剂盒和 SMRTbell 清理珠。3 Revio SPRQ HiFi 制备试剂盒 96 捆绑包 PN 103-522-600 包括 Revio SPRQ 聚合酶试剂盒 96、HiFi 制备试剂盒 96、SMRTbell 清理珠和其他试剂,以支持高通量样品处理。
请注意,单个SRE/剪切自动化运行中不能包括高质量和低质量样品。如果可用0.5–1.25 µg gDNA并使用Revio Sprq化学,则低质量工作流将为Revio SMRT细胞(+SPRQ)提供足够的库;但是,如果需要过多的文库,则高质量参数也可以用于Revio Sprq化学。对于Revio非SPRQ化学和VEGA,仍建议使用2 µg GDNA输入来加载1个SMRT细胞。
建议每个样本的 gDNA 质量为 2 µg,以确保有足够的基因拷贝来加载并最大化测序覆盖率。此方案适用于每个样本 1–4 µg。我们建议 Sequel、Vega 和 Revio 系统上的最低总 DNA 为 16 µg,以产生可测量的文库质量,Sequel 系统上的最大总 DNA 为 75 µg,Vega 和 Revio(非 SPRQ)上的最大总 DNA 为 100 µg,Revio +SPRQ 上的最大总 DNA 为 50 µg,适用于所有多路复用样本。
链接UI。在运行文件中的时间戳(例如XML)不受影响,并以完全指定的UTC时区为ISO 8601格式。仅研究使用。不适用于诊断程序。©2025加利福尼亚州的太平洋生物科学(“ PACBIO”)。保留所有权利。本文档中的信息如有更改,恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知,条款,条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。太平洋生物科学,PACBIO徽标,PACBIO,Circulomics,Omniome,Smrt,Smrtbell,Iso-Seq,Sequel,Sequel,Nanobind,sbb,sbb,Revio,Onso,onso,apton,kinnex,kinnex,peretarget,sprq,sprq和vega是Pacbio的商标。
所有样品吞吐量均为使用1个SMRT Cymist的VEGA系统的VEGA系统的估计值,使用1 SMRT细胞的SPRQ化学。覆盖范围可能会根据样本质量,图书馆质量和片段长度而有所不同。当前可用的SMRTBELL®适配器索引板96A-96D总共包含384个SMRTBELL条形码适配器。微生物从头组装假定的微生物为2 GB的总基因组大小为每个样品30倍。单细胞转录组学在Revio系统上的每个库中≥8000万次读取,在VEGA系统上的每个库中约有500-6亿个读取。全长RNA测序假设Revio Sprq的总读数为60m,而Vega的30m读取,无论有何plexity。Amplicon测序假设电影时间为1-5 kb的12小时电影时间,24小时的电影时间为5+ kb,每个样本> 50倍。目标富集假设每个样品> 50倍。
仅供研究使用。不得用于诊断程序。© 2024 Pacific Biosciences of California, Inc.(“PacBio”)。保留所有权利。本文件中的信息如有更改,恕不另行通知。PacBio 对本文件中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知、条款、条件和/或使用限制可能与您使用 PacBio 产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的 PacBio 销售条款和条件以及 pacb.com/license 上的适用许可条款。Pacific Biosciences、PacBio 徽标、PacBio、Circulomics、Omniome、SMRT、SMRTbell、Iso-Seq、Sequel、Nanobind、SBB、Revio、Onso、Apton、Kinnex、PureTarget、SPRQ 和 Vega 是 PacBio 的商标。
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初始版本2024年10月1日仅研究使用。不适用于诊断程序。©2024加利福尼亚州的太平洋生物科学(“ PACBIO”)。保留所有权利。本文档中的信息如有更改,恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知,条款,条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。太平洋生物科学,PACBIO徽标,PACBIO,Circulomics,Omniome,Smrt,Smrt,Smrtbell,Iso-Seq,Sequel,sequel,Nanobind,sbb,sbb,sbb,revio,onso,apton,apton,kinnex,peretarget和sprq是Pacbio的商标。
采集了 30 位捐献者的唾液样本,其中 90% 的分析前 DNA 质量 >2 µg。从 27 个样本中提取了 HMW DNA,其中 93% 的产量 >500 ng。提取后,使用 Qubit dsDNA BR 检测试剂盒对 DNA 进行定量,并使用 Femto Pulse 系统(安捷伦科技公司)进行表征。使用 SMRTbell ® 制备试剂盒 3.0 为部分样本制备 HiFi 文库,并使用 SPRQ™ 化学方法在 Revio 系统上进行测序。每个样本都在一个 Revio SMRT 测序池上进行测序。表 1 总结了五个代表性样本的测序数据。这些样本产生了 4.7 到 15.9 µg 的 HMW DNA。HiFi 测序产量为 119 到 133 Gb 的 HiFi 数据,每个基因组的覆盖率为 27 到 40 倍,足以进行全面的 WGS 变异检测。 75% 到 95% 的读数映射到人类参考基因组 (GRCh38)。