摘要:在整个生命周期中,马养殖动物都在水中耕种,其中包含与它们密切关联的各种微生物。动物与周围水之间的微生物交换。然而,关于虾幼虫与水之间的相互作用,尤其是关于跨个体发育的幼虫细菌选择和微生物群模构的相互作用。使用针对16S rRNA分子的V4区域的HISEQ测序来解决这一差距,我们研究了健康的Penaeus stylirostris幼虫和海水的活性实质性多样性和结构。在不同的幼虫阶段之间的比较揭示了特异性菌群和生物标志物的证据,这是所有阶段常见的核心微生物群,以及连续阶段之间的共享分类单元,表明细菌分类群的垂直传播。比较阶段的微生物群和核心菌群与水矿物的比较强调,许多与幼虫相关的分类单元最初都存在于天然海水中,强调了细菌从水到幼虫的水平传播。由于其中一些谱系在特定的幼虫阶段变得活跃,因此我们建议幼虫能够调节其微生物群。这项研究提供了对幼虫阶段尺度上幼虫 - 微生物群相互作用的见解。
1 美国宾夕法尼亚州费城宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院系统药理学和转化治疗学系,2 美国宾夕法尼亚州费城宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院遗传学系,3 斯洛文尼亚卢布尔雅那斯洛文尼亚科学与艺术学院研究中心 Jovan Hadzˇi 生物研究所,4 美国宾夕法尼亚州费城宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院转化医学与治疗学研究所,5 美国宾夕法尼亚州费城宾夕法尼亚大学基因组学与计算生物学研究生组,6 美国纽约州纽约美国自然历史博物馆无脊椎动物学分部和萨克勒比较基因组学研究所,7 美国佛蒙特大学生物系,伯灵顿佛蒙特州,8 卢布尔雅那国家生物研究所生物与生态系统研究系,斯洛文尼亚,9 冰岛雷克雅未克大学生命与环境科学学院
