线虫秀丽隐杆线虫在其环境中以细菌为食,并已成为微生物组研究的模型生物。然而,尽管在其自然栖息地中存在许多真菌物种,但秀丽隐杆线虫是否以及如何与同时发生的真菌相互作用仍然很大。在这里,我们将酵母Barnettozyma californica与秀丽隐杆线虫的中cosm隔离,并表征其基因组和与线虫的相互作用。我们发现B. californica被秀丽隐杆线虫摄入,可以用作食物来源的唯一,尽管很差。然而,当与大肠杆菌OP50一起使用时,真菌会导致人口增长和觅食行为改变,这表明这种真菌 - 细菌混合物比单独的细菌提供了更好的食物来源。这种效果在不同的天然秀丽隐杆线虫菌株之间有所不同,这表明线虫与加利福尼亚州的相互作用是基因组基础。分离的加州菌菌株的完全组装和注释的基因组并未表明其与秀丽隐杆线虫和/或大肠杆菌OP50相互作用的任何明显的候选基因。总的来说,我们的结果提供了一个有趣的例子,说明了自然相互作用的真菌,细菌和动物之间的复杂性和多层关系。
摘要 加州罂粟 (Eschscholzia californica) 是毛茛目的一员,是所有其他真双子叶植物的姊妹目,因此在系统发育上具有很高的信息量。毛茛目以其多样的花形态和许多药学相关生物碱的生物合成而闻名。加州罂粟被广泛用作研究花发育控制基因保存的模型系统。然而,在毛茛目中,稳定的遗传操作选择很少,因此很难建立遗传模型系统。在这里,我们介绍了一种通过农杆菌介导的转化、体细胞胚诱导和再生加州罂粟进行高效、稳定的遗传转化的方法。此外,我们还提供了一种快速分离和转化原生质体的方法。这使得可以在单细胞和全植物环境中研究基因功能,从而能够通过基因组编辑技术进行基因功能分析和生物碱生物合成途径的修改,为遗传模型生物E. californica提供重要资源。