WTI

2025年2月19日机构名称:

采用 KRAKEN2 和 BOWTIE2 的方法

用于对狗微生物组进行宏基因组分析的数据库的开发：一种采用 KRAKEN2 和 BOWTIE2 的方法 PAULO SALLAROLA TAKAO；帕梅拉·苏萨·科里亚；胡利奥·弗朗茨·莫拉大卫·阿西奥莱·巴博萨； FABIANO BEZERRA MENEGIDIO 摘要宏基因组分析在了解微生物群落及其环境影响方面发挥着至关重要的作用，在兽医学中对于宠物疾病的诊断、治疗和预防具有特殊意义。这项研究旨在为 Bowtie2 和 Kraken2 工具创建集成数据库，将狗和人类基因组整合成最新且易于访问的资源。随着技术的进步，微生物组的宏基因组分析已成为兽医日常工作中一种很有前途的工具，特别是考虑到兽医诊所中狗的普及率很高，仅在巴西就有大约 5810 万只狗，是家庭中第二大宠物，仅次于鸟类。然而，必要的生物信息学步骤（例如去除宿主基因组和人类污染物）需要大量时间和计算资源。为了克服这一挑战，我们为每种工具开发了特定的数据库，大大减少了分析时间并确保基因组的持续更新。虽然 Bowtie2 执行精确序列比对，但 Kraken2 使用较小的序列（k-mers）进行更快、更有效的分类学分类。数据库构建后，对犬类宏基因组文库进行了测试，结果显示比对率较高，且能有效去除与狗或人类相关的读段。尽管由于缺乏详细的文献而面临挑战，但创建的数据库被证明是可行且可重复的，为未来兽医宏基因组分析研究做出了重大贡献。关键词：家狼，宏基因组，Kraken2-build，Bowtie2-build，污染物。 1 引言宏基因组分析是对宏基因组进行分类的过程（MARCHESI；RAVEL，2015），宏基因组是基因组学的衍生词，是研究生物体基因的学科。从字面上翻译，宏基因组学是“超越基因组的”，也就是说，在宏基因组学中我们不仅分析一个基因组，还分析样本中包含的所有基因组（GILBERT；DUPONT，2011）。这些基因组可以来自微生物，甚至可以是环境（样本）中的游离 DNA 片段、微生物结构元素的基因、病毒、噬菌体、毒素和其他所有具有遗传物质的东西（BERG 等人，2020 年；HANDELSMAN 等人，1998 年；MERRIAM-WEBSTER，2023 年；WHIPPS；LEWIS；COOKE，1988 年）。那么我们可以将宏基因组分析描述为对给定条件下的微生物基因组集合及其环境条件的分析

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2024年10月22日机构名称:

SWO_WTI@navy.mil

• 为舰船、中队、打击群、独立部署人员和指挥官提供直接、回传、任务包或飞行支援 • 以条令或战术、技术和程序形式为作战人员提供的战术出版物，以可读、可理解、可执行和可重复的方式作为权威指导 • 战术级作战效能评估；通过作战改进计划进行能力评估

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2024年5月29日机构名称:

SWO_WTI@navy.mil

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SAWSINST 1402.2B WTI MC 2024 年 5 月 7 日表面...

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2024年5月14日机构名称:

SAWSINST 1402.2B WTI MC 2024 年 5 月 7 日表面...

SAWSINST 1402.2B WTI MC 2024 年 5 月 7 日水面高级作战学校指导 1402.2B 发件人：海军水面水雷和作战发展中心支队水面高级作战学校负责人主题：作战战术教官计划资格参考：(a) SAWSINST 1402.1 (b) COMNAVSURFOR 圣地亚哥 CA 211608Z 8 月 19 日 (c) 作战战术教官红筹指导 221800Z 1 月 24 日 (d) NAVPERS 15839I 附件：(1) WTI 计划申请模板 (2) WTI 计划红筹信息表模板 1. 目的。制定政策和程序来管理和支持作战战术教官（WTI）的申请和资格认证流程，无论 WTI 的作战区域如何。2. 取消。SAWSINST 1402.2A。3. 职责。水面 WTI 计划的设立是为了培训、认证和发展战士、思想者和教师，这些军官的技能和训练将提高水面部队的杀伤力，使海军能够在各种高端作战中作战并取得胜利。完成教学课程（COI）后，WTI 将被分配一个重点领域，以利用他们的资格并支持多条战线。WTI 的职责和责任包括：a. 作为战士：（1）参加水面战高级战术训练（SWATT）和其他高级战术训练，为个人、单位和参谋提供战术、技术和程序（TTP）方面的培训和指导。（2）计划和执行实弹演习。（3）为舰艇、中队、打击群、舰队指挥官、海军部队指挥官和作战指挥官提供先进海上作战战术支持。

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