这项研究的目的是探索与异念珠菌(INH)和利福平(RIF)(RIF)抗性的频率和分布。在这项回顾性研究中,通过刺激性分型分析了173个MDR-TB菌株的基因型。KATG,INHA基因和INHA的启动子区域,其中遗传突变赋予INH抗性; RPOB基因测序遗传突变赋予RIF抗性。 还分析了不同基因型菌株之间抗性相关的核苷酸改变的百分比。 总共有90.8%(157/173)的MDR菌株属于北京基因型。 种群特征在不同基因型的菌株中没有显着差异。 总共有50.3%(87/173)的菌株在katg的密码子S315T处发生突变; 16.8%(29/173)的菌株在INHA启动子区域有突变;其中,INHA启动子区域的-15碱基(C→T)处有5.5%(15/173)的点突变。 总共有86.7%(150/173)的菌株在RPOB基因时具有突变;其中,RPOB的密码子S531L菌株有40%(69/173)的菌株。 在北京基因型MDR菌株中突变的频率没有明显高于非临界基因型。 北京基因型MDR-TB菌株正在北京扩散,并对该地区的结核病控制提出了重大挑战。 观察到了Katg Ser315THR,INHA启动子区域(-15C→T)和RPOB(S531L)突变的高患病率。KATG,INHA基因和INHA的启动子区域,其中遗传突变赋予INH抗性; RPOB基因测序遗传突变赋予RIF抗性。还分析了不同基因型菌株之间抗性相关的核苷酸改变的百分比。总共有90.8%(157/173)的MDR菌株属于北京基因型。种群特征在不同基因型的菌株中没有显着差异。总共有50.3%(87/173)的菌株在katg的密码子S315T处发生突变; 16.8%(29/173)的菌株在INHA启动子区域有突变;其中,INHA启动子区域的-15碱基(C→T)处有5.5%(15/173)的点突变。总共有86.7%(150/173)的菌株在RPOB基因时具有突变;其中,RPOB的密码子S531L菌株有40%(69/173)的菌株。在北京基因型MDR菌株中突变的频率没有明显高于非临界基因型。北京基因型MDR-TB菌株正在北京扩散,并对该地区的结核病控制提出了重大挑战。观察到了Katg Ser315THR,INHA启动子区域(-15C→T)和RPOB(S531L)突变的高患病率。基于基因突变的分子诊断是在中国北京快速检测MDR-TB的有用方法。
抗菌基因座 异烟肼 katG 、furA-katG 启动子、mabA 、inhA 、mabA-inhA 启动子、oxyR-ahpC 启动子 利福平 rpoB 吡嗪酰胺 pncA 启动子 乙胺丁醇 embB 、embC-A 启动子 氟喹诺酮类 gyrA 、gyrB 链霉素 rrs、rpsL 卡那霉素 eis 启动子、rrs 阿米卡星 rrs 乙硫异烟胺 ethA
3.1在GenExpert仪器系统上执行的XPERT MTB/XDR分析是一种嵌套的实时聚合酶链反应(PCR),用于在体外诊断测试中检测耐药性(XDR)耐药(XDR)结核病(MTB)的毒性(MTB)复合物中的毒液毒和浓度的DNA,浓度的DNA,浓度为浓度的DNA或分枝杆菌生长指示灯管(MGIT™)培养物。在检测到MTB的标本中,XPERT MTB/XDR分析还可以检测Katg和FabG1基因中的异念珠菌(INH)抗性突变,Oxyr-AHPC基因间区域和INHA启动子;仅与INHA启动子突变相关的乙二酰胺(ETH)抗性; Gyra和Gyrb喹诺酮耐药性确定区域(QRDR)中的氟喹诺酮(FLQ)抗性相关突变; RRS基因和EIS启动子区域中的第二线注射药物(SLID)相关突变。
结核病(TB)是由结核分枝杆菌引起的疾病,对全球健康是严重威胁。可用于检测和鉴定引起TB的细菌的方法是定量聚合酶链反应(QPCR)。在这种方法中,变性和延长温度是需要优化成功的决定因素之一。这项研究旨在优化DNA M.结核病的扩增中的变性和延长温度。使用准实验设计的研究。最优化的温度为93、94、95、96和97°C,用于扩展为58、59、60、61和62°C。测试样品是从结核分枝杆菌的患者收集的痰液样本,对异念珠菌具有抗性。优化是使用七个测试引物,即S315T,S315N,S315I,S315R,S315G,S315G,S315L和R463B,具有KATG基因的靶标。优化数据通过MS Excel处理最低的CT值。结果表明,使用的每个引物的最佳变性温度各不相同。主要的S315T,S315R和S315G在96°C的变性温度下最佳,最佳S315N在94°C时,主要S315i和R463B在93°C下最佳的R463B,最佳的S315L引物在95°C,最佳的S315L引物,最佳使用的温度为96°C. 96°C. 在58°C下的最佳延伸温度,用于原代S315N,S315N,S315I和R463B,初级S315R和S315G在60°C下,初级S315L在61°C下为61°C。 可以得出结论,变性研究的最佳温度为96°C,延伸为58°C。。在58°C下的最佳延伸温度,用于原代S315N,S315N,S315I和R463B,初级S315R和S315G在60°C下,初级S315L在61°C下为61°C。可以得出结论,变性研究的最佳温度为96°C,延伸为58°C。
1 UKM 医学分子生物学研究所 (UMBI),马来西亚国民大学,56000,蕉赖,吉隆坡,马来西亚; 2 马来西亚卫生部国立卫生研究院医学研究所传染病研究中心细菌学组。 FAF:fariharesearchjourney@gmail.com SRR:srosz77@gmail.com HM:hui-min@ppukm.ukm.edu.my 运行标题:TUBERCULOSIS IN MALAYSIA * 通讯地址:UKM 医学分子生物学研究所 (UMBI), Universiti Kebangsaan Malaysia, 56000, Cheras, Kuala Lumpur, Malaysia。 +60391456321(HM);电子邮件:hui-min@ppukm.ukm.edu.my (HM) 摘要 在马来西亚,尽管采取了疾病控制和预防措施,结核病仍然是一个公共卫生问题。本综述探讨了马来西亚肺结核 (PTB) 的时间线、流行病学、管理和该国疾病的前景。PTB 于 20 世纪初首次在马来亚报告,并导致高发病率和死亡率。随着 1961 年国家结核病控制计划的建立以及每个州综合医院的胸科诊所,死亡率成功降低。尽管如此,PTB 发病率在 2011 年后稳步上升,马来西亚目前是该病的流行国家。PTB 诊断根据卫生部的临床实践指南进行,包括胸部 X 光、痰培养和抗生素敏感性测试。患者根据世卫组织的指导方针接受治疗。虽然该国近年来耐药病例减少了 0.02%;但已报告两例广泛耐药结核病病例。该国已报告了所有主要的结核分枝杆菌谱系(印度洋-大洋洲;东亚(包括北京)、东非-印度和欧-美洲)。与沙巴和砂拉越相比,北京菌株家族在马来西亚半岛的流行率更高,这表明两地病原体的进化存在差异。大多数抗生素耐药菌株都含有 rpoB 、 katG 、 embB 和 pncA 突变。在诊断、应用程序和警报系统中越来越多地使用分子平台和人工智能来进行更好的监测,并实施全民治疗,对于该国在 2035 年实现无结核病状态至关重要。关键词:肺结核、马来西亚、结核病时间表、结核病流行病学、马来西亚的结核分枝杆菌谱系、结核病控制举措