S. Haihua Chu,Daisy Lam,Michael S Packer,Jenny Olins,Alexander Liquori,Kyle Rehberger,Conrad Rinaldi,Jeffrey Marshall,Calvin Lee,Bo Yan,Bo Yan,Jeremy Decker,Jeremy Decker,Bob Gantzer,Scott Haskett,Scott Haskett,Tanggis Bohnuud,David Born,David born born barr barr,luiis,luuis,luuis。 Slaymaker,Nicole Gaudelli,Sarah Smith,Adam Hartigan和Giuseppe CiaramellaS. Haihua Chu,Daisy Lam,Michael S Packer,Jenny Olins,Alexander Liquori,Kyle Rehberger,Conrad Rinaldi,Jeffrey Marshall,Calvin Lee,Bo Yan,Bo Yan,Jeremy Decker,Jeremy Decker,Bob Gantzer,Scott Haskett,Scott Haskett,Tanggis Bohnuud,David Born,David born born barr barr,luiis,luuis,luuis。 Slaymaker,Nicole Gaudelli,Sarah Smith,Adam Hartigan和Giuseppe Ciaramella
在7年期间获得了$ 425,000+的奖学金(PHD和MASC)博士学位,环境与可持续性,不列颠哥伦比亚大学,2021年,论文,印度农业:统计分析的受益者:统计分析获得者:Vanier Canada奖学金:Vanier Canada奖学金,Vanier Canada 4年4年,UBC 4年级,UBC 4年级,Slaymaker Enigents Indernitute in Indian Enginess in Cornive in Commast in Corniver in Corniver in Corniver inorniver in Commast btt by b. b. bbc by b. b. b. b. b. b.德里2013技能
CRISPR/CAS9作为可编程基因组编辑工具的广泛使用受到了脱靶DNA裂解的阻碍(Cong等,2013; Doudna,2020; Fu等,2013; Jinek et al。,2013)。虽然对此类脱离目标编辑事件的分析使CAS9变体的发展具有更大的歧视(Chen等,2017; Kleinstiver等,2016; Slaymaker等,2016),Cas9拒绝或接受Mismismatches的基本分子机制是贫穷的20; Slaymaker和Gaudelli,2021)。在这里,我们使用动力学分析来指导在不匹配监视的不同阶段的CAS9的低温EM结构测定。我们观察到在引导RNA(GRNA)和DNA靶链(TS)之间形成的双链体的独特,未描述的线性构象(TS),该(TS)发生在存在PAM-DISTAL不匹配的情况下,从而阻止Cas9激活。典型的扭结GRNA:TS双链体是CAS9激活的先决条件,充当结构支架,可促进Cas9构象型裂解所需的构象重排。我们观察到,高度耐受性的远端不匹配通过通过RUVC结构域中的柔性环稳定而稳定扭曲的双工构象来实现这种扭结的构象。我们的结果提供了对基本结构机制的分子见解,这些结构机制可能有助于通过CAS9进行离靶机制,并提供了一个分子蓝图,用于设计下一代高富达Cas9变体,可选择性地减少脱离目标DNA裂解,同时又有有效的触发型DNA,同时保留了有效的触发型DNA。
2018 ;Chen 等人,2017 ;Kleinstiver 等人,2016 ;Lee 等人,2018 ;Slaymaker 等人,2016)。增加和减少 sgRNA-DNA 界面的长度都会显著降低五种 Cas9 变体中的四种的编辑效率,Sniper-Cas9 是个例外(Lee et al., 2018)。但这种影响的基础尚不清楚。最近,Fu 等人观察到与靶标存在大量错配的 sgRNA 能够引导 SpCas9 切口双链 DNA(Fu et al., 2019)。同样,Szczelkun 等人描述了截短的 sgRNA(互补区为 ∆ 7 nt)与嗜热链球菌 Cas9 (StCas9) 结合导致缺口分子的积累 ( Szczelkun 等人,2014 )。这些观察结果表明,截短/延长的间隔区衍生片段对核酸酶的 HNH 和 RuvC 切割域施加了不同程度的影响,使得它们在某些情况下会切开目标 DNA,而不是将其切割。在这里,我们试图检验这一假设。