使用一个野外收集的标本进行测序。DNA提取。根据制造商的说明,使用Illumina Truseq套件构建了配对的测序库。该库是在配对端,2×150 bp格式的Illumina Hi-Seq平台上进行测序的。用三型V0.33(Bolger,Lohse和Usadel 2014)修剪了所得FASTQ文件的适配器/引物序列和低质量区域。修剪序列由黑桃v2.5组装(Bankevich,Nurk,Antipov等2012)随后使用Zanfona V1.0(Kieras 2021)进行完成步骤,以基于相关物种中保守的区域加入附加的重叠群。
结果:数据库包括73342个条形码,分为来自101个国家 /地区的5310个垃圾箱(物种代理)。哥斯达黎加贡献了所有条形码序列的近一半,而将近50个国家 /地区的条形码少于十个。只有五个国家,哥斯达黎加,加拿大,南非,德国和西班牙,尽管条形码数据库涵盖了大多数主要的分类学和生物地理位置上的谱系,但采样了很高的完整性。pd显示出中度饱和度,因为一个国家添加了更多的物种多样性,并且社区系统发育表明国家动物群的聚类。然而,在物种层面,即使在最激烈的采样国家中,库存仍然不完整,并且对全球物种丰富度模式的评估不足。
使用引物211F(5'-TTTTTTTTTTCTAGTAGATTAGATTGRTTTYAT-3')和210r(5'-cacCAACTCTTTAAAATATC-3'')(5'-TTTTTTTTTTATATAGATTTTYAT-3'')扩增了线粒体细胞色素C氧化酶亚基II基因(mtDNA Cox2)。聚合酶链反应(PCR)以25μl的体积进行,含有0.5μl的每种底漆10μm,3μl的MGCL2 25 mm(Promega,USA),5μL的5×缓冲液(Promega),0.5μlDMSODMSO DMSO 0.3 mm,0.3 mm,0.5毫米,0.3毫米,DNTS 10毫升,Dnts 10 mm,dnts dnts dnts dnts dnts dnts dnts dnts dnts dnnt dnts dnts dnnt。 GO-TAQ聚合酶(5 U/μL)(Promega)和2μL的总DNA模板,添加超纯水以达到最终体积。PCR时间温度条件如下:94°C持续3分钟(初始变性),然后在94°C下34个循环30 s(变性),46°C 60 s(退火),72°C 90 s(扩展),持续90 s(扩展),在72°C下以72°C的降低。PCR。(2014)。
1 UMR 5554 ISEM(IRD,UM,CNRS,EPHE),UNIV MONZONLIER,PACA EUGENE BATAILON,34095 MONTPELLIER CEDEX 5,法国2,Museum 2 Museum Naturkunde,Leibniz Institute for Evolution and Biovive Science Institute for Invelosity and Bioviverity Science,Invalidstr。 div>43,10115德国柏林3 CEFE,CEFE,UNIV MONTPELLIER,CNRS,EPHE-PPSL大学,IRD,IRD,CNRS校园1919 De Mende,34293 Montpellier Cedex Cedex 5 France 5 France 4次生生态实验室,沿海研究,海洋研究部沿海地区,海洋研究部。 Chile, Santiago, Casilla 114-D, Santiago, Chile 5 Institute of Environmental and Evolutionary Sciences (ICAEV), Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile 6 Ictioplankton Laboratory (Labiti), Institute of Biologist, Faculty of Sciences, University of Valparas of Valparaso, Chile 8 Millennium nucleus for Ecology and Conservation of Temperate中间礁生态系统(Nutme)
1欧洲分子生物学实验室,惠康基因组校园,欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI),欣克斯顿,欣克斯顿,CB10 1SD,英国,2克里姆比尔研究所,数据科学疾病数据科学发现中心,大学卫生网络,大学健康网络,5KD-407,5KD-407,Leonard Avenitute,Torontoe,Toronto,30。 UCLA, Los Angeles, CA 90095, USA, 4 Department of Biology, University of Rome Tor Vergata, Via della Ricerca Scientifica, Rome, 00133, Italy, 5 Department of Biology, Ecology and Earth Sciences, Università della Calabria, Rende, 87036, Italy, 6 Providence John Wayne Cancer Institute, Department of Translational Molecular, Santa Monica, CA 90404, USA, 7 Univ Lyon, University Claude Bernard Lyon 1, INSA Lyon, CPE, Institute of Molecular and Supramolecular Chemistry and Biochemistry (ICBMS), UMR 5246, F-69622 Villeurbanne, 69622, France, 8 Department of Molecular, Cell and Developmental Biology, UCLA, Los Angeles, CA美国90095和90095,多伦多多伦多大学医学生物物理学和计算机科学系
肠道微生物群在几种昆虫的营养中起功能。但是,在鳞翅目中尚不清楚情况。现场研究表明,微生物组可能不稳定,并且是由饮食决定的,而在实验室中,鳞翅目通常是在含有对微生物群落影响不明的抗生素的饮食上饲养的。此外,鳞翅目微生物组的表征的分子方法很少描述代谢活性的肠道细菌。这项研究的目的是评估饮食和抗生素如何影响Spodoptera exigua(Hübner)生长以及肠道细菌群落的多样性和活动。我们评估了在存在和不存在链霉素的情况下,苜蓿和小麦基饮食如何影响幼虫的生长。苜蓿饮食改善了幼虫的生长,pupal质量和生存率,但抗生素仅在小麦细菌饮食中受益。我们观察到肠道细菌群落中饮食驱动的变化。在活跃的社区中,苜蓿菌落以肠球菌和犀牛为主,而在小麦种植菌群中,仅存在肠球菌。相比之下,形成孢子的杆菌是DNA群落中非常普遍的成员。在这两种情况下,链霉菌素对存在的分类单元的相对丰度都有选择性影响。我们的研究强调了表征肠道微生物群落多样性和活动的重要性。DNA衍生的群落可能包括环境DNA,孢子或不可行的细菌,而RNA衍生的社区更有可能准确地表示有可能直接参与宿主代谢过程的活性成员的多样性。
Bagrada Hilaris(Burmeister)(Hemiptera,Pentatomidae),也称为Bagrada Bug,现在是西半球的重要害虫,已经入侵了西部单位状态(Palumbo等人(Palumbo等) 2016),墨西哥(Sánchez-Peña,2014年)和智利(Faúndez等 2016)。 在智利,B。Hilaris迅速传播到最初被发现的大都会地区的北部和南部(Faúndez等人。Bagrada Hilaris(Burmeister)(Hemiptera,Pentatomidae),也称为Bagrada Bug,现在是西半球的重要害虫,已经入侵了西部单位状态(Palumbo等人(Palumbo等)2016),墨西哥(Sánchez-Peña,2014年)和智利(Faúndez等2016)。在智利,B。Hilaris迅速传播到最初被发现的大都会地区的北部和南部(Faúndez等人。2018),并且与黄铜质作物和自然区域有关(Alaniz等人2021)。智利中的当前控制措施由常规杀虫剂的重复应用组成,这些杀虫剂似乎无效(SAG 2017a,b)。当前,在城市或郊区环境中或自然栖息地中没有可行的选择可以控制人口。目前,智利瓦尔帕莱索的一家研究所Centro Ceres正在通过多样化的农业生态系统的营养成分来调查这种害虫的替代解决方案。通过增加功能性生物多样性和采用推拉策略,目的是降低Hilaris的密度和对农作物的损害,并有利于自然敌人的存在。然而,关于一般来说,针对臭虫的土著罐头剂的知识,尤其是Hilaris的知识在智利方面很差。由于需要饲养设施和共同限制,因此,Hilaris的前哨卵的暴露仅是机会性的,但是我们研究B. Hilaris的努力偶然地提供了我们在这里提出的实质性结果。
亲本物种的变异(Rieseberg 等人,2003b;Bell 和 Travis,2005;Stelkens 等人,2009)。超亲表型在植物和动物中都很常见,迄今为止已在几种与适应度相关的性状中得到证实,包括形态学(鱼类的头骨形态学,Stelkens 等人,2009;蝴蝶的翅膀形态学,Mérot 等人,2020)、生理学(桡足类的温度耐受性,Pereira 等人,2014)、生活史(蜗牛的后代数量和大小,Facon 等人,2008)和行为性状(果蝇的交配行为,Ranganath 和 Aruna,2003;鱼类的觅食行为,Selz 和 Seehausen,2019;Feller 等人,2020)。已经提出了不同的机制来解释亲本基因组重组如何产生新性状(Rieseberg 等人,2003b;Bell 和 Travis,2005;Stelkens 等人,2009;Thompson 等人,2021)。极端杂交表型可能出现在第一代(F1)杂交中,这种现象通常
摘要 圈养灵长类动物的营养摄入量不一定反映其野生同类的营养摄入量。圈养饮食中非结构性碳水化合物含量通常较高,纤维含量较低,导致肥胖、牙齿问题、腹泻和行为问题等健康问题。本研究的主要目的是建立和监测五种灵长类动物(Ateles fusciceps rufiventris、Cercopithecus hamlyni、Allochrocebus lhoesti、Cercopithecus roloway、Sapajus xanthosternos)的无水果饮食变化。对营养和行为学进行了监测,包括在饮食变化前、变化期间和变化后评估饮食的营养成分;监测粪便稠度;观察喂养选择;以及通过扫描取样观察攻击性行为和发声的发生。初始饮食包括栽培水果和蔬菜以及一些额外食物(谷物、动物和植物蛋白),非结构性碳水化合物(尤其是糖)含量高于饲养指南中的推荐水平。经过四周的饮食变化(在此期间逐渐去除水果),平均糖含量减少了一半以上,纤维含量增加了。蜘蛛猴 A. f. rufiventris 和哈姆林猴 C. hamlyni 的粪便稠度有所改善(布里斯托尔粪便评分变化:分别为 6 至 4 和 7 至 3)。卷尾猴 S. xanthosternos 和哈姆林猴的进食时间有所增加(增加了 1.5 至 2 倍)。这些发现强调了将动物园管理的灵长类动物改为无水果高纤维饮食的有益影响。
Corentin Iltis,JérômeMoreau,KarolinaPecharová,DenisThiéry,Philippe Louapre。 欧洲葡萄藤蛾Botrana(Tortricidae)的生殖性能受到变暖情景的不利影响。.虫害科学杂志,2020,93(2),第679-689页。 10.1007/s10340-020-01201-1。 hal-02531426Corentin Iltis,JérômeMoreau,KarolinaPecharová,DenisThiéry,Philippe Louapre。欧洲葡萄藤蛾Botrana(Tortricidae)的生殖性能受到变暖情景的不利影响。.虫害科学杂志,2020,93(2),第679-689页。10.1007/s10340-020-01201-1。hal-02531426