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miR-26b-5p，Egr1和STAT1 ...
背景：这项研究旨在研究精神分裂症（SZ）发病机理中涉及的miRNA和上游调节转录因子。方法：使用基因表达综合数据集，基因本体论注释和基因和基因组百科全书（KEGG）途径富集分析的基因表达综合数据集，基因本体学注释和京都百科全书，研究了SZ患者中miRNA和基因的差异表达。进行实时定量聚合酶链反应实验，以验证来自20名SZ患者和20个健康对照组的外周血样本中调节基因的预测筛查。通过接收器操作特征（ROC）曲线分析评估了这些因素中这些因素的诊断潜力。结果：在SZ患者的外周血中，将58个miRNA鉴定为差异表达。miR-26b-5p在SZ患者中表现出明显降低。另外，差异表达了1422个mRNA，包括5个可能调节miR-26b-5p表达的转录因子。在其中，EGR1和STAT1在SZ患者中的表达水平明显较低。接收器的工作特性分析揭示了miR-26b-5p曲线下的面积为0.76，EGR1的0.74为0.74，STAT1的0.82为0.82，STAT1合并的STAT1 -MIR-MIR-26B-5P诊断为0.85。结论：与健康对照组相比，SZ患者外周血中miR-26b-5p，Egr1和STAT1的表达降低表明与SZ有很强的关联。这些分子代表潜在的诊断生物标志物，联合标记STAT1 -MIR-26B-5P可能提供增强的诊断精度。
STAT1-GSDME 焦亡回路的药理激活增强了肝细胞癌的表观遗传免疫治疗
摘要 背景 基因组筛查发现，在对免疫检查点阻断 (ICB) 有耐药性的肿瘤中存在干扰素-γ (IFN γ) 通路缺陷。然而，其非突变调控和治疗发展的可逆性仍不太清楚。 目的 我们旨在鉴定与 ICB 耐药性相关的可用药组蛋白去乙酰化酶 (HDAC)，并开发一种针对肝细胞癌 (HCC) 患者的易于转化的联合治疗方法。 设计 我们通过单细胞 RNA 测序将来自 pembrolizumab 试验 (NCT03419481) 的 HCC 患者的预后结果与所有 HDAC 亚型的肿瘤细胞表达相关联。我们使用免疫分析、单细胞多组学和染色质免疫沉淀测序研究了选择性 HDAC 抑制在 4 种 ICB 耐药原位和自发模型中的治疗效果和作用机制，并通过基因调控和共培养系统进行验证。结果 HDAC1 / 2 / 3 表达较高的 HCC 患者表现出 IFN γ 信号传导缺陷，并且在 ICB 治疗中生存率较差。选择性 I 类 HDAC 抑制剂 CXD101 的短暂治疗使 HDAC1/2/3 高肿瘤对 ICB 疗法重新敏感，导致 CD8 + T 细胞依赖性抗肿瘤和记忆 T 细胞反应。从机制上讲，CXD101 与 ICB 协同作用，通过增强染色质可及性和 IFN γ 反应基因的 H3K27 过度乙酰化来刺激 STAT1 驱动的抗肿瘤免疫。肿瘤内募集 IFN γ + GZMB + 细胞毒性淋巴细胞进一步促进 CXD101 诱导的 Gasdermin E (GSDME) 的裂解，从而以 STAT1 依赖的方式触发细胞焦亡。值得注意的是，GSDME 的缺失模仿了 STAT1 敲除，通过阻止细胞焦亡和 IFN γ 反应消除了 CXD101-ICB 联合疗法的抗肿瘤功效和生存益处。结论我们的免疫表观遗传策略利用 IFN γ 介导的网络来增强癌症免疫循环，揭示了自我强化的 STAT1-GSDME 细胞焦亡回路作为正在进行的 II 期试验的机制基础，以应对 ICB 耐药性（NCT05873244）。
kynurenine-ahr通过抑制结核病中的STAT1-CXCL9/CXCL10轴来降低T细胞浸润并诱导T细胞免疫反应
由结核分枝杆菌（MTB）引起的结核病是一个关键的全球健康问题，由于病原体延迟宿主的T细胞免疫反应的能力而变得复杂。T细胞募集到感染部位的延迟是MTB的关键生存策略，使其能够建立持续的慢性感染。为了研究基本机制，这项研究的重点是MTB对宿主色氨酸代谢的剥削。MTB上调吲哚胺2,3-二氧酶1（IDO1）在炎性巨噬细胞中，从而增加了Kynurenine（Kyn）的产生。kyn激活芳基烃受体（AHR），导致细胞因子信号传导3的抑制剂上调，并随后抑制JAK-STAT1信号通路。这会导致趋化因子CXCL9和CXCL10的分泌减少，这对于对肺的T细胞募集至关重要。在体内小鼠模型的支持下，我们的发现表明，通过AHR敲除的这一途径显着增强了T细胞的纤维化和活性，从而破坏了MTB诱导的免疫抑制。相比之下，额外的Kyn注射明显抑制了T细胞的效果和活性。这些结果凸显了AHR和IDO1的潜在治疗靶标，提供了新的途径，以增强宿主免疫反应针对结核病，并指导未来的疫苗开发工作。
免疫肿瘤学中的计算科学
抽象背景铁吞作用在增强反编程细胞死亡1（PD-1）免疫疗法的功效方面起着重要作用。然而，尚未阐明肿瘤铁蛋白肿瘤对黑色素瘤和肺癌对抗PD-1免疫疗法敏感的分子机制。使用细胞毒性测定，菌落形成测定，流式细胞仪和动物实验来评估甲氟喹（MEF）（MEF）对黑色素瘤和肺癌的生存和纤维毒性的影响。RNA测序，实时定量PCR（QRT-PCR），Western印迹，染色质免疫沉淀-QPCR和流式细胞仪确定MEF调节溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶3（LPCCAT3）的分子机制。通过临床数据库和单细胞RNA测序（SCRNA-SEQ）验证了LPCAT3与抗PD-1免疫疗法的疗效之间的关系。在这项研究中结果，我们发现MEF诱导了铁铁作用。此外，用MEF与T细胞衍生的干扰素γ（IFN-γ）联合治疗增强了肿瘤肿瘤的肿瘤，敏化黑色素瘤和肺癌细胞对抗PD-1免疫疗法。从机械上讲，MEF通过激活IFN-γ诱导的STAT1-IRF1信号传导LPCAT3（一种参与脂质过氧化的关键基因）的表达，并敲低LPCAT3损害了MEF+ifn-γ的诱导。结论总结，我们的研究证明了一种新的机制，通过该机制进行了调节，并证明MEF是一个高度有希望的新靶标，可用于增强抗PD-1免疫疗法的功效。在临床上，对黑色素瘤患者的转录组和单细胞测序的分析表明，黑色素瘤患者的LPCAT3表达明显低于对照组的患者，并且LPCAT3表达与抗PD-1免疫疗法的功效呈正相关。
STAT1 是建立但不是维持干扰素所必需的......
人类细胞暴露于干扰素 c (IFN c ) 会导致一种有丝分裂可遗传但可逆的状态，称为长期转录记忆。我们之前发现聚集的 GBP 基因受到 IFN c 的强烈引发。在这里，我们发现在引发细胞中，干扰素反应转录因子 STAT 1 和 IRF 1 在再次暴露于 IFN c 时都会以加速的动力学靶向染色质，特别是在引发基因的启动子处。引发不会改变 IFN c 诱导的 STAT 1 活化或核输入的程度，这表明记忆不会改变上游 JAK - STAT 信号传导。我们发现 STAT 1 对建立转录记忆至关重要，但其方式与单纯的转录激活无关。有趣的是，虽然 STAT 1 的丝氨酸 727 磷酸化在引发状态期间得以维持，但 STAT 1 并不是 GBP 基因记忆的遗传性所必需的。我们的结果表明，干扰素暴露的记忆构成了 STAT 1 介导的可遗传状态，该状态在启动期间建立。这使得 GBP 基因准备好在二次干扰素暴露时与 STAT 1 和 IRF 1 结合并加速基因激活。
核DHX9与STAT1合作以转录干扰素刺激的基因
RNA解旋酶DHX9已被广泛地描述为转录调节剂，这与其主要是核定位置一致。它也参与了识别细胞质中的RNA病毒。但是，没有体内数据来支持DHX9的抗病毒作用。同时，作为一种核蛋白，IF以及核DHX9如何促进抗病毒免疫仍然在很大程度上未知。在这里，我们产生了髓样特异性和肝细胞 - 特异性DHX9敲除小鼠，并确认DHX9对于体内RNA病毒感染的宿主抗性至关重要。通过DHX9缺乏小鼠的其他基因敲除MAV或STAT1，我们证明了核DHX9在调节I型干扰素下游的干扰素刺激的基因（ISG）表达中起着积极的作用。Mech-在干扰素刺激下，DHX9直接与STAT1结合，并将POL II招募到ISG启动子区域，以参与ISGS的STAT1介导的转录。共同发现了核DHX9在抗病毒免疫中的重要作用。
CPVL 通过与 BTK/p300 轴相互作用，抑制 STAT1 通路，促进神经胶质瘤进展
简介 胶质瘤是成人中最常见的原发性脑肿瘤之一，也是最具侵袭性和致命性的人类癌症类型之一（1-3）。世界卫生组织（WHO）将胶质瘤分为 4 级：I-IV（4）。尽管早期检测取得了进展，但大多数患者在诊断时为 IV 级胶质母细胞瘤（GBM）；因此，这些患者的预后仍然不佳（5，6）。GBM 的中位生存期仅为诊断后的 12-15 个月（7）。GBM 的治疗方案仍存在未满足的需求（8）。尽管人们付出了巨大努力来识别对胶质瘤细胞侵袭和增殖至关重要的分子，但迄今为止，对它们的表征却非常少（9-11）。越来越多的证据表明，抑制胶质瘤细胞凋亡是导致致瘤性增加的早期事件（12，13）。因此，鉴定潜在的早期诱导凋亡生物标志物对提高胶质瘤的诊断和预后评估具有重要的临床价值（14）。基因芯片和微阵列表达谱技术在过去十年中得到了广泛的应用，可以快速比较不同样本中大量基因的表达水平，使其适用于基因筛选（15）。在本研究中，通过微阵列表达谱筛选出了CPVL（羧肽酶，卵黄生成样）。CPVL是一种丝氨酸羧肽酶，首次在人类巨噬细胞中被鉴定（16）。CPVL是在利用差异显示PCR寻找人类巨噬细胞限制基因的过程中首次克隆和鉴定的（16）。CPVL在脾脏、胎盘、心脏和肾脏等各种组织中均有明显表达（17，18）。然而，CPVL在包括胶质瘤在内的各种肿瘤中的作用至今仍不清楚。
技术数据表：MDCK.STAT1KO
图 1：STAT1 KO MDCK 细胞中产生的甲型流感病毒 (H1N1；ATCC ® VR-1736 ™)。 (A) WT 亲本和 MDCK.STAT1 KO 细胞产生的病毒上清液的免疫染色 TCID 50。 细胞以 0.01 的 MOI 感染甲型流感病毒。 感染后 48 小时收集上清液，并按照指示的稀释度重新感染 WT MDCK 细胞。 绿色 - 抗甲型流感病毒染色，蓝色 - 核染色。 细胞以 0.01 的 MOI 感染甲型流感病毒 48 小时，然后 (B) 计算感染后 48 小时 MDCK.STAT1KO 细胞中产生的甲型流感病毒上清液的 TCID 50。 (C) 感染后 48 小时 MDCK.STAT1KO 细胞中产生的甲型流感病毒基因组的 RT-PCR 定量。