。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经同行评审认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2024年12月5日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2024.12.05.626964 doi:Biorxiv Preprint
背景:据报道,各种疾病(包括不同的癌症)中都存在异常的 DNA 甲基化模式。CRISPR/Cas9 是一种低成本、高效的基因编辑工具,最近彻底改变了生物技术。研究表明,CRISPR/Cas9 系统可以有效地靶向和纠正甲基化。目的:端粒酶对癌细胞的生存起着重要作用。它由 hTERT 基因编码。本研究评估了 CRISPR/Cas9 靶向 hTERT 治疗胶质瘤癌细胞的有效性。方法:使用携带 sgRNA 和 Cas9 杂交体的 EF1a-hsaCas9-U6-gRNA 载体转染 U87 胶质瘤细胞。研究了 4 和 8 µ g/mL 聚凝胺浓度以提高转染效率。使用实时 PCR 评估经过亚硫酸氢盐修饰的 hTERT 的表达水平。还使用流式细胞术和蛋白质印迹法来确定细胞中是否存在端粒酶。采用高分辨率熔解分析(HRM)检测hTERT启动子的甲基化情况,流式细胞术检测转染U87细胞凋亡率。结果:结果表明,gRNA显著提高了转染效果,4µg/mL聚凝胺和80µg/mL转染后,U87细胞中hTERT的表达与未转染gRNA和基底细胞相比有显著差异,流式细胞术显示转染细胞中hTERT水平降低,转染gRNA后U87细胞凋亡率高于未转染gRNA组。结论:设计的CRISPR/Cas9系统可以降低hTERT表达和端粒酶活性,从而抑制神经胶质瘤细胞生长。
图1。使用ssDNA或PCR产物作为HDR模板(a)上部的蛋白质标记的策略示例:据报道编码Centriolar远端附属物蛋白SCLT1的C-末端的基因组序列。带下划线的序列代表CrRNA识别位点,PAM序列为黄色,垂直虚线表示切割位点。鉴于距离内源性终止密码子(BOLD大写字母的TAA)距离为14 bp,插入位点被任意定位为距剪切位点1 bp的位置,即在SCLT1的密码子之间的最接近的交界处。在下部,密码子(上图)和相应的氨基酸性残基(下图)构成了插入物:蓝色大写字母是指可易加的链接器,然后是v5-tag(红色)和附加的外源终止密码子(黑色)。50 bp lha或rha = 50碱基对左同源臂或右同源臂。(b)使用PCR产物作为供体DNA生成具有荧光蛋白(FP)的蛋白质(您最喜欢的蛋白质,YFP)的C端标记的示意图。PCR模板由带有FP,2A元件和电阻盒(R)的标准质粒(左侧)组成。使用一对60mer引物进行PCR反应。在右侧代表了目标基因座(您最喜欢的基因,YFG)的编辑。