human serum albumin idiosyncratic drug-induced agranulocytosis idiosyncratic drug-induced skin rash interdomain linker IDR idiosyncratic drug reaction Ig immunoglobulin IL interleukin IFN interferon ip intraperitoneal KO knockout LGL large granulocyte lymphocytes LPS Lipopolysaccharides
极限学习机(ELM)是模式识别和机器学习中的快速且有效的神经网络模型,当标记的训练样本不足以使其下降。转移学习通过使用不同但相关域中的大量标记样本来帮助目标任务学习可靠的模型。在本文中,我们提出了一台具有知识传递性的监督极限学习机器,称为“转移极限学习机器”,具有输出权重对齐(telm-Owa)。首先,它通过对齐由来自源和目标域标记的样品训练的ELM的输出权重矩阵来减少域之间的分布差异。其次,将域间ELM输出权重矩阵之间的近似值添加到目标函数中,以进一步实现知识的跨域转移。tirdly,我们将目标函数视为最小平方问题,并将其转换为标准的ELM模型,以便有效地解决。最后,通过对16组图像数据集和6组文本数据集进行了分类实验对所提出算法的效果进行了验证,结果证明了我们方法相对于其他ELM模型和转移学习方法的竞争性能。
b'Abstract:模块化聚酮化合物合酶(PKS)是巨型组装线,产生了令人印象深刻的生物活性化合物。然而,我们对这些巨质的结构动力学的理解,特别是酰基载体蛋白(ACP)结合的构建块的递送到酮类合酶(KS)结构域的催化位点的构建块仍然受到严重限制。使用多管结构方法,我们报告了在根瘤菌毒素PK的链分支模块中C C键形成后域间相互作用的详细信息。基于机制的工程模块的交联,使用作为迈克尔受体的合成底物底座。交联蛋白使我们能够通过低温电子显微镜(Cryo-EM)在C键形成时鉴定出二聚体蛋白复合物的不对称态。AlphaFold2预测也指示了两个ACP结合位点的可能性,其中一个用于底物加载。NMR光谱表明,在溶液中形成了瞬态复合物,独立于接头结构域,并且具有独立域的光化学交联/质谱法使我们能够查明域间相互作用位点。在C C键形成后捕获的分支PK模块中的结构见解可以更好地理解域动力学,并为模块化装配线的合理设计提供了宝贵的信息。
海洋浮游植物,病毒和细菌之间的相互作用驱动生物地球化学循环,塑造海洋营养结构并影响全球气候。微生物产生的化合物已成为影响真核生理学的关键参与者,进而重塑微生物群落结构。这项工作旨在揭示细菌群体传感分子2- heptyl-4-喹诺酮(HHQ),该分子是由海洋γ-帕特罗氏菌杆菌spps spp。生成的,可阻止病毒诱导的cocimopol cocicocipol hh hhh cocicocipocipocipocipocipol hh spp。先前的工作已经建立了烷基素醇作为二羟基脱氢酶(Dhodh)的抑制剂,这是一种基本酶,促进了嘧啶生物合成和潜在的抗病毒药物靶标的第四步。huxleyi dhodh的N末端截断版在大肠杆菌中异源表达,纯化和动力学表征。在这里,我们显示HHQ是E. huxleyi Dhodh的有效抑制剂(2.3 nm的K I)。E。huxleyi细胞暴露于brequinar(典型的人类dhodh抑制剂)中,经历了直接但可逆的细胞停滞,这种作用反映了先前观察到的HHQ诱导的细胞静止。然而,brequinar治疗缺乏在HHQ暴露的赫uxleyi中观察到的其他显着影响,包括细胞大小,叶绿素荧光的显着变化以及免受病毒诱导的裂解的保护,表明HHQ具有尚未发现的尚未发现的生理靶标。一起,这些结果表明细菌群体传感分子在海洋生态系统中三方相互作用中的新颖而复杂的作用,为探索微生物化学信号传导在Algal Bloom调节和宿主肺病动力学中的作用开辟了新的途径。