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生物防治能成为控制媒介植物病毒的一种策略吗？
3 UMR IGEPP，INRAE-Agrocampus Ouest-Université de Rennes 1，F-35600 Le Rheu，法国 摘要 由媒介害虫传播的植物病毒是全球粮食生产和安全面临的最重要威胁之一。增强天敌（寄生蜂和捕食者）的生物防治策略主要侧重于降低害虫密度的能力。相比之下，很少有研究研究天敌如何影响病毒在作物中的传播和发病率，尽管这些结果可以用作更可持续地管理病毒性疾病的杠杆。媒介传播的植物病毒可根据其传播方式分为三类：非持续传播病毒、半持续传播病毒和持续传播病毒，而媒介密度、适应性和运动被确定为病毒在作物中传播的主要驱动因素，它们对病毒流行病学的相对贡献也可能取决于传播方式和天敌的存在。综述的第一部分重点介绍了与媒介活动和密度有关的病毒传播动态。由于我们识别出每种植物病毒的不同模式，导致媒介特征变化的控制策略应根据目标病毒进行调整。然而，昆虫媒介的生物防治很少适应目标病毒的传播方式。因此，本综述的最后一部分探讨了天敌（寄生蜂和捕食者）预防每种植物病毒疫情爆发所需的条件。简而言之，如果与其他做法相结合，生物防治媒介以将病毒发病率保持在经济阈值以下是一种很有前途的方法，适用于持续传播的病毒，但对于非持续传播的病毒和半持续传播的病毒可能更难实现。关键词非持续传播病毒；持续传播病毒；病毒爆发；保护性生物防治；捕食者；寄生蜂关键信息
针对 RNA 病毒的非常规抗病毒药物的宿主细胞靶标
摘要：最近的 COVID-19 危机凸显了 RNA 病毒的重要性。该组中最突出的成员是 SARS-CoV-2（冠状病毒）、HIV（人类免疫缺陷病毒）、EBOV（埃博拉病毒）、DENV（登革热病毒）、HCV（丙型肝炎病毒）、ZIKV（寨卡病毒）、CHIKV（基孔肯雅病毒）和甲型流感病毒。除了产生逆转录酶的逆转录病毒外，大多数 RNA 病毒都编码 RNA 依赖性 RNA 聚合酶，这些聚合酶不包括分子校对工具，这是这些病毒在宿主细胞中繁殖时具有高突变能力的原因。加上它们能够以不同方式操纵宿主的免疫系统，它们的高突变频率对开发有效和持久的疫苗和/或治疗方法提出了挑战。因此，使用抗病毒靶向剂虽然是抗感染治疗策略的重要组成部分，但可能会导致选择耐药变体。宿主细胞复制和加工机制对于病毒的复制周期至关重要，并引起了人们对针对宿主机制的药物作为治疗病毒感染的治疗替代品的潜在用途的关注。在这篇综述中，我们讨论了具有抗病毒作用的小分子，它们针对许多 RNA 病毒感染周期不同阶段的细胞因子。我们强调重新利用 FDA 批准的具有广谱抗病毒活性的药物。最后，我们假设 ferruginol 类似物 (18-(邻苯二甲酰亚胺-2-基) ferruginol) 是一种潜在的宿主靶向抗病毒药物。
宿主限制因子 APOBEC3 在人类病毒基因组上的足迹
APOBEC3 酶是先天免疫效应物，可将突变引入病毒基因组。这些酶是胞嘧啶脱氨酶，可将胞嘧啶转化为尿嘧啶。它们优先突变胞嘧啶，然后突变胸腺嘧啶，使 5'TC 基序成为它们的首选目标。病毒已经进化出不同的策略来逃避 APOBEC3 的限制。某些病毒会主动编码对抗 APOBEC3 的病毒蛋白，而另一些病毒则会被动面对 APOBEC3 的选择压力，因为 APOBEC3 靶向基序的基因组已经耗尽。因此，APOBEC3 在某些病毒的基因组上留下了进化的足迹。我们研究的目的是识别这些具有由 APOBEC3 塑造的基因组的病毒。我们分析了 33,400 种人类病毒的基因组，以了解 APO-BEC3 青睐的基序是否耗尽。我们证明 APOBEC3 选择压力影响至少 22% 的目前已注释的所有人类病毒物种。乳头瘤病毒科和多瘤病毒科是足迹最密集的家族；证明选择压力作用于全基因组和两条链。细小病毒科成员在足迹的大小和定位方面具有不同的目标。有趣的是，B19 红细小病毒的两条链上都存在大量 APOBEC3 足迹；这使得该病毒基因组成为 APOBEC3 青睐基序最干净的序列之一。我们还发现地方性冠状病毒科具有显著的足迹。有趣的是，在人畜共患的 MERS-CoV、SARS-CoV-1 和 SARS-CoV-2 冠状病毒上未检测到这样的足迹。除了全基因组足迹的病毒外，某些病毒仅在其基因组的很短部分上留下足迹。这种情况对于γ-疱疹病毒科和腺病毒科来说就是如此，它们的足迹位于裂解性复制起点上。在逆转录的 HIV- 1、HIV-2、HTLV-1 和 HBV 病毒的负链上也可以检测到轻微的足迹。总之，我们的数据说明了 APOBEC3 对人类病毒的选择压力程度，并确定了新的假定 APOBEC3 靶向病毒。
揭露潜在的：胶质母细胞瘤中溶瘤病毒的神经炎性调节机制
胶质母细胞瘤是一种侵略性和致命的脑肿瘤，提出了巨大的临床挑战，包括分子异质性，高复发率，对常规疗法的耐药性以及在血脑屏障中的治疗渗透有限。以细胞和非细胞成分的动态相互作用为特征的胶质母细胞瘤微环境是肿瘤生长和治疗性耐药性的关键驱动力。神经炎性细胞因子，尤其是白细胞介绍和肿瘤坏死因子 - α-在这种微环境中起关键作用，有助于肿瘤进展和免疫逃避。这篇评论将溶瘤病毒疗法作为一种有希望的治疗途径，重点是其调节神经炎症反应的潜力，诱导局部免疫反应并将免疫调节因子直接传递到肿瘤部位。虽然已经观察到了令人鼓舞的结果，但诸如克服血脑屏障，管理宿主抗病毒药的挑战以及减轻正常神经元细胞的潜在风险仍然是临床翻译的关键障碍。通过分析溶瘤病毒与临床前和临床试验中的胶质母细胞瘤微环境和合成发现的复杂相互作用，该综述为基于Oncoloty Virose Papy
宏基因组和病毒编码的CRISPR系统组件中的Bathyarchaeia病毒多样性
Bathyarchaeia代表了一类古细菌常见，并且在沉积生态系统中丰富。在这里，我们报告了56个在不同环境的宏基因组中鉴定出的谷胱甘肽病毒的元基因组组装基因组。基因共享网络和系统基因组学分析导致了四个病毒家族的提议，包括Realms Duplodnaviria和Adnaviria的病毒，以及古细菌特异性的纺锤形病毒。基因组分析这些病毒中发现了各种CRISPR元素。拟建家族“ Fuxiviridae”的病毒带有非典型类型IV-B CRISPR-CAS系统和Cas4蛋白，可能会干扰宿主免疫。Viruses of the family “ Chiyouviridae ”encode a Cas2-like endonuclease and two mini-CRISPR arrays, one with a repeat identical to that in the host CRISPR array, potentially allowing the virus to recruit the host CRISPR adaptation machinery to acquire spacers that could contribute to competition with other mobile genetic elements or to inhibit host defenses.这些发现提出了Bathyarchaeia Virome的轮廓，并瞥见了其反防卫机制。
针对出血热病毒的小分子疗法的开发
Project Summary/Abstract(Description)________________________________________________________ 7 Project Narrative 8 Facilities & Other Resources 9 Equipment 19 Research & Related Senior/Key Person________________________________________________________ 23 Research & Related Budget Year - 1 46 Research & Related Budget Year - 2 49 Research & Related Budget Year - 3 52 Budget Justification 55 Research & Related Cumulative Budget _______________________________________________________ 96 Research & Related Budget - Consortium Budget (Subaward 1)_____________________________________ 97 Research & Related Budget - Consortium Budget (Subaward 2)____________________________________ 108 Total Direct Costs Less Consortium F&A ______________________________________________________ 120 SBIR STTR Information ___________________________________________________________________ 121
在共生和致病病毒和细菌存在的情况下昆虫脂质代谢
与大多数动物一样，昆虫与微生物有着密切的相互作用，这些微生物可能影响昆虫宿主的脂质代谢。在本章中，我们描述了迄今为止有关原核生物微生物在昆虫脂质代谢中起的作用的知名度。我们开始探索以内共生体为重点的微生物 - 脂质相互作用，并更具体地探索了在果蝇中不存在研究的肠道微生物群。然后，我们继续概述在常见且研究充分的wolbachia pipientis上所做的工作，这也与其他微生物有关。采用一个略有不同的角度，然后研究人类病原体（包括登革热和其他病毒）对蚊子载体脂质的影响。我们扩展了有关人类病原体的工作，并包括与内共生膜的相互作用
丙二醇可灭活呼吸道病毒并防止空气传播
病毒在宿主之间传播时很容易受到攻击，我们旨在利用这一关键窗口。我们发现无处不在、安全、廉价且可生物降解的小分子丙二醇 (PG) 具有强大的杀病毒活性。丙二醇以鼻腔喷雾剂中常见的浓度通过鼻腔内给药，可迅速灭活多种病毒，包括甲型流感病毒、SARS-CoV- 2 和轮状病毒，并减轻小鼠的疾病负担。最重要的是，汽化的 PG 可有效消除空气飞沫中的甲型流感病毒和 SARS-CoV- 2 传染性，有效预防感染，其浓度远低于哺乳动物可耐受的水平。我们将 PG 蒸汽介绍为一流的无毒空气传播杀病毒剂，可防止现有和新出现的病毒病原体的传播，对公共卫生具有明显和直接的影响。
新兴的传染病是有毒的病毒 - 我们准备好了吗？概述
摘要：SARS-COV-2引起的最近大流行影响了全球人口，导致生命的显着丧失和全球经济恶化。covid-19强调了公众意识和基于科学的决策的重要性，并在准备和响应系统中暴露了全球脆弱性。由于国际旅行和全球变暖，新兴和重新出现的病毒爆发变得越来越频繁。这些病毒爆发构成了严重的公共卫生威胁，并改变了全国经济后果的大流行准备。在分子水平上，病毒突变和变化不断挫败疫苗效率，以及诊断，治疗和预防策略。在这里，我们讨论了流行病和大流行的病毒传染病，目前可用的治疗方法以及监视措施以及它们的局限性。