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后天花时代天花病毒的崛起
猪痘病毒 (MPXV) 有 2 个病毒进化枝和几个亚进化枝，它们具有独特的遗传、致病性和地理特征 ( 1 )，越来越受到科学界和公众的关注。尽管进化枝 II MPXV 的病死率为 3%–4%，但已证明进化枝 I MPXV 可在更高比例的患者中引起重病和死亡；未接种疫苗的人群的病死率高达 10%–11% ( 1 )。2022 年，进化枝 IIb MPXV 引发了全球大规模疫情，主要通过男同性恋、双性恋和其他男男性行为者 (MSM) 之间的性接触传播 ( 2 )。自 2022 年以来，疫情一直处于低水平；截至 2024 年 8 月，已报告约 100,000 例病例 ( 3 )。最近，自 2023 年以来，刚果民主共和国 (DRC) 爆发了 I 型 MPXV 病毒，导致数万例疑似病例，随后蔓延到邻国 (4、5)。该疫情影响了
Mpox 技术简介 10
本简报涵盖了针对英国国内的 I 型 mpox 分支的风险评估、准备和响应活动的技术要素。外交、联邦和发展办公室 (FCDO) 负责领导英国为受影响国家提供支持的活动。简报旨在与其他政府部门、公共卫生机构和从事相关工作的学术合作伙伴分享有用的数据。它包括早期证据和初步分析，可能会有所变化。要点：• 目前英国已发现 5 例 Ib 型 mpox 病例，其中 1 例为输入性病例，已传播给 3 名家庭接触者，1 例为输入性病例，迄今未发生任何传播（部分接触者仍在接受随访）。I 型 mpox 在英国被归类为高后果传染病。采取了预防措施，追踪接触者，降低接触后疫苗接种门槛。• 鉴于疫情继续蔓延至与英国联系更密切的国家，目前认为 I 型 mpox 分支的持续输入风险为中等。英国境内已证实存在传播，对于普通人群来说，在英国感染的风险较低，但对于与受影响国家旅行者关系更密切的个人和群体来说，感染风险可能为中等。• 受影响国家关于 Ib 型 mpox 爆发的证据基础不断增加，以及从我们自己和其他输出病例中吸取的教训，与我们之前发布的情景 B 最为相符，即中等传播性情景，传播由性接触和密切接触驱动（中等信心）。这也意味着，如果发生输入，进一步传播的风险现在被认为是低到中等。• 英国继续有少量进口和国内感染的 II 型 mpox（图 1）。
XPERT MPOX-使用说明-POC
结果是用于鉴定蒙基毒病毒（进化枝II）和非瓦里奥拉正oxoxvirus DNA，它们在急性感染期间通常在人的脓疱或囊泡病变标本中可检测到。阳性结果表明存在Monkeypox病毒（进化枝II）和/或非瓦里奥拉正oxoxvirus DNA；为了确定患者感染状况，必须与患者病史和其他诊断信息进行临床相关性。阳性结果不排除细菌感染或与其他病毒共同感染。检测到的药物可能不是疾病的明确原因。使用该设备获得的负结果不会排除蒙基氧基病毒（进化枝II）和/或非瓦里奥拉正托病毒感染，也不应用作治疗或其他患者管理决策的唯一基础。负面结果必须与临床观察，患者病史和流行病学信息相结合。
流感、呼吸道合胞病毒及其他呼吸道病毒监测报告
• 国家病毒参考实验室 (NVRL) 对 2023 年第 40 周至 2024 年第 2 周期间发现的 84 例流感阳性病例进行了基因鉴定。其中包括 70 个非哨兵呼吸道样本和 14 个哨兵 GP ARI 样本。其中，55 个对甲型流感病毒 (H3)、26 个对甲型流感病毒 (H1)pdm09 和 3 个乙型流感病毒/维多利亚病毒呈阳性。• 在全球范围内，最近检测到的所有甲型流感病毒 (H1N1)pdm09 均来自 6B.1A.5a 进化枝，因此引入了新的命名法，删除了前缀 6B.1A。 5a 进化枝已分裂为两个抗原性不同的簇：5a.1 进化枝携带氨基酸取代 D187A、Q189E，以北半球 2020-2021 疫苗病毒 A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019 为代表，而 5a.2 进化枝病毒携带氨基酸取代 K130N、N156K、A187D、L161I 和 V250A，以 2021/2022 和 2022/2023 北半球以及 2021/2022 南半球疫苗病毒 A/Victoria/2570/2019 为代表。 • 在爱尔兰，自 2022 年第 40 周以来表征的 A(H1)pdm09 流感病毒血凝素基因（n=26）全部归因于 5a.2a 进化枝，其中 13 个（50%）以 A/Sydney/5/2021 为代表，13 个（50%）与 AH1/Wisconsin/67/2022 病毒为代表的 5a.2a.1 病毒聚集在一起。 A/Sydney/5/2021 组携带与 A/Victoria/2570/2019 组相同的氨基酸替换，但具有额外的 HA1 K54Q、D94N、A186T、Q189E、E224A、R259K、T261A 和 K308R 替换，AH1/Wisconsin/67/2022 携带血凝素中的 P137S、K142R、D260E 和 T277A 替换。• 2023 年 9 月后收集的病毒的全球最新抗原分析发现，5a.2a 和 5a.2a.1 亚群中的大多数病毒都被针对 2024 南半球和 2023/2024 北半球流感疫苗株产生的雪貂抗血清有效抑制。这包括所有已测序的爱尔兰甲型流感病毒 (H1)pdm09，它们属于这些亚群，表明这些毒株在南半球和北半球季节都受到当前流感疫苗的良好保护。• 在全球范围内，最近检测到的所有甲型流感病毒 (H3) 都属于 3C.2a1b.2a 亚群，该亚群已分裂为两个亚群，即 3C.2a1b.2a.1 和 3C.2a1b.2a.2。新命名法删除了前缀 3C.2a1b.2a，将这些进化枝重命名为 1 和 2。具体来说，进化枝 2 进一步进化为进化枝 2a，该进化枝携带 Y159N、T160I (-CHO)、L164Q、N171K、S186D、D190N、P198S，并额外替换了 H156S 氨基酸，并以 A/Darwin/9/2021 病毒为代表，该病毒被推荐用于 2022/2023 北半球疫苗组合物。进化枝 2a 病毒进一步进化为亚进化枝 2a.1、2a.2 和 2a.3。具体来说，进化枝 2a.3a 和 2a.3a.1 自今年流感季节开始以来就一直在欧洲传播。 2a.3a 病毒携带氨基酸替代 E50K，以 A/Finland/402/2023 病毒为代表，而 2a.3a.1 病毒携带额外的 I140K，I223V氨基酸取代，以A/Thailand/8/2022病毒为代表。
主要的环境驱动因素的丰度，多样性和社区结构在稻田中
最近发现的完整氨氧化剂（comammox硝基螺旋体）包含了进化枝A和B，该进化枝A和B建立了一个独立的一步硝化过程。但是，对于农业土壤中的环境驱动因素或栖息地分布知之甚少。先前对稻田中硝基核心的研究主要集中在小型样品上，并且缺乏对稻田中comammamox硝基螺旋体的多站点研究。在这项研究中，我们对36个稻田的调查进行了调查，旨在了解Comammox硝基核心社区结构，丰富性和多样性以及它们受环境因素的影响程度。comammox硝基螺旋藻被发现广泛分布在稻土中。comammox硝基螺旋向进化枝A的丰度大多低于进化枝B，而其多样性大多高于Bade B.相关分析表明，多个因素影响了Comammox硝基螺旋体的丰度，包括pH，土壤有机物，总碳，总氮，纬度，平均年温度和平均年降水量（P <0.05）。此外，comammox硝基螺旋藻群落和栖息地之间存在明显的关系，表明某些扩增子序列变体（ASV）在特定栖息地中具有独特的主导地位。的系统发育分析表明，comammox硝基螺旋藻的ASV是由稻田中已知序列聚集的，与其他栖息地中的已知序列有显着差异。这可能与稻田的独特栖息地有关。相比之下，comammox硝基螺旋向进化枝B没有显示出明显的栖息地依赖性。这些结果支持稻田中硝基核心的广泛分布和大量的丰富性，并提供了对农业生态系统中氮循环和营养管理的新见解。
将 Mpox 疫苗纳入持续性健康临床护理
自 2017 年以来，Mpox 一直是刚果民主共和国 (DRC) 和非洲其他地区及南美洲的一种风险[1]。最近，世界卫生组织 (WHO) 记录了 2023 年刚果民主共和国 12,569 例疑似病例[2]，此次疫情被归因于 mpox 进化枝 I，该进化枝比其进化枝 II 具有更高的死亡率和传染性，因此构成更大的大流行风险。性传播已被发现，尽管可能存在漏报。不能排除在拥有大量流动 LGBTQIA+ 社区的高收入国家爆发进化枝 I 疫情的可能性。一些发生大规模持续 mpox 疫情的欧洲和北美国家，例如英国和加拿大，能够及早获得疫苗，因此在疫情爆发前实现了更高的疫苗覆盖率
MPOX全球战略准备和响应计划
虽然非洲以外的国家的案件数量似乎已经稳定，但仍发现零星的爆发，但在非洲已经观察到了MPOX案件和受影响国家的前所未有的增加。这种激增主要是由MPOX在DRC中的扩散驱动的，DRC约占该地区已确认的MPOX病例的90％。尽管流行病学尚未完全理解，但刚果民主共和国的两次爆发仍在进行：一种涉及进化枝IA，主要是在影响儿童的MPOX流行省，另一个涉及该国东部的进化枝IB，影响儿童和成人。后者已在南部和北部迅速蔓延，最近几周到达了邻国，例如布隆迪，肯尼亚，卢旺达和乌干达，这些国家以前从未报道过MPOX案件。2024年8月在瑞典和泰国，在非洲以外的第一批IB MPOX案件也据报道。
丝兰（Agavoideae，Asparagaceae）中的系统发育关系和特征演化
丝兰（Asparagaceae，agavoideae）的当前分类基于形态学特征，主要是基于水果类型，碳纤维，叶缘和花序类型。为了研究这些特征的演变及其作为丝兰中某些群体的突触形态的潜在分类学意义，对44丝甘菌和八种外部种类进行了系统发育分析。差异时间会产生适当的系统发育框架，以研究形态特征的演化。最大似然和贝叶斯推论分析显示，与丝兰的这两个属中的任何一个相比，Hesperoyucca和Hesperaloe之间的系统发育关系更紧密。先前提出的属内提出的系列没有被回收为单系，但基于水果类型，我们恢复了两个主要进化枝，我们在这里命名了Aloifolia和crade Rupicola。YUCCA茎的年龄和牙冠组的年龄分别为14.34（95％HPD：14.64–14.2）和7.45（95％HPD：11.31–3.48）年龄。最近的多元化事件发生在肉体和干果的物种中。Yucca是单系的，具有两个主要进化枝，对应于带有干果的物种（进化枝Rupicola）和肉质的果实（Aloifolia）。在两个进化枝中都观察到了部分地理一致性。分散类型可能是该属多元化的关键特征。叶边缘，碳纤维和花序类型与系统发育关系不一致。
鸡肉免疫反应对鸟类流感亚型H5N1对禽流感
摘要禽流感（AI）是印尼政府控制的战略动物疾病之一。本研究旨在检查印度尼西亚鸡对各种类型H5N1亚型AI疫苗的免疫反应，并确定影响疫苗后AI抗体反应的因素的相关性。血清样品。抗体滴度。进行了相关分析，以评估抗体滴度与以下每个因素的相关性：采样时鸡的年龄，采样时间与先前的疫苗接种之间的间隔以及进行的疫苗接种数量。结果表明，与AI抗原亚型H5N1菌株A/Chicken/Barru/BBVM/41-13/2013（2.1.3）的平均抗体滴度值在南苏马顿省的样本中最高，即Palembang City，Palembang City，Palembang City，是2 6.42 HIU。结果显示抗体滴度与采样时间与先前疫苗接种之间的间隔，进行的疫苗接种数量以及采样时鸡的年龄之间的间隔之间存在显着相关性（P值<0,05）。因此，结果表明，使用AI疫苗种子亚型H5N1产生的免疫力可以诱导免疫力，保护值≥16。与家禽中AI爆发相关的人AI病例的百分比为34％[1]。关键词：禽流感，H5N1进化枝2.1.3，H5N1进化枝2.3.2，Hemagglutination Estection Pressuct介绍禽流感（AI）是一种人畜共患病；它可以从感染的动物传播到人类。AI在家禽中导致很高的死亡率，在印度尼西亚的家禽行业造成了巨大的经济损失。komisi nasional流感burung dan Pandemi流感估计，由于2004年至2008年，印度尼西亚因AI爆发而造成的经济损失大约是RP。4.3万亿美元，不包括由于失去工作机会和社区中动物蛋白消耗而导致的损失[2]。这些条件使AI成为印尼政府控制的优先事项[3]。2003 - 2004年印度尼西亚的AI疾病暴发是由AI病毒亚型H5N1进化枝2.1引起的。
Mpox：多国外部形势报告第 37 号
要点 • 本情况报告提供了非洲每周 mpox 流行病学情况和每月全球流行病学情况的最新情况。 • 虽然与进化枝 II MPXV 相关的全球疫情正在非洲以外受影响最严重的国家持续发生，但进化枝 I MPXV 疫情仍在已知的 mpox 流行地区发生，与进化枝 Ib MPXV 相关的病例仍在刚果民主共和国东部省份和布隆迪不断扩大的疫情中报告。 • 最近几周检测试剂的短缺阻碍了刚果民主共和国 mpox 病例的确认。 • 截至 2024 年 8 月底，全球已报告 2082 例确诊 mpox 病例，创下 2022 年 11 月以来全球每月病例数的最高纪录。世卫组织非洲、欧洲和西太平洋区域报告了上升趋势。与此同时，美洲区域 2024 年 8 月的病例数与上个月相比有所减少。 • 在过去的一个月中，一个新的国家加蓬报告了第一例猴痘病例。 • 非洲五个国家（布隆迪、刚果民主共和国、肯尼亚、卢旺达和乌干达）和非洲以外的两个国家（瑞典和泰国）报告了 Ib 型猴痘病毒 (MPXV)。现有信息表明，这种病毒株正在刚果民主共和国和布隆迪持续社区传播。 • 该报告提供了截至 2024 年 9 月 15 日世卫组织全球猴痘应对行动的最新情况。 • 本期特别关注概述了世卫组织猴痘传播协议，旨在以标准化方式调查猴痘疫情，加强控制工作并解决关键知识空白。