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使用挂锁探针解剖分子特征以解释病理状态 Anastasia Magoulopoulou
摘要 生命科学领域的最新技术进步极大地提高了我们以前所未有的深度在分子水平上解决科学问题的能力。自推出以来，下一代测序 (NGS) 实现了高通量分析，随着时间的推移，变得越来越普及和负担得起，塑造了研究和临床应用的未来。空间分辨转录组学 (SRT)，特别是原位测序 (ISS)，提供单细胞转录组数据，同时保留周围组织微环境的组织病理学背景。本论文探讨了挂锁探针与原位测序 (ISS) 或下一代测序 (NGS) 结合的应用，以解决与特定疾病相关的问题。在论文 I 中，我们研究了结核分枝杆菌 (Mtb) 与结核病感染小鼠肺中免疫细胞之间的空间相互作用，绘制了细菌簇和单个细菌附近的免疫相关转录本。我们的研究结果表明，在 Mtb 抗性的 C57BL/6 小鼠中，靠近单个细菌的巨噬细胞活化。相比之下，在易感染结核分枝杆菌的 C3HeB/FeJ 小鼠的肺组织中占主导地位的组织化肉芽肿未富集免疫激活转录本。这种方法提供了对结核病免疫反应的见解，并强调了空间分辨转录组学在研究宿主-病原体相互作用方面的能力。在论文 II 中，我们研究了非小细胞肺癌 (NSCLC) 中的肿瘤微环境，重点研究了 T 细胞克隆性的影响。我们将 TCR 克隆性与基因突变、肿瘤免疫特征和对免疫疗法的反应联系起来。我们的数据显示，高 TCR 克隆性与高肿瘤突变负担、发炎的肿瘤表型以及对检查点抑制剂的反应改善有关，这表明其有可能成为 NSCLC 个性化免疫治疗的生物标志物。在论文 III 中，我们在空间上探索了新辅助治疗期间选定的 NSCLC 组织中的 TCR 模式和免疫细胞分布，这些组织具有匹配的未受影响的淋巴结，以及 HER2+ 乳腺癌病例。我们注意到，与匹配的淋巴结相比，癌症组织中的 TCR 多样性较低。我们的数据进一步揭示了扩增克隆型（主要是 CD8 T 细胞）的区域优势，这些克隆型位于靠近癌症区。总体而言，这些结果证明了 ISS 在提供诊断组织样本中肿瘤免疫微环境中克隆 T 细胞扩增之间相互作用的关键空间细节方面的实用性，特别是在治疗环境中。在论文 IV 中，我们开发了一种基于分子倒置探针 (MIP) 的经济高效的检测血液样本中微生物病原体和抗菌素耐药性标志物的检测方法，即使在资源匮乏的环境中也能提供高特异性和灵敏度。MIP 方法简化了病原体检测，无需进行大量的样品制备或生物信息学分析，使其成为资源匮乏地区监测传染病的便捷工具。总的来说，这项工作展示了挂锁探针和先进技术的应用，以加深我们对疾病的了解并改善诊断和个性化治疗。
使用银盐的DNA探针结构。 2。单体和单链DNA
简介。所得的涂漆金属复合物[1]包括具有炸弹 - 形式LOI NC5HI 3 04的低聚乙醇醛醛链，形成与银离子的协调连接。溶液中络合物的颜色的形成（从紫色到咀嚼的奥拉努斯）取决于与kg相关的基本肾脏的数量，紫色的颜色对应于一个协调键，橙色 - 雷德 - 雷德 - 红色 - 从4到6个相似的连接。寡聚链的形成 - 运动金属的主要成分 - 一个相当复杂的过程，显然是两倍指标，具体取决于溶液的pH和乙醇胺的比例:: formaldeydeyde。在其他启动中心的孵化环境中的存在，这些中心是自由氨基的，它们是DNA碱基的非群落中的存在，在启动乙醇胺甲醛层链形成时引入了不确定性，以及在已经形成的链链的阶段或分支的阶段。此外，甲醛的凝结（显然，在访问基本组方面）也可以以二极管的形式表现出来[2]，该形式能够调整我们在[1]中提出的链电路。因此，在开发获得彩绘dnason的最佳状态的一般背景下，我们专门研究了金属络合物组件与其霸道的相互作用的问题。另外，该作品在建立染色的探针方面都呈现了单个包裹的DNA的结果，具体取决于Basia Incle的各种条件，并选择所需的DNZZOND修改水平。材料和方法。1，2）或在0.03 M硼酸缓冲液，pH 8.5（图在“ Silufol UV254”板上的初始和修饰腺嘌呤的色谱法是用军事缓冲液的引用为0.1 m na，pH 7.5（图>在“ Silufol UV254”板上的初始和修饰腺嘌呤的色谱法是用军事缓冲液的引用为0.1 m na，pH 7.5（图4）。所施加的材料的量为1-2μg。在FN1纸（德国）上色谱法期间，它们还使用了0.03 m的浮雕缓冲液。对于颜色绘画，色谱图在干燥后用氮气扇形浸渍在同一缓冲液中的浓度为0.5 mg/ml。在VII1 Chemisk的反射UFSTE ULTRA中，在薄膜“ Mikhitiso Pan”上对板的摄影登记进行了。纸色谱图上荧光斑点W6i'iiggullt *a v'ut *i *w o div>
估算剪切探针耗散率的最佳实践建议
4 GEOMAR 亥姆霍兹基尔海洋研究中心，德国基尔，5 莱布尼茨波罗的海研究所瓦尔内明德，德国罗斯托克，6 日本海洋地球科学技术振兴机构全球变化研究所 (RIGC)，日本横须贺，7 日本海洋地球科学技术振兴机构全球海洋观测研究中心 (GOORC)，日本横须贺，8 日本海洋地球科学技术振兴机构全球海洋环境研究组，日本横须贺，9 加利福尼亚大学圣地亚哥分校斯克里普斯海洋研究所，美国加利福尼亚州圣地亚哥，10 南大洋碳气候观测站 (SOCCO)，科学与工业研究理事会，南非开普敦，11 德克萨斯大学奥登计算工程与科学研究所，美国德克萨斯州奥斯汀，12 国家水与大气研究所，新西兰惠灵顿， 13 奥克兰大学物理系，新西兰奥克兰
对硒扩散和钝化太阳能电池中硒扩散和钝化的定量评估
在CDSETE/CDTE太阳能电池中引入硒已导致归因于散装缺陷的钝化的设备性能。在这项工作中，对具有不同SE浓度的一系列CDSETE/CDTE薄膜进行高分辨率的阴极发光实验，以量化SE的机理和钝化作用。我们证明了SE浓度和辐射效率之间的普遍依赖性，以及CDTE和CDSE 0.4 TE 0.6之间发光的10倍。原始的发光图被转换为SE浓度的地图，揭示了其在堆栈中的分级轮廓。我们证明了SE沿氯化镉退火处理引起的CDTE晶界的扩散并确定扩散系数，在晶界，在晶界的扩散系数是晶粒内部的八倍以上。这些结果为SE分布及其对CDSETE/CDTE太阳能电池的钝化的影响提供了微观见解。
不同材料中锂的定量电子探针微分析
pia.schweizer@cea.fr电子探针微分析（EPMA）是一种可靠且广泛使用的技术，可用于对科学和工业应用进行非破坏性，准确的材料表征。尽管对锂具有极大的兴趣（LI），并且迫切需要在微米级进行准确的非破坏性分析，但使用EPMA对LI的LI量化尚未成功进行。最近开发的周期性多层允许围绕特征性的li k发射〜50 eV [1]的能量范围的光谱，但是配备有弯曲的晶体光谱仪和标准商业化多层的微型探针检测和定量没有衍射光栅仍然具有挑战性。LI检测的困难是由不同的因素引起的：LI的荧光产量极低，很少有Li 1S核心孔的衰减产生的特征光子，有利于螺旋电子的发射。由于其低能量，光子甚至在离开样品及其最终涂层之前就被强烈吸收。因此，信号主要来自可能受到污染的薄表面层，并且可能对电子轰击敏感。微探针成分，尤其是通过分离窗口的进一步吸收光子，将降低测得的强度。由于Li K发射（2p - 1s转变）涉及价电子，因此Li发射带的形状高度依赖于价带中的状态密度（DOS），并且高度依赖于锂原子的化学状态。SCI。 2021，11，6385。 2022，51（4），403。SCI。2021，11，6385。2022，51（4），403。某些EV和强峰形变化的化学位移可能会发生，对于光元的EPMA应该是预期的[2,3]，使定量分析变得复杂。这项工作显示了不同材料中LI定量EPMA的一些有希望的结果，包括电池化合物和LI浓度降至2％的金属合金。在整合新检测系统以及使用适用于低压EPMA的实际标准和校正程序进行定量程序之后，这是可能的。即使需要进行额外的调查，研究人员的锂表征也引起了极大的兴趣。我们表明，即使EPMA包含在重矩阵中，EPMA是对LI进行定量分析的强大工具，其元素显示出与LI相同的光谱范围内的特征发射带。这种新颖的LI量化方法比使用SEM或配备了多层光栅的ENER或电子微探针检测到其他技术更容易访问，并且比检测更便宜。[1] Polkonikov，V.，Chkhalo，N.，Pleshkov，R.，Giglia，A.，Rividi，N.，Brackx，E.，Le Guen，K.[2] Schweizer，P.，Brackx，E.，Jonnard，P。，X射线光谱。[3] Hassebi，K.，Le Guen，K.，Rividi，N.，Verlaguet，A.，Jonnard，P.，X-Ray Spectrom。（http://doi.org/10.1002/xrs.3329）在印刷中。
重新利用的肌萎缩性侧向硬化药物成为成像探针，以帮助诊断神经变性
正电子发射断层扫描（PET）是一种用于诊断癌症等疾病的核成像技术。来自圣裘德儿童研究医院科学家的创新进步正在增强该技术检查神经疾病迹象的能力。研究人员将药物Edaravone的重新定位为一种用于治疗肌萎缩性侧索硬化症（ALS）的抗氧化剂，作为与中枢神经系统宠物成像一起使用的探针。
定量磁共振学指标与疾病的严重程度和原发性硬化性胆管炎患者的结局有关
在过去的几年中，已使用两种主要方法来研究Fe 2+的分布和局部协调环境和固体中的Fe 3+离子在微米或亚微米计尺度上：（1）X射线吸收光谱（XAS）与同步型光源（尤其是第二个和第三代能量的启发）（尤其是较高的能量射击量和高量）（尤其是较高的能量范围）（2001）和（2）具有透射电子显微镜的电子能量损失光谱（EEL）（在纳米尺度上提供高空间分辨率）（Van Aken等人。1998，1999）。 For XAS and EELS, the methodology consists first of probing the absorption jump on either side of the Fe- K edge [1s → con- duction band (CB) electronic transitions], or the Fe- L 2,3 edge (2p → CB), or the Fe- M 2,3 edge (3p → CB), and then of processing the experimental absorption to extract the information from both Fe 2+ and Fe 3+ components. 铁表现出未填充的3D状态（3d 51998，1999）。For XAS and EELS, the methodology consists first of probing the absorption jump on either side of the Fe- K edge [1s → con- duction band (CB) electronic transitions], or the Fe- L 2,3 edge (2p → CB), or the Fe- M 2,3 edge (3p → CB), and then of processing the experimental absorption to extract the information from both Fe 2+ and Fe 3+ components.铁表现出未填充的3D状态（3d 5
预言与广泛的CRISPR – CAS ...
抽象的黑暗时代和宇宙黎明在婴儿宇宙上基本上是未开发的窗户（Z〜200 - 10）。对中性氢的红移21厘米线的观察可以为这些时代的基本物理和天体物理学提供宝贵的新见解，而其他探针无法提供，并驱动了许多未来基于地面的仪器，例如平方英里阵列（SKA）（SKA）和水直射阵列（Hydro-gen）。我们回顾了高红移21-CM宇宙学领域的进度，特别是通过探测z> 30的黑暗年龄来解决哪些问题。我们得出的结论是，只有一个基于空间或月球的射电望远镜，该望远镜与地球的射频干扰（RFI）信号及其电离层相比，可以检测到来自黑暗时代的21 cm信号。我们建议一个通用的任务设计概念Codex，它将在未来几十年中实现这一目标。