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罗马大学数学系
2）量子场理论和量子信息理论3）数学模型和PDE 4）拓扑数据分析5）代数几何和应用中的数学模型6）天体力学和空间应用中的数学模型7）数学模型，概率模型，概率，统计和机器学习8）邀请和数字分析9）数学列表和数字分析的邀请，并在数学上进行数学变化。时期：L。Apolloni（利兹大学），S。Baranzini（Storino大学），G。Barkeley（哈佛大学），M。Barton（BC Applied Math。），a.m。贝尼尼（帕尔马大学），P。Bielavsky（U.C.louvain），L。BruniBruno（Padova大学），K。Buzzard（帝国学院），D。Castorina（Napoli University of Napoli“ Federico II”），S。Chemla（Sorbonne-Pariscité大学），A。Clarke（Barcelona），A。Clarke（Upc Barcelona），Bonn）很少（约克大学），C。Hohlweg（UqMontréal），W。DeGraaf（Trento大学），G。Landi（Trieste大学），G。Marasingha（Exeter）（埃克塞特大学），L。Martinazzi，Martinazzi（罗马大学）帕维亚（Pavia），P。Majer（PISA大学），T.K。nguyen（北卡罗来纳州立大学），M。Nolasco（L'Aquila大学），F.A.E。 nuccio（大学Jean Monnet Saint-Etienne），R。Pagaria（博洛尼亚大学），G。Piacenza（IEC Lorrain-Nancy），F。Pratali（Sorbonne-Paris Nord），V。Reiner（明尼苏达州） tübingen-bonn），P。souplet（大学nguyen（北卡罗来纳州立大学），M。Nolasco（L'Aquila大学），F.A.E。nuccio（大学Jean Monnet Saint-Etienne），R。Pagaria（博洛尼亚大学），G。Piacenza（IEC Lorrain-Nancy），F。Pratali（Sorbonne-Paris Nord），V。Reiner（明尼苏达州） tübingen-bonn），P。souplet（大学nuccio（大学Jean Monnet Saint-Etienne），R。Pagaria（博洛尼亚大学），G。Piacenza（IEC Lorrain-Nancy），F。Pratali（Sorbonne-Paris Nord），V。Reiner（明尼苏达州） tübingen-bonn），P。souplet（大学
通过 CRISPR 协调玉米基因上调
基因组编辑技术显著提高了我们精确修改基因组和基因的能力，为设计内源途径和性状开辟了新的可能性。在玉米等作物中，已经证实可以实现小的插入/缺失、碱基变化和结构变异（Nuccio 等人，2021 年）。然而，虽然这些编辑通常会导致基因敲除 (KO) 或敲低，但许多农艺性状的改善需要更高的基因表达，有益的天然等位基因和转基因就是明证。因此，作物改良需要能够可预测和可调整地上调多个基因的工具，而没有使用转基因的技术限制和监管弊端。为了开发一种广泛适用的通过编辑增加基因表达的方法，我们寻找了一种玉米原生的小元素，可以将其插入内源启动子中以实现上调。我们在玉米基因组中发现了一个回文 12 bp 序列 GTAAGCGCTTAC（“植物增强子”，PE），它与农杆菌章鱼碱合酶启动子中已知的转录增强子元件（Bouchez 等人，1989）相似，并且也出现在其他作物（如大豆、水稻和大麦）的基因组中。为了在非同源末端连接 (NHEJ) 介导的 CRISPR/Cas 诱导的双链断裂修复过程中将 PE 插入玉米启动子中（图 1a），我们用金粒子轰击了来自 Cas9 表达系的未成熟玉米胚 (Lorenzo 等人，2022)，这些金粒子包裹着 (i) 针对谷氨酰胺合成酶 1-3 (Gln1-3) 核心启动子的合成单向导 RNA (sgRNA)，(ii) PE 三聚体 (3xPE) 作为双链寡脱氧核苷酸 (dsODN)，两端有两个保护性硫代磷酸酯键，没有任何目标同源序列，和 (iii) 携带除草剂抗性标记和荧光蛋白的表达盒的质粒，允许在再生过程中进行选择和视觉筛选。39% 的再生系在目标启动子中携带 dsODN 衍生的插入。除了完美的 3xPE 插入，由于 NHEJ 的不精确性，我们还恢复了连接处有小插入/缺失的等位基因、截断处只留下一个或两个 PE 单体或插入一个以上 3xPE 元件的等位基因（图 1b）。插入等位基因通常存在于 50% 或 100% 的扩增子测序读数中，
行为和脑部疾病中的微生物群 - gut-脑轴
肠道及其菌群（MB-GUT）是人体中细菌的最大吸收器官和储层。MB-GUT被认为是一个单个系统，其相互作用会产生影响整个身体功能的响应。中枢神经系统在所谓的MB甲状脑轴上与MB-GUT连续交叉对话，而MB产物激活的许多羽毛质途径对于大脑的正确发育和生理功能都是必需的。营养不良有助于年龄和年轻人口的许多病理状况。阐明MB脉冲如何影响衰老，阿尔茨海默氏病，多发性硬化症和其他神经退行性病理学的中枢神经系统至关重要。了解MB-GUT，肠系统，免疫细胞，神经元和神经胶质之间的相互作用及其对宿主防御，组织修复和神经变性的影响对于在疾病的分子基础上识别新参与者至关重要。在这方面，有必要遵循多学科的方法扩展到复杂的MB-Gut脑轴的所有地区和组成部分。尤其是，对MB-GUT驱动的变化的分析神经元 - 胃细胞 - 微神经三合会将突出与神经胶质细胞差异募集/激活相关的神经退行性机制，改善对神经元/Glia/Glia/Glia commental和PELUCIATS MB-GUT涉及的分子的了解，可以预防MB-GUT，以预防MB-GUT变化。Liang等。 QPCR分析进一步表明，DHC有效地下调了Alb，PON1和CNR1在结肠中的表达。Liang等。QPCR分析进一步表明，DHC有效地下调了Alb，PON1和CNR1在结肠中的表达。本社论介绍了《国际分子科学杂志》发表的新特刊，题为“行为和脑部疾病中的微生物群 - gut脑轴”，该问题涵盖了这一重要主题，其中包含六项有价值的贡献，即四项原始研究文章和两份评论。[1]研究了血肠citrina baroni（Daylily，DHC）对胃肠道转运，排便参数，短链有机酸，肠道微生物组，转录物和网络药理学的抗综合作用。作者证明，DHC的给药加速了小鼠的排便频率，并提高了一些有益的细菌分类群的丰富度，同时降低了盲肠内容中的病原体水平。转录组分析发现DHC干预后结肠中有700多个差异表达的基因（DEG），这些基因主要参与嗅觉转导途径。转录组学和网络药理学的整合揭示了七个重叠靶标（ALB，DRD2，IGF2，PON1，TSHR，MC2R和NALCN）。这些结果提高了对DHC抗便秘效应的理解，从而提供了新颖的转录组和网络药理学的综合视角。nuccio等。[2]研究了社会隔离对Microtus Ochrogaster（Prairie Vole）中肠道微生物组和代谢组的影响。生理压力导致孤立的女草原田鼠的焦虑和抑郁行为指标与配对的草原田鼠相对。在16S rRNA的水平上进行细菌DNA测序
肿瘤学中的基因组测序
Bancroft，E。K.，Kohut，K。，＆Eeles，R。A.（2020）。新的基因组学时代：将基因组学整合到主流肿瘤学及其对心理肿瘤护理的影响。心理学，29（3），453 - 460。https：// doi。org/10.1002/pon.5331 Berger，M。F.和Mardis，E。R.（2018）。基因组学在癌症医学中的新兴临床相关性。自然评论。临床肿瘤学，15（6），353 - 365。https：//doi.org/10.1038/S41571-018-018-0002-6 Carretero-Puche，C.，García-Martín，S.生物信息学如何为个性化精密医学的常规应用做出贡献？精密医学和药物开发的专家审查，5（3），115 - 117。https：//doi.org/10.1080/23808993。2020.1758062 Chow-White，P.，Ha，D。和Laskin，J。（2017）。与临床基因组学工作的医生之间的知识，态度和价值观：医学肿瘤学家的调查。人力健康资源，15（1），42。准备医学专家练习基因组医学：教育是更广泛策略的重要组成部分。遗传学领域，10，789。https：//doi.org/10.3389/fgene.2019.00789 De Moor，J.，Gray，S.，Mitchell，S.，Klabunde，C。，＆Freedman，A.（2020）。肿瘤学家对基因组测试的信心以及对使用多标记肿瘤面板测试的影响。目前对乳腺癌中肿瘤基因组测序的使用和态度。JCO精确肿瘤学，4，620 - 631。https：//doi.org/10.1200/po.19.00338 Gingras，I.，Sonnenblick，A. Azim，H。A.，Jr（2016）。科学报告，6，22517。https：// doi。org/10.1038/srep22517 Gomez-Lopez，G.，Dopazo，J.，Cigudosa，J.C.，Valencia，A。，＆Al-Shahrour，F。（2019）。精确医学需要开拓临床生物信息学家。生物信息学中的简报，20（3），752 - 766。https：// doi。org/10.1093/bib/bbx144 Gray，S.W.，Hicks-Courant，K.，Cronin，A.，Rollins，B.J。，＆Weeks，J.C。（2014）。医师对多重肿瘤基因组检测的态度。临床肿瘤学杂志，32（13），1317 - 1323。https：// doi。org/10.1200/jco.2013.52.4298 Innocent，J.，Ruth，K.，Boland，P.，Rainey，K.，Fang，C.，Cohen，C.，Cohen，S.，Matro，J.M.（2014）。学术（AO）和社区（CO）肿瘤学家对临床下一代测序基因组测试（NGSGT）的知识，理解和准备。临床肿瘤学杂志，32（15s），E17635。https://doi.org/10.1200/jco.2014.32.15_suppl。 E17635 Johnson，L.M.，Valdez，J.M.，Quinn，E.A. 将下一代测序纳入儿科肿瘤学实践：对物理学信心和对临床基因组学的理解的评估。 遗传咨询师在基因组时代的不断变化。 （2020）。https://doi.org/10.1200/jco.2014.32.15_suppl。E17635 Johnson，L.M.，Valdez，J.M.，Quinn，E.A. 将下一代测序纳入儿科肿瘤学实践：对物理学信心和对临床基因组学的理解的评估。 遗传咨询师在基因组时代的不断变化。 （2020）。E17635 Johnson，L.M.，Valdez，J.M.，Quinn，E.A.将下一代测序纳入儿科肿瘤学实践：对物理学信心和对临床基因组学的理解的评估。遗传咨询师在基因组时代的不断变化。（2020）。癌症，123（12），2352 - 2359。https：//doi.org/10.1002/cncr.30581 Kirk，M.，Tonkin，E。，E。，＆Skirton，H。（2014）。一种迭代共识的方法，用于修改英国护士教育的遗传学/基因组学能力框架。高级护理杂志，70（2），405 - 420。https：//doi.org/10.1111/jan.12207 Kohut，K.，Limb，S。，＆Crawford，G。（2019）。当前的遗传医学报告，7（2），75 - 84。https：//doi.org/10.1007/s40142-019-00163-w NHS健康教育。护理中的基因组学：基因组学教育计划。
地形土壤EERC：加速土壤碳...
土壤以有机和无机形式（全球3000亿吨的订单）中存储了大量的碳，这比在大气和陆地上的碳多。由于耕种和侵蚀，在过去一个世纪中，美国1.66亿公顷的农业土壤损失了大量碳，但有明显的潜力可以扭转这一趋势并积极地管理农业土地，并采用从大气中捕获CO 2的策略。Terraforming土壤能量土壤射击研究中心（EERC）将通过有机和无机碳循环途径来研究新的生物和地理工程技术，以了解土壤中的可扩展性和负担得起的CO 2。该中心的总体目标是通过有机和无机途径促进对土壤中的CO 2抽吸的基本了解，测量与土地管理实践有关的土壤C存储能力，耐用性和区域变化。在目标1中，合成生物学工具将用于加速自然存在的植物和微生物性状，这些植物和微生物特征形成了CO 2固定过程，有机物形成和矿物质溶解。组合的基因组测序和同位素追踪方法将用于量化有机物如何随着时间的推移而产生的基本机制以及需要更好地反映在过程模型中的植物和微生物的特征。但目前，土壤风化，土壤生物学和有机物循环之间的相互作用知之甚少。在目标2中，该中心将集中在原发性矿物质和有机物 - 阵营络合物形成期间可能发生的积极相互作用上，这些可能会通过有机和无机途径组合来加速土壤CO 2的巨大潜力。中心的现场和基于实验室的研究将衡量如何将土壤管理方法“堆叠”在一起，从