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抗生素、氧化铁和硫酸钠对实验室建造的城市固体废物微环境中微生物群落组成的影响
城市固体废物 (MSW) 填埋场代表着尚未充分探索的微生物生态系统。填埋场中含有不同数量的抗生素和建筑和拆除 (C&D) 废物，这些废物有可能因杀生物剂或氧化还原活性成分而改变微生物代谢，而这些影响在很大程度上尚未得到充分探索。为了规避 MSW 异质性的挑战，我们对模拟的 MSW 微观世界进行了一项 65 天的时间序列研究，以评估微生物组的变化，使用 16S rRNA 测序来响应 1) Fe(OH) 3 和 2) Na 2 SO 4 来代表 C&D 废物的氧化还原活性成分以及 3) 抗生素。Fe(OH) 3 的添加改变了整体群落组成，增加了 Shannon 多样性和 Chao1 丰富度。添加七种抗生素的混合物（每种 1000 ng/L）会改变群落组成，而不会影响多样性指标。添加硫酸盐对微生物群落组成或多样性影响不大。这些结果表明，新鲜 MSW 中的微生物群落组成可能会受到铁废物涌入和单一抗生素应用的显著影响。
动物模型及其在成像辅助共同的作用 -
结果：干预后，Ig的空腹血糖（FPG）和总胆固醇（TC）的降低大于CG（P <0.05），而Ig中的糖基化血清蛋白（Gsp）的降低几乎比CG中的糖基化血清蛋白（Gsp）更大（P = 0.066）。Ig中的总蛋白（TP），白蛋白（ALB）和肌酐（CREA）水平显着降低，Ig中的降低比干预后的CG（P <0.05）大。干预后Ig中Ig中的ACE和CHAO1指数略高于基础线（分别为p = 0.056和0.052）。在Ig干预后，肌动杆菌，lachnospileceae，二杆菌科和phascalcoltctocterium的丰度显着增加（p <0.05）（p <0.05），并且Ig的丰度高于CG（p <0.05或p <0.05或p <0.1）。与FPG（p <0.05），梭菌，梭形梭菌和lachnospiraceae的丰富度与GSP（P <0.05）负相关（p <0.05），并且与两者呈阳性相关（p <0.05）。在干预过程中未观察到不良事件。
在生物膜中开发微生物群落和混合反应器中的活化污泥
微生物在生物废水处理中起关键作用。由于各种微生物结构的不同条件，生物质形式的形式决定了有机化合物转化的效率和机制。但是，比较生物膜和活性污泥中微生物群落的研究结果经常发生冲突。因此，本研究比较了使用16S rRNA测序的杂种反应器中生物膜中细菌群落和活化污泥的组成和发展。统计分析包括鉴定生物膜特征和活性污泥，α和β多样性分析以及网络分析的分类单元。这些分析表明，生物膜细菌群落比激活的污泥社区更丰富，更多样化。在生物膜中的平均数量为1614，而活化污泥的平均数为993，而CHAO1（1735 vs. 1105）和Shannon（5.3 vs. 4.3）生物多样性指数的平均值显着更高。生物膜是硝化剂（例如硝基瘤，硝基螺旋体）和磷积聚生物体（Candidatus累积）的更好环境。生物膜共发生网络中的细菌彼此之间具有更多的连接（基于Spearman的等级相关系数），这表明它们的相互作用比活性污泥中的相互作用更多。
纳米孔测序评估环境样品中细菌病原体和相关抗生素抗性基因
摘要：如前和现在的大流行中，监测环境中的病原体可以提供多种见解，以了解其传播，进化甚至将来的爆发。本文通过在罗马尼亚的市政水和废水中使用纳米孔测序，评估了与特定病原体相关的检测微生物病原体和相关抗生素耐药基因的机会。主要结果表明，从肉类加工设施中收集EF流动的水具有改变社区的多样性和丰度，Chao1的价值（101-108和0.86-0.91）分别降低了，分别是MAIN 2与其他类型的较高的多样性相比，分别是MAINIP的多样性，分别是Simpson的多样性和较高的多样性。和0.97–0.98，伯克霍尔德西亚和伪科学是最丰富的家庭。此外，抗生素耐药性基因的发生率和类型受到抗生素源的近端的影响，其四环素（最高为45％的总读数）或新霉素，链霉素和抗肉霉素（Traptomycin和tobramycin）（总读数为3.8％）（总读数）的耐药性（最高为reads reads）由Same condiestion condivession形成。因此，纳米孔测序被证明是一种易于使用的，可访问的分子技术，用于环境病原体监测和相关的抗生素耐药基因。
Chinaxiv：202302.00044v1
摘要：土壤侵蚀是中国西北部山西省桑迪 - 霍利地区的一个严重问题。由于植被恢复而逐渐改善，但是尚未广泛研究不同植被种植园类型的土壤微生物社区特征。为解决这个问题，我们分析了Caragana Korshinskii Kom。，Populus tomentosa Carr。，Populus Simonii Carr。，Salix Matsudana Matsudana Koid koid koid koid koid koid koid koid koid koid tabulaememememememismis carr中，分析了土壤细菌和真菌社区结构，多样性以及微生物和土壤环境因素。森林。在五种森林类型中，主要的细菌群落组成没有显着差异。细菌和真菌群落的α多样性表明，C. korshinskii森林中的ACE（基于丰度的覆盖量估计量），Chao1和Shannon指数明显高于其他四种森林类型中的ACE（P <0.05）。土壤有机物，总氮和脲酶对细菌群落组成的影响更大，而总氮，β-葡萄糖苷酶和尿素对真菌群落组成的影响更大。在所有森林类型中，有益和致病性微生物的相对丰度相似。基于微生物群落的组成，多样性和土壤肥力，我们将种植园从大多数到最不适合的人工林排名：C。Korshinskii，S。Matsudana，P。Tabulaeformis，P。Tomentosa和P. Simonii。
安全和自主无人机的关键技术
摘要背景：在轻度认知障碍（MCI）和痴呆症中肠道微生物组的差异以及与肠道微生物组改变有关的痴呆症的危险因素，是否仍然存在肠道微生物组的特征，问题仍然可以介导与MCI的教育相关性。目标：我们试图通过肠道微生物组的多样性或组成来研究教育和MCI关联的潜在调解。设计：横断面研究。设置：卢森堡，大地区（比利时，法国，德国）。参与者：卢森堡帕金森研究的参与者。测量：肠道微生物组组成，用16S rRNA基因扩增子测序确定。差异丰度，对教育小组进行了评估（0-10、11-16、16岁以上的教育）。alpha多样性（Chao1，Shannon和Inverse Simpson指数）。用教育作为曝光，MCI作为结果和肠道微生物组指标作为介体进行了教育分解的调解分析。结果：在排除50岁以下的参与者或缺少数据之后，包括n = 258名参与者（n = 58 mci）（M [SD]年龄= 64.6 [8.3]年）。高等教育（16岁以上）与MCI相关（几率自然直接效应= 0.35 [95％CI 0.15-0.81]。链球菌和lachnospipipeae -ucg -001属在高等教育中更丰富。结论：教育与肠道微生物组组成和MCI风险有关，没有明确的调解证据。但是，我们的结果表明，肠道微生物组的签名先前已在AD和MCI中鉴定出来在较低的教育中反映，并将教育作为微生物组研究中的重要协变量。
出生后一个月的母体饮食指数和后代微生物群：来自地中海出生队列 MAMI 的见解
摘要：背景：母亲怀孕期间的饮食可能通过母亲的微生物群影响婴儿的健康状况。我们评估了地中海地区母亲饮食指数 (MDI-med) 与婴儿 1 个月大时肠道微生物群的关联。方法：MAMI 研究是地中海地区的一个纵向出生队列。在这项工作中，进行了一项横断面研究，包括 120 对母婴对，他们有 1 个月大时的母亲饮食和婴儿微生物群数据。美国开发的 MDI (MDI-US) 已针对 MAMI 队列 (MDI-med) 进行了调整。基于极值进行分层（平均值“较低”的 MDI-med 组有 22 个，平均值“较高”的组有 23 个）。比较了各组之间的相对微生物丰度和 alpha（微生物丰富度和多样性指数）和 beta 多样性（Bray-Curtis 距离矩阵）。结果：母亲每日蔬菜摄入量较高、红肉摄入量较低是 MDI-med 评分较高组的特征。与 MDI-med 评分较低组相比，“上层”组的微生物多样性（Shannon 和 InvSimpson 指数（p = 0.01））明显较低，但丰富度（Chao1 指数）和 β 多样性（使用 Bray-Curtis 距离）没有变化。双歧杆菌属（放线菌门）的相对丰度较高与母亲每日蔬菜和酸奶摄入量有关。结论：1 月龄婴儿微生物多样性降低与 MDI-med 评分较高有关。母亲蔬菜和酸奶摄入量较高与婴儿肠道中双歧杆菌属的相对丰度较高有关。需要进一步研究来了解孕期饮食、婴儿微生物群和健康结果之间的联系。
细胞和分子生物学
嗜酸乳杆菌（LA）和L. Reuteri（LR）在我们日常生活中被广泛用作食品添加剂或药物。在OVX小鼠中，LA和LR已被证明可以抑制骨质流失。 这项研究着手找出嗜酸乳杆菌和Reuteri如何影响OVX小鼠的骨骼质量以及产生这种影响的机制。 Fifty C57BL/6J female mice aged 6 weeks were subjected to five different treatments: sham surgery (sham), OVX surgery (OVX), OVX+LR (OVX and L. reuteri fed), OVX+LA (OVX and L. acidophilus fed), OVX+LR+LA (OVX and both L. reuteri and L. acidophilus co-fed), 分别。 OVX小鼠分组饲养直到16周龄。 收集血清样品，并通过ELISA确定IL-1β，IL-6，TNF-α和OCN水平。 使用微CT扫描仪进行了双侧股骨薄层扫描。 扫描区域是整个股骨。 扫描程序后，通过3D多模型软件产生骨密度的样品数据。 为了检查微生物组成和特征，在小鼠粪便上进行了Illumina高通量测序。 益生菌进食后，OVX小鼠显示小梁数量和厚度，骨体积分数以及小梁分离的减少。 IL-1β，IL-6和TNF-α的血液水平显着下降。 观察到的CHAO1和ACE指数显着增加。 肠道微生物的变化发生在所有小鼠中。 肠道微生物中指数的变化可能表明OVX小鼠的骨骼质量正在发生变化。在OVX小鼠中，LA和LR已被证明可以抑制骨质流失。这项研究着手找出嗜酸乳杆菌和Reuteri如何影响OVX小鼠的骨骼质量以及产生这种影响的机制。Fifty C57BL/6J female mice aged 6 weeks were subjected to five different treatments: sham surgery (sham), OVX surgery (OVX), OVX+LR (OVX and L. reuteri fed), OVX+LA (OVX and L. acidophilus fed), OVX+LR+LA (OVX and both L. reuteri and L. acidophilus co-fed), 分别。OVX小鼠分组饲养直到16周龄。血清样品，并通过ELISA确定IL-1β，IL-6，TNF-α和OCN水平。双侧股骨薄层扫描。扫描区域是整个股骨。扫描程序后，通过3D多模型软件产生骨密度的样品数据。为了检查微生物组成和特征，在小鼠粪便上进行了Illumina高通量测序。益生菌进食后，OVX小鼠显示小梁数量和厚度，骨体积分数以及小梁分离的减少。IL-1β，IL-6和TNF-α的血液水平显着下降。观察到的CHAO1和ACE指数显着增加。肠道微生物的变化发生在所有小鼠中。肠道微生物中指数的变化可能表明OVX小鼠的骨骼质量正在发生变化。在OVX小鼠中，Lac毒cill酸果皮在防止骨质流失方面具有与L. Reuteri相同的作用。 存在肠道微生物多样性的变化，某些细菌的丰富性以及乳核酸乳杆菌或/和/和l. reuteri后骨代谢中的炎症因子的变化的精确原理。在OVX小鼠中，Lac毒cill酸果皮在防止骨质流失方面具有与L. Reuteri相同的作用。存在肠道微生物多样性的变化，某些细菌的丰富性以及乳核酸乳杆菌或/和/和l. reuteri后骨代谢中的炎症因子的变化的精确原理。
微生物群落的多样性和结构，在有或不具有富含Mannan的分数的情况下铺设母鸡
动物中的胃肠道微生物组为操纵提供了一个有吸引力的目标，以改善动物健康和生产性能。更好地了解鸡肉肠道微生物组，以及如何使用营养干预措施来调节微生物群。大多数鸡肠道微生物组的研究都检查了肉鸡，很少有针对层微生物组的研究。这项研究的重点是研究补充曼南的富含分数（MRF）对峰值层次和峰值后层的盲肠微生物群的影响。在一项喂养试验中，在随机完整的块设计中，喂食奶酪女性的母鸡被喂食对照饮食或用MRF补充的对照饮食。cecal含量是从每次治疗的10个随机选择的鸟类中收集的，并在4个时间点进行元基因组分析（D 16、32、64和84 MRF引入）。alpha多样性分析表明，在D 16，D 32和D 64补充后，ChAO1显着较大，但与对照相比，MRF补充层的D 84在D 84时较低（P <0.005）。PCOA图表明，物种水平的细菌群落组成在每个时间点上对照和MRF补充层之间的较大差异（p <0.001）。微生物组分析表明，在补充MRF的84天之后，致病细菌单核细胞增生李斯特菌，弯曲杆菌的空肠，粪肠球菌和梭状芽胞杆菌的差异明显较低。肠道菌群的细菌多样性增加是对入侵病原体的定殖耐药性的关键决定因素之一。在这项研究中，我们观察到在育雏中补充MRF后的84天中，在84天中观察到了更大的α和β多样性，并较低的细菌病原体进行了检测。参考抗生素耐药性和粮食安全的全球挑战，通过使用天然非抗生素替代品来降低致病细菌种类，对于食物链完整性以及氟ock健康尤其重要。
肠道微生物组合物在肌肉减少症中发生了变化
越来越多的证据表明，肠道菌群（GM）通过多种途径（例如蛋白质合物，慢性炎症和免疫力）以及代谢不平衡的多种途径参与了肌肉骨骼疾病的病理生理学。我们对人类研究进行了系统综述和荟萃分析，以评估患有和没有肌肉核心的个体之间的GM多样性差异，并探索有可能成为生物标志物的细菌。PubMed，Embase和Cochrane库从成立到2024年2月16日进行系统地搜索。如果他们（1）对成年人进行了肌肉减少症，并且（2）进行了GM分析并报告了α-多样性，β多样性或相对丰度，则包括研究。通过乔安娜·布里格斯（Joanna Briggs）研究所的关键评估清单评估了包括研究的方法论质量和证据的确定性，分别用于分析横截面研究和建议，评估，开发和评估（等级）工作组系统的等级。加权标准化平均差异（SMD）和相应的95％置信区间（CI）。beta分歧性和GM的相对丰度被定性地汇总。本研究中总共包括了19项涉及6,565名参与者的研究。在84.6％的研究和97.3％的参与者中始终观察到β多样性的差异。对肌肉减少症的肠道微生物差异丰度的详细分析确定了肌肉减少症中普雷托氏菌，prevotella和megamonas的损失。与对照组相比，发现肌肉减少症参与者的微生物丰富度显着降低（CHAO1：SMD = -0.44; 95％CI，-0.64至-0.64至-0.23，I 2 = 57.23％，13％，13个研究；观察到：SMD = -0.68; 95％CI，-1.1.68; 95％ci，-1.1.68; 95％，-1.1.00 to -0.1.00 to-0.1.00 to -0.1.00 to -0.1.00 to.ci to -0.1.00 to.ci xi xi to.95％to.ci xi。 66.07％，5个研究; ACE指数：SMD = -0.30； 95％CI，-0.56至-0.04，I 2 = 8.12％，4个研究）结论性，发现肌肉减少症与GM的丰富度降低有关，并且补充上述肠道细菌可能有助于预防和治疗这种肌肉疾病。研究方案已在Prospero（CRD42023412849）中注册和批准。