建议每个样本的 gDNA 质量为 2 µg,以确保有足够的基因拷贝来加载并最大化测序覆盖率。此方案适用于每个样本 1–4 µg。我们建议 Sequel、Vega 和 Revio 系统上的最低总 DNA 为 16 µg,以产生可测量的文库质量,Sequel 系统上的最大总 DNA 为 75 µg,Vega 和 Revio(非 SPRQ)上的最大总 DNA 为 100 µg,Revio +SPRQ 上的最大总 DNA 为 50 µg,适用于所有多路复用样本。
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初始版本2024年10月1日仅研究使用。不适用于诊断程序。©2024加利福尼亚州的太平洋生物科学(“ PACBIO”)。保留所有权利。本文档中的信息如有更改,恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知,条款,条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。太平洋生物科学,PACBIO徽标,PACBIO,Circulomics,Omniome,Smrt,Smrt,Smrtbell,Iso-Seq,Sequel,sequel,Nanobind,sbb,sbb,sbb,revio,onso,apton,apton,kinnex,peretarget和sprq是Pacbio的商标。
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结果表明,Kinnex 16S测序可以在单个Revio SMRT单元格上以1,536-plex或在续集IIE SMRT单元格上的768-plex下的平均读数> 30k平均读数。图5a显示了续集II系统上的常规全长16S库的显示2.1-330万(M)的读取,而Kinnex则显示为19.6-28.4 m,在Revio系统上,从8.5-10.1 m的Revio系统上读取,而没有Kinnex至62.5–72.5–72.2 m读取Kinnex。 此差异允许每个SMRT单元格多路复用和每个样品的读取深度更高。 将Kinnex 16S与标准FL 16S进行比较,我们发现物种组成有很高的相关性(图5B)。 在20种物种的微生物标准上,Kinnex 16S库与预期的物种表示相比,由于读取深度较高,因此与常规16S库相关(图5C)。显示2.1-330万(M)的读取,而Kinnex则显示为19.6-28.4 m,在Revio系统上,从8.5-10.1 m的Revio系统上读取,而没有Kinnex至62.5–72.5–72.2 m读取Kinnex。此差异允许每个SMRT单元格多路复用和每个样品的读取深度更高。将Kinnex 16S与标准FL 16S进行比较,我们发现物种组成有很高的相关性(图5B)。在20种物种的微生物标准上,Kinnex 16S库与预期的物种表示相比,由于读取深度较高,因此与常规16S库相关(图5C)。
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