许多外膜受体,蛋白质和结肠蛋白具有共识氨基酸序列,即tonb盒,位于其氨基末端附近(16、19)。这些膜受体与TONB依赖性过程有关,例如摄取亚铁植物和维生素B12,并通过噬菌体(例如480和Ti)成功感染(有关综述,请参见参考文献14)。B组菌菌素具有一个TONB盒,也需要TONB蛋白的吸收(1,15)。 在tonb基因中的突变(4、8、12、17、18)的突变可以抑制tonb盒构成的序列和遗传学证据的存在,这是导致tonb盒子代表TONB盒子代表TONB蛋白与各种受体蛋白相互作用的位点的假设(8)。 检验该假设的一种方法是确定从TONB框中得出的寡肽是否可以抑制TONB依赖性过程。 因此,我们用合成的tonb盒五肽(glu-thr-val-ile-val)处理了大肠杆菌细胞,该肽是源自fhue受体的,它含有fhue受体,该受体与铁含量相结合。 然后,在这种五肽存在的情况下,我们阐述了几个依赖TONB的过程。 将两个无关的五肽用作对照。 TONB盒五肽(116 mg)购自耶鲁大学的蛋白质和核酸化学设施。 它以粉末形式存储在室温下,并根据需要以每毫升浓度为1 mg的五肽溶解在水中。 分别为Leu-Pro-Pro-Ser-Arg和Val-His-Leu-th-Pro,两个对照肽PP1和PP2分别为PP1和PP2。B组菌菌素具有一个TONB盒,也需要TONB蛋白的吸收(1,15)。在tonb基因中的突变(4、8、12、17、18)的突变可以抑制tonb盒构成的序列和遗传学证据的存在,这是导致tonb盒子代表TONB盒子代表TONB蛋白与各种受体蛋白相互作用的位点的假设(8)。检验该假设的一种方法是确定从TONB框中得出的寡肽是否可以抑制TONB依赖性过程。因此,我们用合成的tonb盒五肽(glu-thr-val-ile-val)处理了大肠杆菌细胞,该肽是源自fhue受体的,它含有fhue受体,该受体与铁含量相结合。然后,在这种五肽存在的情况下,我们阐述了几个依赖TONB的过程。将两个无关的五肽用作对照。TONB盒五肽(116 mg)购自耶鲁大学的蛋白质和核酸化学设施。它以粉末形式存储在室温下,并根据需要以每毫升浓度为1 mg的五肽溶解在水中。分别为Leu-Pro-Pro-Ser-Arg和Val-His-Leu-th-Pro,两个对照肽PP1和PP2分别为PP1和PP2。他们被购买了密苏里州圣路易斯的Froty Sigma Chemical Co.pp1和pp2的处理方式与TONB盒五肽的方式相同。对大肠杆菌的保护免受TONB盒五肽的致命作用。colicins b和ia与铁调节的外膜蛋白FEPA和CIR结合,并明显地恢复,并需要TONB蛋白进入细胞(1,15)。由于这些结肠蛋白包含一个TONB盒(11,19),因此我们测试了TONB盒五肽保护大肠杆菌免受结肠蛋白杀死的能力。大肠杆菌的结型菌株是从K. hantke获得的。colicins(7)。大肠杆菌
大肠杆菌不匹配维修系统能够识别DNA中的非分配基础对,显然是通过局部切除和重新合成的,以取代错误的基础(有关审查,请参见参考,请参见参考文献1)。DNA的区域GATC序列是完全腺嘌呤 - 甲基化的似乎是对不匹配修复的难治性(2,3),并且似乎是在复制叉后紧接在复制后立即将新合成的GATC序列的短暂甲基化,从而使修复的重复修复仅可重复进行新的合成,从而将其撤离了新的合成和错误。大肠杆菌不匹配修复系统没有识别和/或维修所有不匹配的效率(6,7)。两个过渡不匹配(G-T和CGA)都很容易予以修复和修复,而六个转移不匹配中的三个不是(6)。这种模式可以部分解释,因为发现在大肠杆菌,mutl,muts和mutu突变体中观察到的突变效应,这些突变体缺乏不匹配修复(参考文献。2-8;有关评论,请参见参考。1)和未指向不匹配修复的大坝突变体(2,6)主要是由于过渡和移码突变的增加(1)。不匹配维修不足的突变体显示移码突变的频率增加,这表明大肠杆菌不匹配修复系统可以识别和修复一个或多个未配对的碱基 - i.e。,移交/野生型型异源杂质。该假设进行了检验。结果表明,具有一个未配对基碱的异源型可以通过大肠杆菌不匹配修复系统识别和修复。
海洋异养原核物主要使用转运蛋白占据环境底物。靶向特定底物的转移者的模式塑造了异养原核生物在海洋有机循环中的生态作用。在这里,我们报告了由于分类学变化而导致的原核生物转运蛋白表达的大小分级模式,这是由针对ATP结合盒(ABC)转运蛋白和TONB依赖性转运蛋白(TBDTS)的多种“ OMICS”方法揭示的。底物特异性分析表明,海洋SAR11,杜鹃花和大洋螺旋藻使用ABC转运蛋白在自由生活的部分中使用有机氮,而替代词,细菌植物和sphingomonadales和sphingomonadales在碳纤维上使用TBDTS上的有机含量和含碳纤维有机物。转运蛋白的表达还支持深海原核生物的不同生活方式。我们的结果表明,有机物中的转运蛋白差异反映了原核生物介导的有机物循环中明显的小众分离。
基因选择性转录因子通过与其靶基因调节区域内的特定DNA元件结合(1)。但是,并非完全定义此DNA结合的序列要求。几个参数,例如蛋白质 - 蛋白质相互作用与相邻结合的因素,DNA结构的影响(弯曲等)。),重要的是,结合位点与认知因子的比率确定给定转录因子是否可以有效地与相应的结合位点相互作用。体外和大概也在体内也是如此,对于确定转录因子是否会与其最佳识别序列的变体结合,因此,它的基因调节。在这些考虑因素中提示,我们询问是否存在一种蜂窝机制,该机制是否存在在转录因子活动和可用目标位点的繁琐之间保持平衡。对AP-1家族成员的特征良好转录因子C-Jun进行了实验(2-4)。包含AP-1结合位点的启动子是C-Jun调节的目标。C-Jun的活性受到多种机制的紧密控制,并且对蛋白质的异常调节会导致恶性转化和致癌作用(5)。在这项研究中,我们描述了一种机制,该机制通过改变其磷酸化态的DNA结合活性,取决于细胞中存在的C-Jun结合位点的浓度。这种机制可以用来设置和微调C-Jun与其结合位点的比率。有趣的是,与这种现象有关的磷酸化位点与以前据报道经历信号依赖性去磷酸化相同。